Skip to main content
. 2007 Dec;177(4):2417–2431. doi: 10.1534/genetics.107.080002

TABLE A1.

Markers that reached significance (PFP = 0.20) for Z or IA in BC-1, BC-2, or combined analyses, and their P-values for all five tests

BC-1
BC-2
Combined
Marker Ch P AN S Z χ2 IA AN S Z χ2 IA AN S Z χ2 IA
ADL0192 1 149 0.57 −0.01 0.41 −0.00 0.00 0.00 −0.01 0.00
LEI0146 1 169 0.08 0.53 0.04 0.03 0.18 0.01 0.08 0.00
MCW0115 1 518 0.42 0.21 0.26 0.25 0.24 0.03 0.01 0.01 0.15 0.04 0.03 0.01 0.01 0.14 0.03
ADL0350 1 523 0.65 0.53 0.45 0.27 0.32 0.01 0.01 0.00 0.11 0.03 0.04 0.03 0.01 0.11 0.03
GCT0032 1 523 0.31 0.21 0.19 0.53 0.32 0.01 0.01 0.00 0.04 0.03 0.01 0.01 0.00 0.11 0.03
ADL0185 2 95 0.62 0.53 0.41 0.77 0.87 0.04 0.01 0.01 0.24 0.19 0.07 0.03 0.02 0.51 0.95
LEI0043 3 9 −0.01 0.32 −0.00 0.02 0.19 0.98 −0.01 0.22
ADL0042 3 207 0.02 0.00 0.21 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00
MCW0103 3 208 −0.00 0.06 −0.00 0.03 0.03 0.11 0.06 0.04 0.66 0.01 −0.26 1.00 −0.47 0.11 0.00
MCW0129 4 175 0.84 0.53 0.61 0.76 0.57 −0.01 0.21 −0.01 0.00 0.03 −0.13 0.65 −0.15 0.02 0.07
LEI0116 5 6 0.05 0.21 0.02 0.01 0.00 −0.79 1.00 0.91 1.00 1.00 0.22 0.37 0.07 0.16 0.10
LEI0082 5 32 0.23 1.00 0.12 0.00 0.00 −0.19 0.21 −0.36 0.04 0.17 −0.99 0.37 0.64 0.00 0.10
MCW0081 5 152 −0.00 0.06 −0.00 0.00 0.10 0.74 0.53 0.42 0.55 0.47 −0.06 0.37 −0.13 0.02 0.12
ADL0279 7 62 −0.11 0.21 −0.19 0.55 0.40 −0.00 0.01 −0.01 0.10 0.07 −0.00 0.01 −0.00 0.21 0.05
MCW0236 7 79 −0.88 1.00 0.89 0.54 0.68 −0.00 0.06 −0.01 0.07 0.06 −0.04 0.18 −0.09 0.16 0.03
LEI0158 7 91 −0.94 0.53 0.82 1.00 0.98 −0.00 0.21 −0.15 0.14 0.19 −0.00 0.65 −0.31 0.72 0.00
MCW0100 8 43 −0.96 1.00 −0.07 1.00 0.99 0.00 −0.96 0.00
ADL0154 8 46 −0.71 1.00 −0.93 0.93 1.00 0.00 −0.70 0.00
ADL0345 8 56 0.06 0.48 −0.24 0.07 0.50 0.01 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 0.00
ADL0021 9 48 0.30 0.01 0.01 0.00 0.12 0.05 0.01 0.06
LEI0028 9 51 −0.53 1.00 −0.71 0.53 0.26 0.00 0.01 0.00 0.01 0.02 0.08 0.07 0.02 0.05 0.01
LMU0006 9 51 −0.77 1.00 −0.99 0.31 0.26 0.00 0.06 0.00 0.01 0.02 0.07 0.18 0.02 0.02 0.01
LEI0197 9 56 −0.19 0.53 −0.29 0.04 0.11 0.05 0.21 0.01 0.28 0.11 0.64 0.65 0.33 0.06 0.02
LEI0083 15 3 0.49 −0.26 0.41 −0.44 0.01 0.01 −0.31 0.01
MCW0231 15 23 0.07 0.06 0.04 0.06 0.01 0.32 0.21 0.15 0.35 0.09 0.05 0.03 0.01 0.09 0.01
ROS0348 15 25 0.04 0.21 0.02 0.01 0.01 0.47 0.06 0.09 0.08 0.09 0.05 0.03 0.00 0.01 0.00
MCW0052 15 26 0.06 0.21 0.03 0.01 0.00 0.22 0.21 0.09 0.14 0.10 0.03 0.07 0.00 0.01 0.00
MCW0211 15 39 0.01 0.21 0.01 0.01 0.00 0.28 0.53 0.64 0.23 0.40 0.01 0.18 0.02 0.01 0.01
ADL0022 Z 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.27 0.10 0.53 0.09 0.08 0.54 0.00 0.03 0.00 0.01 0.32
ROS0309 Z 36 0.00 0.06 0.02 0.08 0.54 0.42 0.21 0.35 0.97 0.99 0.01 0.03 0.02 0.44 0.92
MCW0055 Z 37 0.59 0.13 0.21 0.14 0.84 0.98 0.12 0.92
MCW0258 Z 42 0.05 0.06 0.08 0.43 0.81 0.33 0.21 0.31 0.79 0.94 0.03 0.03 0.04 0.70 0.97
MCW0331 Z 43 0.01 0.21 0.02 0.17 0.73 0.00 0.06 0.00 0.03 0.89 0.00 0.03 0.00 0.00 0.87
ROS0301 Z 49 0.02 0.21 0.04 0.30 0.71 0.15 0.21 0.15 0.91 0.97 0.01 0.07 0.01 0.69 0.96
ADL0273 Z 52 0.05 0.21 0.09 0.00 0.37 0.33 0.53 0.27 0.12 0.87 0.04 0.18 0.04 0.00 0.60
MCW0241 Z 74 0.29 0.53 0.30 0.05 0.42 0.18 1.00 0.15 0.00 0.21 0.09 0.65 0.08 0.00 0.23
LPL Z 103 −0.57 1.00 −0.78 0.26 0.82 0.00 0.53 0.00 0.00 0.03 0.04 0.65 0.05 0.00 0.18
LEI0075 Z 115 0.39 0.53 0.42 0.00 0.17 0.00 0.53 0.00 0.00 0.98 0.00 0.37 0.00 0.00 0.62

Underlined tests were significant at a PFP = 0.20. Ch, marker chromosome; P, position (marker location) (cM); AN, ANOVA; S, sign test; Z, Z-test; χ2, chi-square test; IA, interval analysis; —, marker not analyzed.