Table 2.

Positional scanning combinatorial library derived matrix describing 9-mer binding to HLA A*0201.

	Position
Residue	1	2	3	4	5	6	7	8	9
A	0.114	0.002	0.431	0.895	0.377	0.715	0.334	0.259	0.105
C	0.032	0.002	0.222	0.201	0.758	0.435	0.260	0.178	0.005
D	0.008	0.002	0.465	0.915	0.114	0.211	0.149	0.161	0.003
E	0.015	0.030	0.037	0.647	0.193	0.838	0.536	0.492	0.038
F	1.000	0.004	0.630	0.359	0.322	0.364	0.696	0.784	0.084
G	0.089	0.009	0.098	0.537	0.270	0.152	0.194	0.358	0.008
H	0.005	0.002	0.270	0.168	0.184	0.207	0.345	0.164	0.002
I	0.121	0.057	0.537	0.321	0.300	0.843	1.000	0.082	0.327
K	0.114	0.012	0.016	0.372	0.182	0.088	0.041	0.199	0.002
L	0.054	1.000	0.568	0.661	0.263	0.555	0.346	0.357	0.181
M	0.251	0.186	1.000	0.291	1.000	0.363	0.353	0.264	0.075
N	0.067	0.006	0.159	0.823	0.329	0.725	0.385	0.177	0.003
P	0.003	0.003	0.056	0.792	0.109	0.328	0.957	1.000	0.003
Q	0.019	0.140	0.200	0.582	0.104	0.566	0.703	0.190	0.002
R	0.084	0.002	0.019	0.233	0.220	0.128	0.072	0.306	0.002
S	0.103	0.009	0.167	1.000	0.179	0.190	0.533	0.377	0.008
T	0.094	0.038	0.145	0.189	0.199	1.000	0.236	0.267	0.015
V	0.062	0.098	0.246	0.282	0.263	0.734	0.284	0.243	1.000
W	0.057	0.002	0.584	0.637	0.331	0.197	0.628	0.352	0.005
Y	0.107	0.008	0.875	0.303	0.235	0.150	0.946	0.609	0.002
Average	0.054	0.012	0.203	0.440	0.249	0.348	0.347	0.287	0.013
SD	3.9	6.6	3.3	1.8	1.8	2.1	2.3	1.8	7.4
SF	2.28	10.36	0.61	0.28	0.49	0.35	0.35	0.43	9.42

Library average: 0.123