Table 1.
Isolates of Mycosphaerella used in this study for DNA sequencing and phylogenetic analysis.
| Teleomorph | Anamorph |
Isolate
No.a
|
Host | Country | Collector |
GenBank Accession No.
|
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CMW | CBS | STEU | LSU | ITS | ACT | EF-1a | |||||
| M. africana | Unknown | 3026 | CBS 116155 | 795 | E. viminalis | South Africa | P.W. Crous | DQ246258 | DQ267577 | DQ147608 | DQ235098 |
| 4945 | CBS 116154 | 794 | E. viminalis | South Africa | P.W. Crous | DQ246257 | AF309602 | DQ147609 | DQ235099 | ||
| M. ambiphylla | Phaeophleospora sp. | 14180 | CBS 110499 | N/A | E. globulus | Australia | A. Maxwell | DQ246219 | AY725530 | DQ147669 | DQ235103 |
| M. aurantia | Unknown | 14460 | CBS 110500 | N/A | E. globulus | Australia | A. Maxwell | DQ246256 | AY725531 | DQ147610 | DQ235097 |
| M. colombiensis | Pseudocercospora colombiensis | 4944 | CBS 110969 | 1106 | E. urophylla | Colombia | M.J. Wingfield | DQ204744 | AY752149 | DQ147639 | DQ211660 |
| 11255 | CBS 110967 | 1104 | E. urophylla | Colombia | M.J. Wingfield | DQ204745 | AY752147 | DQ147640 | DQ211661 | ||
| M. communis | Dissoconium commune | 14672 | CBS 114238 | 10440 | E. globulus | Spain | J.P. Mansilla | DQ246262 | AY725541 | DQ147655 | DQ235141 |
| 14673 | CBS 110976 | 849 | E. cladocalyx | South Africa | P.W. Crous | DQ246261 | AY725537 | DQ147654 | DQ235140 | ||
| M. cryptica | Colletogloeopsis nubilosum | 3279 | CBS 110975 | 936 | E. globulus | Australia | A.J. Carnegie | DQ246222 | AF309623 | DQ147674 | DQ235119 |
| 2732 | N/A | 355 | Eucalyptus sp. | Chile | M.J. Wingfield | N/A | AF309622 | N/A | N/A | ||
| M. crystallina | Pseudocercospora crystallina | 3042 | N/A | 800 | E. bicostata | South Africa | M.J. Wingfield | DQ204746 | DQ267578 | DQ147637 | DQ211662 |
| 3033 | CBS 681.95 | 802 | E. bicostata | South Africa | M.J. Wingfield | DQ204747 | AY490757 | DQ147636 | DQ211663 | ||
| M. ellipsoidea | Uwebraunia ellipsoidea | 4934 | N/A | 1224 | Eucalyptus sp. | South Africa | Unknown | DQ246253 | AF309592 | DQ147647 | DQ235129 |
| 5166 | N/A | 1225 | Eucalyptus sp. | South Africa | Unknown | DQ246254 | AF309593 | DQ147648 | DQ235127 | ||
| M. endophytica | Pseudocercosporella endophytica | 14912 | CBS 111519 | 1191 | Eucalyptus sp. | South Africa | P.W. Crous | DQ246255 | DQ267579 | DQ147646 | DQ235131 |
| 5225 | N/A | 1192 | Eucalyptus sp. | South Africa | P.W. Crous | DQ246252 | DQ267580 | DQ147649 | DQ235128 | ||
| M. flexuosa | Unknown | 5224 | CBS 111012 | 1109 | E. globulus | Colombia | M.J. Wingfield | DQ246232 | AF309603 | DQ147653 | DQ235126 |
| M. fori | Pseudocercospora sp. | 9095 | N/A | N/A | E. grandis | South Africa | G.C. Hunter | DQ204748 | AF468869 | DQ147618 | DQ211664 |
| 9096 | N/A | N/A | E. grandis | South Africa | G.C. Hunter | DQ204749 | DQ267581 | DQ147619 | DQ211665 | ||
| M. gracilis | Pseudocercospora gracilis | 14455 | CBS 243.94 | 730 | E. urophylla | Indonesia | A.C. Alfenas | DQ204750 | DQ267582 | DQ147616 | DQ211666 |
| M. grandis | Unknown | 8557 | N/A | N/A | E. globulus | Chile | A.Rotella | DQ246241 | DQ267583 | DQ147644 | DQ235108 |
| 8554 | N/A | N/A | E. globulus | Chile | M.J. Wingfield | DQ246240 | DQ267584 | DQ147643 | DQ235107 | ||
| M. gregaria | Unknown | 14462 | CBS 110501 | N/A | E. globulus | Australia | A. Maxwell | DQ246251 | DQ267585 | DQ147650 | DQ235130 |
| M. heimii | Pseudocercospora heimii | 4942 | CBS 110682 | 760 | Eucalyptus sp. | Madagascar | P.W. Crous | DQ204751 | AF309606 | DQ147638 | DQ211667 |
