TABLE 5.
Detection of insertion sequences on P. savastanoi pv. savastanoi PFPs
| Strain | Plasmida | Detection of insertion sequenceb
|
|||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IS801 | ISPsy21 | ISPsy4 | ISPsy17 | ISPsy16 | ISPsy24 | ISPsy19 | ISPsy1-a/b | ||
| Psv29 | A | + | + | − | + | + | − | − | − |
| Psv31 | A | + | + | + | − | + | − | − | − |
| B | + | + | − | − | + | − | − | − | |
| C | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| D | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| Psv32 | A | + | + | − | − | − | − | − | − |
| B | + | + | − | − | + | − | − | − | |
| Psv35 | A | + | + | + | − | + | − | − | − |
| C | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| Psv36 | A | + | + | − | − | + | − | − | − |
| B | + | + | + | − | − | − | − | − | |
| C | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| Psv37 | A | + | + | − | − | + | − | − | − |
| B | + | − | − | − | − | − | − | − | |
| Psv47 | A | + | + | − | + | − | − | − | − |
| B | + | + | − | − | + | − | − | − | |
| Psv48 | A | + | + | − | − | − | − | − | − |
| B | + | + | − | − | + | − | − | − | |
| Psv62 | A | + | + | − | − | + | − | − | − |
| B | + | + | − | − | + | − | − | − | |
| Psv416 | A | + | + | + | − | + | − | − | − |
| B | + | + | + | − | + | − | − | − | |
| C | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| Pma ES4326c | B | + | − | − | − | − | − | − | − |
| Pto DC3000c | A | − | − | + | − | − | − | − | − |
| B | − | − | + | − | − | − | − | − | |
| Pph 1448Ac | A | + | + | − | + | + | − | + | − |
| B | − | − | − | + | − | − | − | − | |
| Psy A2c | pPSR1 | − | − | − | − | − | − | − | + |
| Pma M6c | pFKN | + | − | − | − | − | − | − | − |
a
Plasmid names incorporate the name of the host strain. pPsv29A is shown as A, and plasmids pPsv31A, pPsv31B, pPsv31C, and pPsv31D are shown as A, B, C, and D, respectively.
b
Symbols: +, hybridization; −, no hybridization.
c
In silico analysis only. Pma, P. syringae pv. maculicola ES4326 and M6; Pto, P. syringae pv. tomato DC3000; Pph, P. syringae pv. phaseolicola 1448A; Psy, P. syringae pv. syringae A2.