Table 1.
Strains used in phylogenetic analysis, their origin and GenBank numbers.
| Strain1 | Species | Geography |
GenBank
|
|||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ITS 1+2 | act | cal | tef1 | |||
| G.J.S. 02-134 | T. atroviride | Sri Lanka | DQ315466 | DQ307547 | ||
| G.J.S. 02-135 | T. atroviride | Sri Lanka | DQ315467 | DQ307548 | ||
| G.J.S. 02-139 | T. atroviride | Sri Lanka | DQ315463 | DQ307546 | ||
| G.J.S. 02-96 | T. atroviride | Sri Lanka | DQ315469 | DQ307550 | ||
| G.J.S. 98-8 | T. atroviride | France | DQ315462 | DQ307545 | ||
| C.T.R. 85-57 | T. austrokoningii | U.S.A. (FL) | DQ315469 | DQ333551 | DQ379003 | DQ307564 |
| CBS 247.63 | T. austrokoningii | New Zealand | DQ315470 | DQ341183 | DQ381953 | DQ307568 |
| G.J.S. 00-73 | T. austrokoningii | Russia | DQ315465 | DQ341177 | DQ379006 | DQ307569 |
| G.J.S. 96-163 | T. austrokoningii | Taiwan | DQ323408 | DQ367709 | DQ378997 | DQ307565 |
| G.J.S. 99-146 | T. austrokoningii (T) | Australia (QL) | DQ323423 | DQ367716 | DQ379001 | DQ307561 |
| G.J.S. 99-147 | T. austrokoningii | Australia (QL) | DQ323422 | DQ333569 | DQ379000 | DQ307562 |
| G.J.S. 99-116 | T. austrokoningii | New Zealand | DQ333546 | DQ379011 | DQ379004 | |
| G.J.S. 97-3 | T. caribbaeum (T) | Guadeloupe | DQ313131 | DQ328607 | DQ367688 | DQ284977 |
| G.J.S. 98-43 | T. caribbaeum | Puerto Rico | DQ313139 | DQ328606 | DQ367673 | DQ284976 |
| DIS 320c | T. caribbaeum var. aeqatoriale (T) | Ecuador | DQ323436 | DQ328610 | DQ367704 | DQ289010 |
| G.J.S. 02-87 | PS E | Sri Lanka | DQ315461 | DQ307544 | ||
| G.J.S. 02-50 | T. dingleyae (T) | New Zealand | DQ333548 | DQ367718 | DQ370461 | DQ284978 |
| G.J.S. 99-105 | T. dingleyae | New Zealand | DQ313151 | DQ378998 | AF348117 | |
| DQ289008 | ||||||
| G.J.S. 99-203 | T. dingleyae | New Zealand | AY380899 | AY376674 | DQ367666 | AF348111, AY376040 |
| G.J.S. 99-194 | T. dorotheae | Australia (VI) | DQ313136 | DQ328602 | DQ367674 | DQ284974 |
| G.J.S. 99-202 | T. dorotheae (T) | New Zealand | DQ313144 | DQ323454 | DQ367706 | DQ307536 |
| G.J.S. 99-97 | T. dorotheae | New Zealand | DQ333547 | DQ379009 | DQ288990 | |
| DIS 7 | T. erinaceus | Peru | DQ109534 | DQ111968 | DQ122162 | DQ109547 |
| DIS 8 | T. erinaceus | Peru | DQ313147 | DQ323450 | DQ384930 | DQ284970 |
| G.J.S. 96-13 | T. intricatum | Puerto Rico | DQ381955 | AY376683 | DQ367679 | AY376059 |
| G.J.S. 97-88 | T. intricatum (T) | Thailand | AY380913 | AY376684 | DQ367680 | AY376060 |
| ATCC 64262 | T. koningii | Hungary | AY380903 | AY376679 | DQ367671 | AY376046 |
| DAOM 167645 = CBS 979.70 | T. koningii | Netherlands | DQ323410 | DQ379007 | DQ367682 | DQ288994 |
| G.J.S. 00-156 | T. koningii | U.S.A. (PA) | DQ323433 | DQ379010 | DQ288991 | |
