Table 2.

Primer Sequences and Restriction Enzymes for the MSP and the COBRA Analysis

MINT clones	Forward primer	Reverse primer	Restriction enzyme
MINT 1	F 5′ GGGTTGGAGAGTAGGGGAGTT 3′	R 5′ CCATCTAAAATTACCTCRATAACTTA 3′	TaqI
MINT 25	F 5′ TYGGTGTTTGTAAAGGGTTGGAAT 3′	R 5′ CCCRAACTAAAAACTAACTCRTAA 3′	RsaI
MINT 31	F 5′ GAYGGYGTAGTAGTTATTTTGTT 3′	R 5′ CATCACCACCCCTCACTTTAC 3′	MaeII
Gene promoters
p16-M	F 5′ TTATTAGAGGGTGGGGCGGATCGC 3′	R 5′ GACCCCGAACCGCGACCGTAA 3′
p16-U	F 5′ TTATTAGAGGGTGGGGTGGATTGT 3′	R 5′ CAACCCCAAACCACAACCATAA 3′
Cox2-M	F 5′ TTAGATACGGCGGCGGCGGC 3′	R 5′ TCTTTACCCGAACGCTTCCG 3′
Cox2-U	F 5′ ATAGATTAGATATGGTGGTGGTGGT 3′	R 5′ CACAATCTTTACCCAAACACTTCCA 3′
GSTP1-M	F 5′ TTCGGGGTGTAGCGGTCGTC 3′	R 5′ GCCCCAATACTAAATCACGACG 3′
GSTP1-U	F 5′ GATGTTTGGGGTGTAGTGGTTGTT 3′	R 5′ CCACCCCAATACTAAATCACAACA 3′
RASSF1A-M	F 5′ GTGTTAACGCGTTGCGTTGCGTATC 3′	R 5′ AACCCCGCGAACTAAAAACGA 3′
RASSF1A-U	F 5′ TTTGGTTGGAGTGTGTTAATGTG 3′	R 5′ CAAACCCCACAAACTAAAAACAA 3′
E-cadherin-M	F 5′ TTAGGTTAGAGGGTTATCGCGT 3′	R 5′ TAACTAAAAATTCACCTACCGAC 3′
E-cadherin-U	F 5′ TAATTTTAGGTTAGAGGGTTATTGT 3′	R 5′ CACAACCAATCAACAACACA 3′
APC-M	F 5′ TATTGCGGAGTGCGGGTC 3′	R 5′ TCGACGAACTCCCGACGA 3′
APC-U	F 5′ GTGTTTTATTGTGGAGTGTGGGTT 3′	R 5′ CCAATCAACAAACTCCCAACAA 3′