TABLE 2.
Occurrence and frequency of the various drug resistance mutations (per codon) by sequence analysis and LiPA
Assay | Mutation(s) at codon:
|
Frequency (no. of mutants)
|
|||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
80 | 173 | 180 | 181 | 204 | 236 | Baseline | Wk 12 | Wk 24 | Wk 52 | Wk 156 | |
Sequencing | M204I | 1 | 1 | 1 | |||||||
L180M | M204I | 1 | |||||||||
L180M | M204I, M204V | 2 | |||||||||
L80I | M204I | 1 | 3 | 7 | 1 | ||||||
L80I | L180M | M204I | 1 | ||||||||
L80I | L180M | M204I, M204V | 2 | ||||||||
L80I | V173L | M204I | 1 | ||||||||
L80V | M204I | 1 | |||||||||
L80V | L180M | M204I | 1 | ||||||||
L80I | L180M | M204V | 1 | ||||||||
V173L | L180M | M204V | 1 | ||||||||
L80I | 1 | ||||||||||
A181T | 1 | 2 | 1 | ||||||||
N236T | 1 | ||||||||||
Total | 1 | 2 | 6 | 12 | 11 | ||||||
LiPA | M204I | 3 | 3 | 3 | |||||||
L180M | M204I | ||||||||||
L180M | M204I, M204V | 1 | |||||||||
L80I | M204I | 1 | 2 | 3 | 1 | ||||||
L80I | L180M | M204I | 1 | ||||||||
L80I | L180M | M204I, M204V | 1 | ||||||||
L80I | V173L | M204I | 1 | ||||||||
L80V | M204I | ||||||||||
L80V | L180M | M204I | |||||||||
L80I | L180M | M204V | |||||||||
V173L | L180M | M204V | |||||||||
L80I | |||||||||||
A181T | 3 | 5 | 4 | 2 | |||||||
N236T | 1 | ||||||||||
L80I | M204I, M204V | 1 | |||||||||
L80I, L80V | M204I | 1 | 1 | 1 | |||||||
L80I, L80V | A181T | M204I, M204V | N236T | 1 | |||||||
L80I, L80V | L180M | M204I, M204V | N236T | 1 | 1 | 1 | |||||
L180M | A181T | M204I | N236T | 1 | |||||||
A181T | M204I | 1 | 3 | ||||||||
L80V | L180M | A181T | M204V | 1 | |||||||
L80V | A181T | 2 | |||||||||
L80V | M204I, M204V | 1 | |||||||||
L80V | L180M | M204I, M204V | 1 | 1 | |||||||
M204I, M204V | 1 | 1 | |||||||||
V173L | L180M | M204I, M204V | 1 | ||||||||
L80I | V173L | L180M | M204V | 1 | |||||||
M204V | 1 | 1 | 2 | ||||||||
L80I | M204I | N236T | 1 | ||||||||
L180M | M204V | 1 | |||||||||
L80I, L80V | L180M | M204I, M204V | 1 | 1 | |||||||
L80I | A181T | M204I, M204V | 1 | ||||||||
L80I, L80V | L180M | M204I | 1 | ||||||||
L80I | L180M | A181T | M204I | 1 | |||||||
Total | 3 | 10 | 17 | 25 | 14 |