Table 2.
Distribution of G3pdh haplotypes in the study system
| Population (n) | Haplotypes
|
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | α | β | γ | δ | ɛ | |
| Frequency: | 0.0590 | 0.0236 | 0.1533 | 0.0189 | 0.1745 | 0.0283 | 0.0425 | 0.0330 | 0.0189 | 0.0307 | 0.0047 | 0.0425 | 0.0542 | 0.0330 | 0.0165 | 0.0896 | 0.0118 | 0.0142 | 0.0142 | 0.0094 | 0.0495 | 0.0259 | 0.0142 | 0.0071 | 0.0094 | 0.0047 | 0.0118 | 0.0047 |
| M. esculenta subsp. flabellifolia | ||||||||||||||||||||||||||||
| Axixá, TO (6) | E | |||||||||||||||||||||||||||
| Luzinópolis, TO (6) | E | α | β | |||||||||||||||||||||||||
| Miranorte, TO (8) | D | E | W | α | β | γ | ||||||||||||||||||||||
| Dueré, TO (6) | V | γ | ||||||||||||||||||||||||||
| Campos Belos, GO (6) | C | |||||||||||||||||||||||||||
| Campinorte, GO (6) | C | E | ||||||||||||||||||||||||||
| Rialma, GO (6) | C | E | ||||||||||||||||||||||||||
| Corumbá, GO (6) | C | E | ||||||||||||||||||||||||||
| Nerópolis, GO (6) | C | E | ||||||||||||||||||||||||||
| Goiás Velho, GO (6) | E | J | ||||||||||||||||||||||||||
| Iporá, GO (6) | C | E | ||||||||||||||||||||||||||
| Caiapônia, GO (6) | C | E | ||||||||||||||||||||||||||
| Nova Xavantina, MT (6) | C | |||||||||||||||||||||||||||
| Serra Petrovina, MT (5) | I | J | ||||||||||||||||||||||||||
| Santa Elvira, MT (2) | J | N | ||||||||||||||||||||||||||
| São Vincente, MT (4) | P | R | ||||||||||||||||||||||||||
| Lambari d’Oeste, MT (6) | A | B | J | |||||||||||||||||||||||||
| Pontes e Lacerda, MT-A (6) | A | B | C | H | O | |||||||||||||||||||||||
| Pontes e Lacerda, MT-B (6) | J | O | P | Q | ||||||||||||||||||||||||
| Vilhena, RO (6) | D | N | ||||||||||||||||||||||||||
| Pimenta Bueno, RO (6) | N | S | ||||||||||||||||||||||||||
| Jarú, RO (6) | M | N | P | |||||||||||||||||||||||||
| Ariquemes, RO (6) | C | U | ||||||||||||||||||||||||||
| Teotônio, RO (6) | H | O | P | T | δ | |||||||||||||||||||||||
| Taquaras, RO (6) | H | O | P | |||||||||||||||||||||||||
| Rio Branco, AC (6) | P | T | U | |||||||||||||||||||||||||
| Sena Madureira, AC (6) | A | C | P | |||||||||||||||||||||||||
| M. esculenta subsp. esculenta (cassava) (20) | A | H | N | P | δ | ɛ | ||||||||||||||||||||||
| AA:MBRA12, MCOL1684, MPAR110, MVEN25 | ||||||||||||||||||||||||||||
| PP:MBOL3, MCOL2215, MNGA2 | ||||||||||||||||||||||||||||
| AP:MARG11, MCR32, MCUB74, MECU82, MIND33, MMAL2, MPTR19, MTAI1 | ||||||||||||||||||||||||||||
| PN: MCOL1505 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Aδ: MBRA931, MPAN51 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Aɛ:HMC1 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Hɛ: MMEX59 | ||||||||||||||||||||||||||||
| M. pruinosa | ||||||||||||||||||||||||||||
| Miranorte, TO (6) | G | L | M | |||||||||||||||||||||||||
| Divinópolis, GO (6) | G | L | ||||||||||||||||||||||||||
| East Iporá, GO (5) | G | J | L | M | ||||||||||||||||||||||||
| Iporá, GO (6) | E | G | L | M | ||||||||||||||||||||||||
| Nova Xavantina, MT (6) | G | K | M | |||||||||||||||||||||||||
| Serra Petrovina, MT (6) | F | |||||||||||||||||||||||||||
Populations of wild taxa are listed in clockwise order around the eastern and southern border of the Amazon basin (see Fig. 1 for definition of abbreviations of Brazilian states). n, number of individuals sequenced per population. Haplotypes in bold print were detected in cassava. Greek letters indicate haplotypes detected in heterozygous individuals only. Cassava accessions are listed by genotype.