Skip to main content
. 2007 Sep 26;81(23):12881–12888. doi: 10.1128/JVI.00913-07

TABLE 2.

Primers used in plasmid construction

Primer Sequence Restriction enzyme Construct
HC-Pro5 5′-TAGGATTCTGTCGAATGCCGACAATTTT-3′ BamHI pGBKT7-HC-Pro
HC-Pro3 5′-TACTGCAGACCAACTCTATAATGTTT-3′ PstI
PAA5 5′-ATGAATTCATGAGCAGAGGAAGCGGC-3′ EcoRI pGADT7-PAA
PAA3 5′-ATCTCGAGTCAGTCACGTTCACTAAT-3′ XhoI
PAB5 5′-ATGAATTCATGGGAGATAGTCAGTAC-3′ EcoRI pGADT7-PAB
PAB3 5′-ATCTCGAGTTACTCGACTTCAGCAAG-3′ XhoI
PAC5 5′-ATGAATTCATGTCTCGGAGATATGAT-3′ EcoRI pGADT7-PAC
PAC3 5′-ATGAGCTCTTAAGATGTTTCAGCAGC-3′ SacI
PAD5 5′-ATGAATTCATGGCGAGATACGATCGA-3′ EcoRI pGADT7-PAD
PAD3 5′-ATCTCGAGTCATGTTTCCTTCGCAGG-3′ XhoI
PAE5 5′-ATGAATTCATGTTTCTCACTAGAACT-3′ EcoRI pGADT7-PAE
PAE3 5′-ATCTCGAGTCAAAGACGAGCGATGAC-3′ XhoI
PAF5 5′-ATGAATTCATGTTCAGAAACCAATAC-3′ EcoRI pGADT7-PAF
PAF3 5′-ATCTCGAGTTACATTTCCATTGGAGC-3′ XhoI
PAG5 5′-ATGAATTCATGAGTAGCATTGGAACT-3′ EcoRI pGADT7-PAG
PAG3 5′-ATCTGCAGTTAGTCAGCATCCATCTC-3′ XhoI
PBA5 5′-ATGAATTCATGGATCTCAATCTCGAT-3′ EcoRI pGADT7-PBA
PBA3 5′-ATCTCGAGTCACATGGCCATTGGTTC-3′ XhoI
PBB5 5′-ATGAATTCATGTCGCAGTCTTCCGTC-3′ EcoRI pGADT7-PBB
PBB3 5′-ATCTGCAGTCATTCCTCCATAGCTTC-3′ XhoI
PBC5 5′-ATGAATTCATGTCGATCTTCGAGTAC-3′ EcoRI pGADT7-PBC
PBC3 5′-ATCTCGAGTCAATCCATCCTTCCCTT-3′ XhoI
PBD5 5′-ATGAATTCATGGAGTGTGTATTCGGT-3′ EcoRI pGADT7-PBD
PBD3 5′-ATCTCGAGTCAGACAACAGCAGTTGT-3′ XhoI
PBE5 5′-ATGAATTCATGAAGCTTGATACTAGT-3′ EcoRI pGADT7-PBE
PBE3 5′-ATCTGCAGTTATTCGGCTGTTGCTTC-3′ SpeI
PBF5 5′-ATGAATTCATGACTAAACAGCACGCG-3′ EcoRI pGADT7-PBF
PBF3 5′-ATCTCGAGTTAGTCTTTCCTCAGGTC-3′ XhoI
PBG5 5′-ATATCGATACATGACGACTTTTTCTG-3′ ClaI pGADT7-PBG
PBG3 5′-ATCTCGAGTTACCAGGAGCCTGCAGC-3′ XhoI
HcProBiFC5 5′-ATTCTAGAATGTCGAATGCCGACAATTT-3′ XbaI pUC-SPYCE-HC-Pro/pSPYNE-35S-HC-Pro
HcProBiFC3 5′-ATACTAGTACCAACTCTATAATGTTTTA-3′ SpeI
BIFCPAA5 5′-ATTCTAGAATGAGCAGAGGAAGCGGCGC-3′ XbaI
BIFCPAA3-1 5′-TAGGTACCGTCACGTTCACTAATGGCCG-3′ KpnI pUC-SPYCE-PAA/pSPYCE-35S-PAA
BIFCPAA3-2 5′-TACTCGAGGTCACGTTCACTAATGGCCG-3′ XhoI
BIFCPBB5 5′-ATTCTAGAATGTCGCAGTCTTCCGTC-3′ XbaI
BIFCPBB3-1 5′-ATGGTACCTTCCTCCATAGCTTCACC-3′ KpnI pUC-SPYCE-PBB/pSPYCE-35S-PBB
BIFCPBB3-2 5′-ATCCCGGGTTCCTCCATAGCTTCACC-3′ XmaI
BIFCPBE5 5′-ATTCTAGAATGAAGCTTGATACTAGTGG-3′ XbaI
BIFCPBE3-1 5′-TAGGTACCTTCGGCTGTTGCTTCCTCCA-3′ KpnI pUC-SPYCE-PBE/pSPYCE-35S-PBE
BIFCPBE3-2 5′-TAGGTACCTTCGGCTGTTGCTTCCTCCA-3′ XmaI
PAA1-5 5′-TAGAATTCATGACTGGCATGACAGCTGATTC-3′ EcoRI pGADT7-PAA1
PAA1-3 5′-ATCTCGAGTCAGTCACGTTCACTAATGGCCG-3′ XhoI
PAA2-5 5′-ATGAATTCATGAGCAGAGGAAGCGGCGCTGG-3′ EcoRI pGADT7-PAA2
PAA2-3 5′-ATCTCGAGTCAAACCATGGCAACTACTCCAA-3′ XhoI
PAA3-3 5′-TACTCGAGTTAGGCTAACAATCCAAGGT-3′ XhoI pGADT7-PAA3
PBB1-5 5′-TAGAATTCATGTACTGTTGTGGTGCAGGA-3′ EcoRI pGADT7-PBB1
PBB1-3 5′-TAGAGCTCTCATTCCTCCATAGCTTCACC-3′ SacI
PBB2-5 5′-TAGAATTCATGTCGCAGTCTTCCGTC-3′ EcoRI pGADT7-PBB2
PBB2-3 5′-TAGAGCTCTCAGCTACCACTACCAAG-3′ SacI
PBE1-5 5′-TAGAATTCATGGGATATATCTCCTCACAATC-3′ EcoRI pGADT7-PBE1
PBE1-3 5′-ATGAGCTCTTATTCGGCTGTTGCTTCCTCCA-3′ SacI
PBE2-5 5′-ATGAATTCATGAAGCTTGATACTAGTGGGTT-3′ EcoRI pGADT7-PBE2
PBE2-3 5′-ATGAGCTCTTATCCAGCAATCATTGTACCAA-3′ SacI
HC-Pro1-5 5′-TAGAATTCATGATAGCGTTAGAGCATCTA-3′ EcoRI pGBKT7-HC-Pro1
HC-Pro1-3 5′-TACTGCAGTTAACCAACTCTATAATGTTT-3′ PstI
HC-Pro2-5 5′-TAGAATTCATGTCGAATGCCGACAATTT-3′ EcoRI pGBKT7-HC-Pro2
HC-Pro2-3 5′-TACTGCAGTTAACCATCATCAAGTGTTGT-3′ PstI
HC-Pro3-3 5′-TACTGCAGTTACAAGAACTTATTAACATG-3′ PstI pGBKT7-HC-Pro3