| G.J.S. 00-168 | T. koningii | U.S.A. (?MD) | DQ323427 | DQ333562 | DQ307571 | |
| G.J.S. 89-122 = CBS 989.97 = IMI 378801 | T. koningii (T of H. koningii) | U.S.A. (MD) | AY380902 | AY376678 | DQ367693 | AY376045 |
| G.J.S. 90-18 = CBS 988.97 | T. koningii | U.S.A. (WI) | DQ323409 | DQ341181 | DQ370463 | DQ289007 |
| G.J.S. 92-18 = CBS 987.97 | T. koningii | Canada | DQ323435 | DQ367712 | DQ370458 | DQ289005 |
| G.J.S. 96-118 | T. koningii | Netherlands | DQ323444 | DQ341178 | DQ367683 | DQ288996 |
| CBS 458.96 | ||||||
| G.J.S. 96-119 | T. koningii | Netherlands | DQ323424 | DQ341179 | DQ367681 | DQ289003 |
| CBS 460.96 | ||||||
| G.J.S. 96-120 | T. koningii | Netherlands | DQ109536 | DQ111972 | DQ122168 | DQ109548 |
| CBS 459.96 | ||||||
| G.J.S. 96-117 | T. koningii (neotype) | Netherlands | Z79628 | DQ341180 | DQ367686 | AF456909 |
| CBS 457.96 | ||||||
| DAOM 222105 | T. koningiopsis | Canada (ON) | DQ313146 | DQ379012 | DQ367668 | AY376042 |
| DIS 172ai = CBS 119067 = IMI 385811 | T. koningiopsis | Brazil | DQ313138 | DQ323453 | DQ367675 | DQ284972 |
| DIS 205f = CBS 119068 = IMI 385805 | T. koningiopsis | Ecuador | DQ323419 | DQ328609 | DQ367698 | DQ288993 |
| DIS 229d = CBS 119069 = IMI 391590 | T. koningiopsis | Ecuador | DQ313143 | DQ323452 | DQ367676 | DQ284971 |
| DIS 326h = CBS 119070 = IMI 393639 | T. koningiopsis | Ecuador | DQ379015 | DQ379008 | DQ367695 | DQ288997 |
| DIS 339c = CBS 119065 = IMI 391591 | T. koningiopsis | Ecuador | DQ313142 | DQ323447 | DQ367677 | DQ284968 |
| DIS 94c = CBS 119066 = IMI 391592 | T. koningiopsis | Peru | DQ313130 | DQ379014 | DQ367678 | DQ284967 |
| G.J.S. 01-07 | T. koningiopsis | Ecuador | DQ313132 | AY376676 | DQ367669 | AY376043 |
| G.J.S. 01-08 | T. koningiopsis | Ecuador | — | — | — | — |
| G.J.S. 01-09 | T. koningiopsis | Ecuador | — | — | — | — |
| G.J.S. 01-10 | T. koningiopsis | Ecuador | — | — | — | — |
| G.J.S. 01-11 | T. koningiopsis | Ecuador | — | — | — | — |
| G.J.S. 01-12 | T. koningiopsis | Ecuador | — | — | — | — |
| G.J.S. 04-10 | T. koningiopsis | Texas | DQ323413 | DQ341184 | DQ367692 | DQ284981 |
| G.J.S. 04-11 | T. koningiopsis | Texas | DQ323421 | DQ341182 | DQ367687 | DQ289009 |
| G.J.S. 04-373 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323437 | DQ367713 | DQ367703 | DQ289006 |
| G.J.S. 04-379 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323439 | DQ367719 | DQ367702 | DQ289001 |
| G.J.S. 04-378 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323432 | DQ367714 | DQ367699 | DQ289011 |
| G.J.S. 04-375 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323411 | DQ367711 | DQ367697 | DQ288989 |
| G.J.S. 04-376 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323425 | DQ341176 | DQ367696 | DQ288992 |
