Glycolysis
v1	G6P (abcdef) ↔ F6P (abcdef)
v2	F6P (abcdef) + ATP → FBP (abcdef)
v3	FBP (abcdef) ↔ DHAP (cba) + GAP (def)
v4	DHAP (abc) ↔ GAP (abc)
v5	GAP (abc) ↔ 3PG (abc) + ATP + NADH
v6	3PG (abc) ↔ PEP (abc)
v7	PEP (abc) → Pyr (abc) + ATP
Pentose Phosphate Pathway
v8	G6P (abcdef) → 6PG (abcdef) + NADPH
v9	6PG (abcdef) → Ru5P (bcdef) + CO2 (a) + NADPH
v10	Ru5P (abcde) ↔ X5P (abcde)
v11	Ru5P (abcde) ↔ R5P (abcde)
v12	X5P (abcde) ↔ TK-C2 (ab) + GAP (cde)
v13	F6P (abcdef) ↔ TK-C2 (ab) + E4P (cdef)
v14	S7P (abcdefg) ↔ TK-C2 (ab) + R5P (cdefg)
v15	F6P (abcdef) ↔ TA-C3 (abc) + GAP (def)
v16	S7P (abcdefg) ↔ TA-C3 (abc) + E4P (defg)
Entner-Doudoroff Pathway
v17	6PG (abcdef) → KDPG (abcdef)
v18	KDPG (abcdef) → Pyr (abc) + GAP (def)
TCA Cycle
v19	Pyr (abc) → AcCoA (bc) + CO2 (a) + NADH
v20	OAC (abcd) + AcCoA (ef) → Cit (dcbfea)
v21	Cit (abcdef) ↔ ICit (abcdef)
v22	ICit (abcdef) ↔ AKG (abcde) + CO2 (f) + NADPH
v23	AKG (abcde) → SucCoA (bcde) + CO2 (a) + NADH
v24	SucCoA (abcd) ↔ Suc (½ abcd + ½ dcba) + ATP
v25	Suc (½ abcd + ½ dcba) ↔ Fum (½ abcd + ½ dcba) + FADH2
v26	Fum (½ abcd + ½ dcba) ↔ Mal (abcd)
v27	Mal (abcd) ↔ OAC (abcd) + NADH
Amphibolic Reactions
v28	Mal (abcd) → Pyr (abc) + CO2 (d) + NADPH
v29	Mal (abcd) → Pyr (abc) + CO2 (d) + NADH
v30	PEP (abc) + CO2 (d) → OAC (abcd)
v31	OAC (abcd) + ATP → PEP (abc) + CO2 (d)
Acetic Acid Formation
v32	AcCoA (ab) ↔ Ac (ab) + ATP
PDO Biosynthesis
v33	DHAP (abc) + NADH ↔ Glyc3P (abc)
v34	Glyc3P (abc) → Glyc (abc)
v35	Glyc (abc) → HPA (abc)
v36	HPA (abc) + NADPH → PDO (abc)
Amino Acid Biosynthesis
v37	AKG (abcde) + NADPH + NH3 → Glu (abcde)
v38	Glu (abcde) + ATP + NH3 → Gln (abcde)
v39	Glu (abcde) + ATP + 2 NADPH → Pro (abcde)
v40	Glu (abcde) + CO2 (f) + Gln (ghijk) + Asp (lmno) + AcCoA (pq) + 5 ATP + NADPH → Arg (abcdef) + AKG (ghijk) + Fum (lmno) + Ac (pq)
v41	OAC (abcd) + Glu (efghi) → Asp (abcd) + AKG (efghi)
v42	Asp (abcd) + 2 ATP + NH3 → Asn (abcd)
v43	Pyr (abc) + Glu (defgh) → Ala (abc) + AKG (defgh)
v44	3PG (abc) + Glu (defgh) → Ser (abc) + AKG (defgh) + NADH
v45	Ser (abc) ↔ Gly (ab) + MEETHF (c)
v46	Gly (ab) ↔ CO2 (a) + MEETHF (b) + NADH + NH3
v47	Thr (abcd) → Gly (ab) + AcCoA (cd) + NADH
