TABLE 1.
Mutations in the V3 loop of R3A
| Mutation | Sequencea | |
|---|---|---|
| V3 base | ||
| R3A | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ3-4 | CT GNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ5-6 | CTRPNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ5-8 | CTRPRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ26-29 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIRKAHC | |
| Δ28-29 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIIRKAHC | |
| Δ30-31 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDKAHC | |
| Δ32-33 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRHC | |
| Δ5-6/28-29 | CTRP NTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIIRKAHC | |
| Δ5-8/26-29 | CTRP RKRVTLGPGRVYYTTGQIRKAHC | |
| 5-6AA | CTRPAANTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| 28-29AA | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIAAIRKAHC | |
| 5-6/28-29AA | CTRPAANTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIAAIRKAHC | |
| V3 crown and stem | ||
| R3A | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| ΔV3(9,9) | CTRPGNNTRK GAGIIGDIRKAHC | |
| Δ13-14 | CTRPGNNTRKRV GPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ15-18 | CTRPGNNTRKRVTL VYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ19-20 | CTRPGNNTRKRVTLGPGR YTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ11-12 | CTRPGNNTRK TLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ21-22 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVY TGQIIGDIRKAHC | |
| Δ11-12/21-22 | CTRPGNNTRK TLGPGRVY TGQIIGDIRKAHC | |
| Δ9-12 | CTRPGNNT TLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ21-24 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVY QIIGDIRKAHC | |
| Δ9-12/21-24 | CTRPGNNT TLGPGRVY QIIGDIRKAHC | |
| Δ24-25 | CTRPGNNTRKRVTLGPGRVYYTT IIGDIRKAHC | |
| 9-12AAAA | CTRPGNNTAAAATLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ9-10 | CTRPGNNT RVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| 9-10AA | CTRPGNNTAARVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| Δ10-11 | CTRPGNNTR VTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
| 10-11AA | CTRPGNNTRAAVTLGPGRVYYTTGQIIGDIRKAHC | |
a
Amino acids in boldface are insertions.