| G.J.S. 04-377 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323416 | DQ333552 | DQ367701 | DQ289002 |
| G.J.S. 04-374 | T. koningiopsis | Brazil | DQ323412 | DQ367709 | DQ367700 | DQ288995 |
| G.J.S. 91-6 | T. koningiopsis | Brazil | DQ313135 | DQ323446 | DQ367705 | DQ307539 |
| G.J.S. 91-7 | T. koningiopsis | Brazil | DQ313137 | DQ323449 | DQ367689 | DQ284969 |
| G.J.S. 95-175 | T. koningiopsis | U.S.A. (KY) | AF456923 | DQ323448 | DQ367707 | AF456910 |
| G.J.S. 96-47 | T. koningiopsis | Puerto Rico | DQ313133 | AY376677 | DQ367670 | AY376044 |
| G.J.S. 93-20 | T. koningiopsis (T) | Cuba | DQ313140 | DQ381954 | DQ367694 | DQ284966 |
| G.J.S. 97-273 = BBA 65450 | T. koningiopsis | Germany | DQ109537 | DQ111973 | DQ122169 | DQ109549 |
| DIS 172h | T. ovalisporum | Brazil | AY380896 | AY376670 | DQ122167 | AY387660 |
| DIS 172i | T. ovalisporum | Brazil | DQ323438 | DQ328611 | — | DQ288999 |
| DIS 203c | T. ovalisporum | Brazil | DQ315458 | DQ328608 | DQ378996 | DQ307540 |
| DIS 70a | T. ovalisporum (T) | Ecuador | AY380897 | AY376671 | DQ379005 | AY376037 |
| DAOM 165782 | T. petersenii | U.S.A. (NC) | DQ313149 | DQ328604 | DQ367690 | DQ289000 |
| G.J.S. 04-164 | T. petersenii | U.S.A. (TN) | DQ323442 | DQ333566 | DQ367684 | DQ289004 |
| G.J.S. 04-351 | T. petersenii | U.S.A. (TN) | DQ323440 | DQ333568 | — | DQ284979 |
| G.J.S. 04-355 | T. petersenii (T) | U.S.A. (TN) | DQ323441 | DQ333570 | DQ367691 | DQ284980 |
| G.J.S. 90-86 | T. petersenii | U.S.A. (NC) | DQ313153 | DQ328605 | DQ367708 | DQ284975 |
| G.J.S. 91-99 | T. petersenii | U.S.A. (VA) | DQ313134 | AY376673 | — | AY376039 |
| G.J.S. 98-139 | T. petersenii | France | DQ323426 | DQ379013 | DQ378999 | DQ288998 |
| G.J.S. 98-140 | T. petersenii | France | DQ313148 | AY376675 | DQ367667 | AY376041 |
| G.J.S. 99-48 | T. petersenii | Costa Rica | AY380898 | AY376672 | DQ367665 | AY376038 |
| G.J.S. 04-157 | T. rogersonii | U.S.A. (TN) | DQ323415 | DQ333565 | DQ370454 | DQ307558 |
| G.J.S. 04-158 | T. rogersonii (T) | U.S.A. (TN) | DQ323434 | DQ333567 | DQ370460 | DQ307563 |
| G.J.S. 90-108 | T. rogersonii | U.S.A. (MD) | DQ333550 | DQ333561 | DQ370448 | DQ307570 |
| G.J.S. 90-125 | T. rogersonii | U.S.A. (NC) | DQ323417 | DQ341175 | DQ370453 | DQ307567 |
| G.J.S. 90-78 | T. rogersonii | U.S.A. (NC) | DQ333549 | DQ333558 | DQ370457 | DQ307556 |
| G.J.S. 90-79 | T. rogersonii | U.S.A. (NC) | DQ381956 | DQ333563 | DQ370451 | DQ381959 |
| G.J.S. 90-93 | T. rogersonii | U.S.A. (NC) | DQ313154 | DQ333560 | DQ370450 | DQ307559 |
| G.J.S. 92-116 | T. rogersonii | U.S.A. (MD) | DQ313150 | DQ333554 | DQ370455 | DQ307557 |
| G.J.S. 94-115 | T. rogersonii | U.S.A. (MO) | Z95927 | DQ333555 | DQ370452 | AF456906 |