| M. heimioides | Pseudocercospora heimioides | 14776 | CBS 111364 | N/A | Eucalyptus sp. | Indonesia | M.J. Wingfield | DQ204752 | DQ267586 | DQ147632 | DQ211668 |
| 3046 | CBS 111190 | 1312 | Eucalyptus sp. | Indonesia | M.J. Wingfield | DQ204753 | AF309609 | DQ147633 | DQ211669 | ||
| M. intermedia | Unknown | 7163 | CBS 114356 | 10902 | E. saligna | New Zealand | K. Dobbie | DQ246247 | AY725546 | N/A | N/A |
| 7164 | CBS 114415 | 10922 | E. saligna | New Zealand | K. Dobbie | DQ246248 | AY725547 | DQ147627 | DQ235132 | ||
| M. irregulariramosa | Pseudocercospora irregulariramosa | 4943 | CBS 114774 | 1360 | E. saligna | South Africa | M.J. Wingfield | DQ204754 | AF309607 | DQ147634 | DQ211670 |
| 5223 | N/A | 1362 | E. saligna | South Africa | M.J. Wingfield | DQ204755 | AF309608 | DQ147635 | DQ211671 | ||
| M. ohnowa | Unknown | 4937 | CBS 112896 | 1004 | E. grandis | South Africa | M.J. Wingfield | N/A | AF309604 | DQ147662 | DQ235125 |
| 4936 | CBS 112973 | 1005 | E. grandis | South Africa | M.J. Wingfield | DQ246231 | AF309605 | DQ147661 | DQ235124 | ||
| M. keniensis | Unknown | 5147 | CBS 111001 | 1084 | E. grandis | Kenya | T. Coutinho | DQ246259 | AF309601 | DQ147611 | DQ235100 |
| M. lateralis | Dissoconium dekkeri | 14906 | CBS 110748 | 825 | E. grandis × E. saligna | South Africa | G. Kemp | DQ204768 | AF173315 | DQ147651 | DQ211684 |
| 5164 | CBS 111169 | 1232 | E. globulus | Zambia | T. Coutinho | DQ246260 | AY25550 | DQ147652 | DQ235139 | ||
| M. madeirae | Pseudocercospora sp. | 14458 | CBS 112895 | 3745 | E. globulus | Madeira | S. Denman | DQ204756 | AY725553 | DQ147641 | DQ211672 |
| M. marksii | Unknown | 14781 | CBS 682.95 | 842 | E. grandis | South Africa | G. Kemp | DQ246249 | DQ267587 | DQ147624 | DQ235133 |
| 5150 | CBS 110920 | 935 | E. botryoides | Australia | A.J. Carnegie | DQ246250 | AF309588 | DQ147625 | DQ235134 | ||
| 5230 | N/A | 782 | E. botryoides | Australia | A.J. Carnegie | DQ246246 | DQ267588 | DQ147626 | DQ235135 | ||
| M. mexicana | Unknown | 14461 | CBS 110502 | N/A | E. globulus | Australia | A. Maxwell | DQ246237 | AY725558 | DQ147660 | DQ235123 |
| M. readeriellophora | Readeriella readeriellophora | 14233 | CBS 114240 | 10375 | E. globulus | Spain | J.P. Mansilla | DQ246238 | AY725577 | DQ147658 | DQ235117 |
| M. molleriana | Colletogloeopsis molleriana | 4940 | CBS 111164 | 1214 | E. globulus | Portugal | S. McCrae | DQ246220 | AF309620 | DQ147671 | DQ235104 |
| 2734 | CBS 111132 | 784 | E. globulus | U. S. A. | M.J. Wingfield | DQ246223 | AF309619 | DQ147670 | DQ235105 | ||
| M. nubilosa | Uwebraunia juvenis | 3282 | CBS 116005 | 937 | E. globulus | Australia | A.J. Carnegie | DQ246228 | AF309618 | DQ147666 | DQ235111 |
| 9003 | CBS 114708 | N/A | E. nitens | South Africa | G.C. Hunter | DQ246229 | AF449099 | DQ147667 | DQ235112 | ||
| M. parkii | Stenella parkii | 14775 | CBS 387.92 | 353 | E. grandis | Brazil | M.J. Wingfield | DQ246245 | AY626979 | DQ147612 | DQ235137 |
| M. parva | Unknown | 14459 | CBS 110503 | N/A | E. globulus | Australia | A. Maxwell | DQ246243 | AY626980 | DQ147645 | DQ235110 |
| 14917 | CBS 116289 | 10935 | Eucalyptus sp. | South Africa | P.W. Crous | DQ246242 | AY725576 | DQ147642 | DQ235109 | ||
| M. suberosa | Unknown | 5226 | CBS 436.92 | 515 | E. dunnii | Brazil | M.J. Wingfield | DQ246235 | AY626985 | DQ147656 | DQ235101 |
| 7165 | N/A | N/A | E. muelleriana | New Zealand | Unknown | DQ246236 | DQ267589 | DQ147657 | DQ235102 | ||
| M. suttonii | Phaeophleospora epicoccoides | 5348 | N/A | 1346 | Eucalyptus sp. | Indonesia | M.J. Wingfield | DQ246227 | AF309621 | DQ147673 | DQ235116 |