v48	Ser (abc) + AcCoA (de) + 3 ATP + 4 NADPH + SO4 → Cys (abc) + Ac (de)
v49	Asp (abcd) + Pyr (efg) + Glu (hijkl) + SucCoA (mnop) + ATP + 2 NADPH → LL-DAP (abcdgfe) + AKG (hijkl) + Suc (½ mnop + ½ ponm)
v50	LL-DAP (abcdefg) → Lys (abcdef) + CO2 (g)
v51	Asp (abcd) + 2 ATP + 2 NADPH → Thr (abcd)
v52	Asp (abcd) + METHF (e) + Cys (fgh) + SucCoA (ijkl) + ATP + 2 NADPH → Met (abcde) + Pyr (fgh) + Suc (½ ijkl + ½ lkji) + NH3
v53	Pyr (abc) + Pyr (def) + Glu (ghijk) + NADPH → Val (abcef) + CO2 (d) + AKG (ghijk)
v54	AcCoA (ab) + Pyr (cde) + Pyr (fgh) + Glu (ijklm) + NADPH → Leu (abdghe) + CO2 (c) + CO2 (f) + AKG (ijklm) + NADH
v55	Thr (abcd) + Pyr (efg) + Glu (hijkl) + NADPH → Ile (abfcdg) + CO2 (e) + AKG (hijkl) + NH3
v56	PEP (abc) + PEP (def) + E4P (ghij) + Glu (klmno) + ATP + NADPH → Phe (abcefghij) + CO2 (d) + AKG (klmno)
v57	PEP (abc) + PEP (def) + E4P (ghij) + Glu (klmno) + ATP + NADPH → Tyr (abcefghij) + CO2 (d) + AKG (klmno) + NADH
v58	Ser (abc) + R5P (defgh) + PEP (ijk) + E4P (lmno) + PEP (pqr) + Gln (stuvw) + 3 ATP + NADPH → Trp (abcedklmnoj) + CO2 (i) + GAP (fgh) + Pyr (pqr) + Glu (stuvw)
v59	R5P (abcde) + FTHF (f) + Gln (ghijk) + Asp (lmno) + 5 ATP → His (edcbaf) + AKG (ghijk) + Fum (lmno) + 2 NADH
One-Carbon Metabolism
v60	MEETHF (a) + NADH → METHF (a)
v61	MEETHF (a) → FTHF (a) + NADPH
Oxidative Phosphorylation
v62	NADH + ½ O2 → 3 ATP
v63	FADH2 + ½ O2 → 2 ATP
Transhydrogenation
v64	NADH ↔ NADPH
ATP Hydrolysis
v65	ATP → ATP:ext
Transport
v66	Gluc.ext (abcdef) + ATP → G6P (abcdef)
v67	Cit.ext (abcdef) → Cit (abcdef)
v68	Glyc (abc) ↔ Glyc.ext (abc)
v69	PDO (abc) → PDO.ext (abc)
v70	Ac (ab) → Ac.ext (ab)
v71	CO2 (a) → CO2.ext (a)
v72	O2.ext → O2
v73	NH3.ext → NH3
v74	SO4.ext → SO4
Biomass Formation
v75	0.488 Ala + 0.281 Arg + 0.229 Asn + 0.229 Asp + 0.087 Cys + 0.250 Glu + 0.250 Gln + 0.582 Gly + 0.090 His + 0.276 Ile + 0.428 Leu + 0.326 Lys + 0.146 Met + 0.176 Phe + 0.210 Pro + 0.205 Ser + 0.241 Thr + 0.054 Trp + 0.131 Tyr + 0.402 Val + 0.205 G6P + 0.071 F6P + 0.754 R5P + 0.129 GAP + 0.619 3PG + 0.051 PEP + 0.083 Pyr + 2.510 AcCoA + 0.087 AKG + 0.340 OAC + 0.443 MEETHF + 33.247 ATP + 5.363 NADPH → 39.68 Biomass + 1.455 NADH