| G.J.S. 95-217 | T. rogersonii | Austria | DQ323445 | DQ333553 | DQ370462 | DQ307566 |
| G.J.S. 98-75 | T. rogersonii | U.S.A. (NJ) | DQ323443 | DQ333556 | DQ370449 | DQ307560 |
| G.J.S. 98-77 | T. rogersonii | U.S.A. (NJ) | DQ323414 | DQ333559 | DQ307572 | |
| G.J.S. 98-82 | T. rogersonii | U.S.A. (NJ) | AY380910 | AY376682 | DQ367672 | AY376055 |
| G.J.S. 96-32 | T. stilbohypoxyli | Puerto Rico | AY380915 | AY376686 | DQ122160 | AY376062 |
| G.J.S. 96-30 = CBS 992.97 | T. stilbohypoxyli (T) | Puerto Rico | DQ109533 | DQ111967 | DQ122161 | DQ109546 |
| G.J.S. 96-30A | T. stilbohypoxyli | Puerto Rico | AY380916 | AY376687 | - | AY376063 |
| G.J.S. 96-42A | T. stilbohypoxyli | Puerto Rico | AY380914 | AY376685 | - | AY376061 |
| G.J.S. 96-43 | T. stilbohypoxyli | Puerto Rico | - | - | - | - |
| G.J.S. 95-93 | T. taiwanense (T) | Taiwan | DQ313141 | DQ323455 | DQ367685 | DQ284973 |
| C.P.K. 9842 | T. viride VB | Sweden | - | - | - | - |
| C.P.K. 9652 | T. viride VB | Czech Republic | - | - | - | - |
| ATCC 28020 | T. viride VB | U.S.A. (WA) | DQ109535 | DQ111970 | DQ122164 | AY937449 |
| CBS 101526 | T. viride VB | Netherlands | X93979 | - | - | AY376053 |
| C.P.K. 1001 | T. viride VB | Russia | - | - | - | - |
| C.P.K. 1002 | T. viride VB | Russia | - | - | - | - |
| C.P.K. 1006 | T. viride VB | Russia | - | - | - | - |
| C.P.K. 1007 | T. viride VB | Russia | - | - | - | - |
| C.P.K. 1008 | T. viride VB | Russia | - | - | - | - |
| C.P.K. 1009 | T. viride VB | Russia | - | - | - | - |
| G.J.S. 04-369 | T. viride VB | Austria | DQ323430 | - | - | DQ307553 |
| G.J.S. 04-370 | T. viride VB | Austria | DQ323429 | - | - | DQ307554 |
| G.J.S. 04-371 | T. viride VB | France | DQ323431 | - | - | DQ307552 |
| G.J.S. 04-372 | T. viride VB | Czech Rep. | DQ323428 | - | - | DQ307555 |
| G.J.S. 90-95 = CBS 120066 | T. viride VB | U.S.A. (NC) | DQ315455 | - | - | DQ307535 |
| G.J.S. 92-14 | T. viride VB | New Zealand | DQ313155 | - | - | DQ288988 |
| G.J.S. 92-15 | T. viride VB | Canada | DQ315452 | - | - | DQ307537 |
| G.J.S. 97-271 = BBA 70239 = ITB 8212 | T. viride VB | Denmark | DQ315456 | - | - | AF348116 |
| G.J.S. 99-16 = FP 5563 | T. viride VB | Japan? | DQ315460 | - | - | DQ307543 |
| TR 2 = ATCC 18652 = CBS 240.63 | T. viride VB | U.S.A. (WA) | DQ315457 | - | - | DQ307538 |
| TR 21 = ATCC 28038 | T. viride VB | U.S.A. (VA) | AY380909 | AY376681 | DQ122165 | AY376054 |
| G.J.S. 04-40 | T. viride VB? | Brazil | DQ315454 | - | - | DQ307534 |
| 301rufa2 = C.P.K. 1999 | T. viride VB | Austria | - | - | - | - |
| 19d2 = G.J.S. 89-127 | T. viride VB | U.S.A. (NC) | - | - | - | - |
| 292rufa2 = C.P.K. 1997 | T. viride VB | Czech Republic | - | - | - | - |
| 6138i2 = C.P.K. 947 | T. viride VD | Austria | - | - | - | - |
