TABLE 2.
H chain CDRsa
| Clone | CDR1 | CDR2 | CDR3 | J | Isotype |
|---|---|---|---|---|---|
| IGHV1-18 | SYGIS | WISAYNGNTNYAQKLQG | |||
| 11A11 | NF--T | Y-------A-------- | DRGSRWFGEFPDEYYFDY | JH4 | IgG1 |
| IGHV1-46 | SYYMH | IINPSGGSTSYAQKFQG | |||
| 4A12 | S-FV- | M---R----N------- | VNWAYGDYDFDY | JH4 | IgG3 |
| IGHV3-15 | NAWMS | RIKSKTDGGTTDYAAPVKG | |||
| 35F7 | D---T | ---R--------------- | DVLGIVIIVGAAH | JH1 | IgG1 |
| 40D10 | K---- | ---R-S------------- | ------------- | JH1 | IgG1 |
| 59H10 | Q-H-- | -M-R-S------------- | --R---------- | JH1 | IgG1 |
| 46D1 | Q-H-- | -M-R-S-------G----- | --R---------- | JH1 | IgG1 |
| 41A3 | Y-S-T | ---R--------------- | --R---------- | JH1 | IgG1 |
| 49F1 | K---T | ---RRS------------- | --------R---Q | JH1 | IgG1 |
| 55C7 | Y-R-- | ---R--E------------ | ------------- | JH1 | IgG1 |
| 52E7 | Y-R-- | ---N-R--E--H------- | ------------- | JH1 | IgG1 |
| 66A5 | K---T | ---R-S----I-------- | --R---------- | JH1 | IgG1 |
| 34E3 | K---T | ---RRS------------- | --------R---Q | JH1 | IgG1 |
| 41C5 | ----T | ---RRS------------- | ------------Q | JH1 | IgG1 |
| 51D6 | ----T | ---RRS------------- | ------------Q | JH1 | IgG1 |
| 53H4 | Q-H-- | -M-R-S-------G----- | --R---------- | JH1 | IgG1 |
| 54C7 | ----- | ---R-S----I----S--- | ------------Q | JH1 | IgA1 |
| 56F6 | K---T | ---RRS------------- | --------R---Q | JH1 | IgG1 |
| 65A8 | ----T | ---RRS------------- | ------------Q | JH1 | IgG1 |
| 65H8 | ----- | ---R-S----I----S--- | ------------Q | JH1 | IgG1 |
| 65G8 | D---T | ---R-S------------- | -T----R------ | JH1 | IgG1 |
| 66B2 | ----T | ---RRS------------- | ------------Q | JH1 | IgG1 |
| IGHV 3-30 | SYGMH | VISYDGSNKYYADSVKG | |||
| 17D2 | R---- | ------GD-K-V----- | WDYVWESYRGKAFDI | JH3 | IgG1 |
| 65A3 | --A-- | L-----NT--------- | LISYDGNTKYYADSVKG | JH6 | IgG1 |
| 47F12 | --T-- | L-----T--N-G---T- | ARVIVPAGSNYNQYGMDV | JH6 | IgG1 |
| 59G5 | --T-- | L-----T--N-G---T- | ARVIVPAGSNYNQYGMDV | JH6 | IgG1 |
| IGHV 3-33 | SYGMH | VIWYDGSNKYYADSVKG | |||
| 8H2 | DF--- | L--N---K--------- | WGYYYGSGSPPEY | JH4 | IgG1 |
| 19E1 | DF--- | L--N---K--------- | WGYYYGSGSPPEY | JH4 | IgG1 |
| 41F12 | T---- | ---F------------- | EDGSYHQGPFDY | JH4 | IgG1 |
| 55F9 | T---- | ---F------------- | EDGSYHQGPFDY | JH4 | IgG1 |
| IGHV 3-43 | DYTMH | LISWDGGSTYYADSVKG | |||
| 20C7 | ----- | --T----R-F--N---- | GPNRRDSFGLHYYGLDV | JH6 | IgG1 |
| IGHV 3-74 | SYWMH | RINSDGSSTSYADSVKG | |||
| 51C5 | R-Y-- | R--N------------- | EGRPMGLGTSVGMN | JH4 | IgG1 |
| IGHV 4-59 | SYYWS | YIYYSGSTNYNPSLKS | |||
| 1A5 | -HF- | ---SG-T---D----- | GDMVTGDPGDY | JH1 | IgG1 |
| 1B10 | -HF- | ---SG-T---D----- | ----------- | JH1 | IgA1 |
| 4B1 | -HF- | ---SG-T---D----- | ----------H | JH1 | IgG1 |
| 13E12 | -HF- | ---SG-T---D----- | ----------- | JH1 | IgG2 |
a
Heavy chain CDR residues and gene usage of PA-specific Fabs. Translation of germ line CDRs shown for comparison.