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. 2008 Feb 13;3(2):e1586. doi: 10.1371/journal.pone.0001586

Table 2. Average nucleotide variant counts (N scores) of 17 conserved sites compared to the mean of 20 random sites in all potyvirus genomes from 1985 to 2005.

conserved sites 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 Yr 96 97 98 99 00 01 02 03 04 05
7587 0.00 0.00 0.00 0.20 0.20 0.20 0.20 0.30 0.40 0.40 0.40 0.40 0.45 0.45 0.45 0.45 0.50 0.50 0.50 0.50 0.55
9237 0.00 0.00 0.00 0.25 0.35 0.35 0.40 0.50 0.50 0.50 0.55 0.60 0.60 0.60 0.60 0.60 0.60 0.60 0.60 0.60 0.60
4545 0.00 0.00 0.00 0.10 0.25 0.25 0.30 0.45 0.45 0.50 0.50 0.50 0.50 0.50 0.50 0.50 0.55 0.55 0.65 0.65 0.65
4539 0.00 0.00 0.00 0.09 0.26 0.26 0.30 0.43 0.43 0.43 0.57 0.57 0.57 0.57 0.61 0.65 0.70 0.70 0.78 0.78 0.78
9162 0.00 0.00 0.00 0.18 0.29 0.29 0.29 0.35 0.35 0.47 0.53 0.53 0.53 0.53 0.53 0.65 0.71 0.71 0.76 0.76 0.82
8278 0.00 0.00 0.00 0.32 0.42 0.42 0.47 0.53 0.68 0.74 0.74 0.74 0.74 0.74 0.74 0.74 0.79 0.84 0.84 0.84 0.84
4458 0.00 0.00 0.00 0.10 0.35 0.35 0.45 0.60 0.75 0.75 0.80 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85
7899 0.00 0.00 0.00 0.20 0.30 0.30 0.35 0.45 0.45 0.45 0.50 0.55 0.55 0.55 0.70 0.70 0.70 0.75 0.75 0.75 0.85
9099 0.00 0.00 0.00 0.15 0.30 0.30 0.35 0.45 0.45 0.45 0.60 0.75 0.85 0.85 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90
7911 0.00 0.00 0.00 0.18 0.36 0.36 0.41 0.64 0.68 0.68 0.86 0.86 0.86 0.86 0.86 0.86 0.86 0.86 0.86 0.86 0.95
7545 0.00 0.00 0.00 0.09 0.30 0.30 0.35 0.48 0.70 0.74 0.83 0.87 0.87 0.91 0.91 0.96 0.96 0.96 1.00 1.00 1.00
7722 0.00 0.00 0.00 0.25 0.30 0.30 0.40 0.45 0.50 0.50 0.60 0.65 0.70 0.70 0.80 0.85 0.85 0.85 0.85 0.90 1.00
3888 0.00 0.00 0.00 0.15 0.40 0.40 0.50 0.65 0.70 0.70 0.75 0.90 0.90 0.90 0.90 0.95 0.95 1.00 1.00 1.00 1.05
8853 0.00 0.00 0.00 0.10 0.25 0.25 0.25 0.45 0.45 0.50 0.55 0.75 0.75 0.75 0.75 0.75 0.85 0.90 1.00 1.00 1.10
8901 0.00 0.00 0.00 0.10 0.20 0.20 0.40 0.50 0.65 0.65 0.80 0.80 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 1.15 1.20 1.20 1.20
9042 0.00 0.00 0.00 0.20 0.30 0.30 0.55 0.70 0.70 0.80 0.80 0.90 0.95 1.05 1.05 1.05 1.05 1.15 1.15 1.15 1.20
4396 0.00 0.00 0.00 0.11 0.26 0.26 0.32 0.47 0.47 0.53 0.58 0.63 0.63 0.68 0.74 0.74 0.79 0.84 0.95 1.11 1.21
Mean 0.00 0.00 0.00 0.16 0.30 0.30 0.37 0.49 0.55 0.58 0.64 0.70 0.71 0.73 0.75 0.77 0.79 0.83 0.86 0.87 0.92
SD 0.00 0.00 0.00 0.07 0.06 0.06 0.09 0.10 0.13 0.13 0.14 0.16 0.16 0.17 0.17 0.16 0.15 0.18 0.18 0.19 0.20
random sites mean 0.00 0.00 0.00 0.41 0.88 0.88 1.05 1.29 1.41 1.46 1.59 1.69 1.72 1.74 1.78 1.81 1.85 1.91 1.94 1.98 2.02
random sites SD 0.00 0.00 0.00 0.16 0.22 0.22 0.25 0.30 0.34 0.34 0.35 0.39 0.39 0.40 0.41 0.40 0.40 0.43 0.41 0.42 0.42