| 7123412 = C.P.K. 2341 | T. viride VD | Italy (Sardinia) | - | - | - | - |
| ATCC 20898 | T. viride VD | U.S.A. (NY) | DQ315434 | - | - | DQ307518 |
| ATCC 32630 | T. viride VD | Sweden | DQ315445 | - | - | DQ307526 |
| CBS 274.79 | T. viride VD | Austria | DQ315428 | - | - | DQ307513 |
| CBS 333.72 | T. viride VD | Netherlands | DQ315441 | - | - | DQ307523 |
| CBS 438.95 | T. viride VD | U.K. | DQ315438 | - | - | DQ307522 |
| CBS 439.95 | T. viride VD | Northern Ireland | DQ315439 | - | - | AY937413 |
| 2732 | T. viride VD | U.K. | - | - | - | |
| C.P.K. 998 | T. viride VD | Russia | - | - | - | |
| C.P.K. 999 | T. viride VD | Russia | - | - | - | |
| 2462 | T. viride VD | U.K. | - | - | - | |
| 2342 | T. viride VD | Germany | - | - | - | - |
| G.J.S. 00-67 | PS F T. viride VD | U.S.A. (WV) | DQ315418 | - | - | DQ307502 |
| G.J.S. 89-142 = CBS 120065 | T. viride VD | U.S.A. (NC) | DQ109532 | DQ111965 | DQ122157 | AY376049 |
| G.J.S. 92-11 | T. viride VD | New Zealand | DQ315422 | - | - | DQ307524 |
| G.J.S. 94-10 | PS F T. viride VD | Taiwan | DQ315420 | - | - | DQ307506 |
| G.J.S. 94-11 | PS F T. viride VD | Taiwan | DQ313156 | - | - | DQ307508 |
| G.J.S. 94-118 | T. viride VD | France | DQ315424 | - | - | DQ307510 |
| G.J.S. 94-9 | PS F T. viride VD | Taiwan | DQ315421 | - | - | DQ307507 |
| G.J.S. 97-243 | PS F T. viride VD | U.S.A. (GA) | DQ315419 | - | - | DQ307503 |
| G.J.S. 97-272 = BBA 66069 | T. viride VD | Germany | DQ315429 | - | - | DQ307504 |
| G.J.S. 97-274 = BBA 68432 | T. viride VD | Russia | DQ315440 | - | - | DQ307505 |
| G.J.S. 98-129 | T. viride VD | France | AY737773 | - | - | DQ307542 |
| G.J.S. 98-182 = W.J. 1223 = CBS 120067 | T. viride VD | Austria | DQ315425 | - | - | DQ307511 |
| G.J.S. 98-86 | T. viride VD | Mexico | DQ315423 | - | - | DQ307509 |
| G.J.S. 99-10 = NR 5510 | T. viride VD | Czech Rep. | DQ315430 | - | - | DQ307514 |
| G.J.S. 99-128 | T. viride VD | Australia (VI) | DQ315431 | - | - | DQ307515 |
| G.J.S. 99-142 | T. viride VD | Australia (VI) | DQ315427 | - | - | DQ307512 |
| G.J.S. 99-175 | T. viride VD | Australia (VI) | DQ315437 | - | - | DQ307521 |
| G.J.S. 99-8 = NR 5541 | T. viride VD | Japan | DQ315433 | - | - | DQ307517 |
| G.J.S. 99-18 = FP 5564 | T. viride VD | Japan? | DQ315435 | - | - | DQ307519 |
| TR 4 | T. viride VD | U.S.A. (OR) | DQ315436 | - | - | DQ307520 |
| TR 5 | T. viride VD | U.S.A. (OR) | DQ315443 | - | - | DQ307525 |
| TR 6 | T. viride VD | U.S.A. (OR) | DQ315444 | - | - | AY376050 |
| CBS 433.34 | T. viride VD, T of Eidamia viridescens | U.K. | AF456922 | - | - | AF456905, AY376048 |
| G.J.S. 04-09 | PS C | U.S.A. (TX) | DQ315459 | - | - | DQ307541 |
| G.J.S. 92-60 | PS C | Australia | DQ315448 | - | - | DQ307529 |