| M. vespa | Colletogloeopsis sp. | 11558 | CBS 117924 | N/A | E. globulus | Tasmania | Unknown | DQ246221 | DQ267590 | DQ147668 | DQ235106 |
| M. tasmaniensis | Passalora tasmaniensis | 14780 | CBS 111687 | 1555 | E. nitens | Tasmania | M.J. Wingfield | DQ246233 | DQ267591 | DQ147676 | DQ235121 |
| 14663 | CBS 114556 | N/A | E. nitens | Tasmania | M.J. Wingfield | DQ246234 | DQ267592 | DQ147677 | DQ235122 | ||
| M. toledana | Phaeophleospora toledana | 14457 | CBS 113313 | N/A | Eucalyptus sp. | Spain | P.W. Crous | DQ246230 | AY725580 | DQ147672 | DQ235120 |
| M. walkerii | Sonderhenia eucalypticola | 20333 | N/A | N/A | E. globulus | Chile | M.J. Wingfield | DQ267574 | DQ267593 | DQ147630 | DQ235095 |
| 20334 | N/A | N/A | E. globulus | Chile | M.J. Wingfield | DQ267575 | DQ267594 | DQ147631 | DQ235096 | ||
| Unknown | Passalora eucalypti | 14907 | CBS 111306 | 1457 | E. saligna | Brazil | P.W. Crous | DQ246244 | AF309617 | DQ147678 | DQ235138 |
| Unknown | Passalora zambiae | 14782 | CBS 112971 | 1227 | E. globulus | Zambia | T. Coutinho | DQ246264 | AF725523 | DQ147675 | DQ235136 |
| Unknown | Pseudocercospora epispermogonia | 14778 | CBS 110750 | 822 | E. grandis × E. saligna | South Africa | G. Kemp | DQ204757 | DQ267596 | DQ147629 | DQ211673 |
| 14786 | CBS 110693 | 823 | E. grandis × E. saligna | South Africa | G. Kemp | DQ204758 | DQ267597 | DQ147628 | DQ211674 | ||
| Unknown | Phaeophleospora eucalypti | 11687 | CBS 113992 | N/A | E. nitens | New Zealand | M. Dick | DQ246225 | DQ267598 | DQ147664 | DQ235115 |
| 14910 | CBS 111692 | 1582 | Eucalyptus sp. | New Zealand | M.J. Wingfield | DQ246224 | DQ267599 | DQ147663 | DQ235114 | ||
| Unknown | Pseudocercospora basitruncata | 14914 | CBS 114664 | 1202 | E. grandis | Colombia | M.J. Wingfield | DQ204759 | DQ267600 | DQ147622 | DQ211675 |
| 14785 | CBS 111280 | 1203 | E. grandis | Colombia | M.J. Wingfield | DQ204760 | DQ267601 | DQ147621 | DQ211676 | ||
| Unknown | Pseudocercospora basiramifera | 5148 | N/A | N/A | E. pellita | Thailand | M.J. Wingfield | DQ204761 | AF309595 | DQ147607 | DQ211677 |
| Unknown | Pseudocercospora eucalyptorum | 5228 | CBS 110777 | 16 | E. nitens | South Africa | P.W. Crous | DQ204762 | AF309598 | DQ147614 | DQ211678 |
| Unknown | Pseudocercospora natalensis | 14777 | CBS 111069 | 1263 | E. nitens | South Africa | T. Coutinho | DQ267576 | N/A | DQ147620 | N/A |
| 14784 | CBS 111070 | 1264 | E. nitens | South Africa | T. Coutinho | DQ204763 | AF309594 | DQ147623 | DQ211679 | ||
| Unknown | Pseudocercospora paraguayensis | 14779 | CBS 111286 | 1459 | E. nitens | Brazil | P.W. Crous | DQ204764 | DQ267602 | DQ147606 | DQ211680 |
| Unknown | Pseudocercospora pseudoeucalyptorum | 14908 | CBS 114242 | 10390 | E. globulus | Spain | J.P. Mansilla | DQ204765 | AY725526 | DQ147613 | DQ211681 |
| 14911 | CBS 114243 | 10500 | E. nitens | New Zealand | W. Gams | DQ204766 | AY725527 | DQ147615 | DQ211682 | ||
| Unknown | Pseudocercospora robusta | 5151 | CBS 111175 | 1269 | E. robusta | Malaysia | M.J. Wingfield | DQ204767 | AF309597 | DQ147617 | DQ211683 |
| Unknown | Readeriella novaezelandiae | 14913 | CBS 114357 | 10895 | E. botryoides | New Zealand | M.A. Dick | DQ246239 | DQ267603 | DQ147659 | DQ235118 |
| Botryosphaeria ribis | Fusicoccum ribis | 7773 | N/A | N/A | Ribus sp. | U. S. A. | G. Hudler. | DQ246263 | DQ267604 | DQ267605 | DQ235142 |
a
CMW: Culture collection of the Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, South Africa.
CBS: Centraalbureau voor Schimmelcultures, Utrecht, The Netherlands.
STEU: Culture collection of Stellenbosch University, South Africa. Isolate numbers from Crous (1998).
N/A: Not available