| C.P.K. 1011 | PS C | Central Russia | - | - | - | DQ641674 |
| C.P.K. 1010 | PS C | Central Russia | - | - | - | DQ641673 |
| G.J.S. 02-54 | H. vinosa | New Zealand | DQ315447 | - | - | DQ307528 |
| G.J.S. 99-156 | H. vinosa | U.S.A. (TX) | DQ315446 | - | - | DQ307527 |
| G.J.S. 99-158 | H. vinosa | New Zealand | AY380904 | AY376680 | DQ122158 | AY376047 |
| DIS 217i | PS B | Ecuador | DQ323420 | - | - | DQ307549 |
| G.J.S. 04-353 | PS B | U.S.A. (TN) | DQ323418 | - | - | DQ307551 |
| G.J.S. 90-97 | PS B | U.S.A. (NC) | DQ315449 | - | - | DQ307530 |
| G.J.S. 99-127 | PS A | Australia (VI) | DQ315453 | - | - | DQ307533 |
| G.J.S. 99-83 | PS A | Australia (VI) | AF456921 | DQ111966, DQ333557 | DQ122159 | AF348118 |
| G.J.S. 99-191 | PS A | Australia (VI) | DQ315451 | - | - | DQ307532 |
| G.J.S. 99-86 | PS A | Australia (VI) | DQ315432 | - | - | DQ307516 |
| G.J.S. 99-204 | PS A | New Zealand | DQ315450 | - | - | DQ307531 |
| 371Tsp27Bnov = J. B. ID424 | PS A | - | - | - | - | - |
| 230T.spnov.278 = J. B. ID422 | PS A | - | - | - | - | - |
| G.J.S. 98-170 | T. hamatum | New Zealand | DQ109530 | DQ111963 | DQ122155 | DQ109544 |
| DAOM 167057 | T. hamatum (ex-neotype) | Canada | Z48816 | DQ111962 | DQ122154 | AF456911, AY750893 |
| DAOM 166162 | T. hamatum | U.S.A. (NC) | DQ083016 | DQ111961 | DQ122153 | AY750887 |
| G.J.S. 04-217 | T. asperellum | Peru | DQ381957 | DQ333564 | DQ379002 | DQ381958 |
| Tr 3 = CBS 433.97 | T. asperellum | U.S.A. (MD) | X93981 | DQ111974 | DQ122170 | AY376058 |
1
Abbreviations of culture collections and collectors: ATCC = American Type Culture Collection, Manassas, VA, U.S.A., BBA = Biologisches Bundesanstalt, Berlin, Germany; CBS = Centraalbureau voor Schimmelcultures, Utrecht, The Netherlands; C.P.K. = Collection of C.P. Kubicek, Technische Universität, Abteilung für Mikrobielle Biochemie, Vienna; C.T.R., G.J.S., TR = Culture collection of the United States Department of Agriculture, Systematic Botany and Mycology Lab, Beltsville, MD U.S.A. (BPI); DAOM = Canadian Collection of Fungal Cultures, Ottawa, Canada; DIS refers to CABI-Bioscience, Ascot, cultures held by G.J.S; FP = unknown provenance, received from Toru Okuda, Nippon Roche Corp., Tokyo, Japan; IBT = Culture Collection of Fungi, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark; IMI = CABI-Bioscience, Egham, U.K.; J.B. = John Bissett, Agriculture and Agri-Food, Eastern Cereal and Oilseed Research Centre, Ottawa, Canada; W.J. = Culture collection of Walter Jaklitsch, Technische Universität, Abteilung für Mikrobielle Biochemie, Vienna; NR = Nippon Roche Corp. Tokyo, Japan.
2
Collection of C.P. Kubicek, Technische Universität, Abteilung für Mikrobielle Biochemie, Vienna.