Table 3.

P-distances (lower triangle) and corrected distances (GTR model, upper triangle) among haplotypes

species (clade)		haplotype	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15
R. hardwickii (I)	1	IR1		0,002	0,005	0,099	0,094	0,097	0,100	0,103	0,145	0,142	0,151	0,148	0,145	0,166	0,166
	2	IR2	0,002		0,008	0,103	0,097	0,100	0,103	0,106	0,142	0,139	0,147	0,144	0,141	0,162	0,162
	3	IR3	0,005	0,007		0,093	0,093	0,091	0,099	0,102	0,143	0,140	0,148	0,145	0,142	0,163	0,163
R. hardwickii (II)	4	LE1	0,090	0,092	0,085		0,005	0,003	0,010	0,031	0,144	0,141	0,146	0,143	0,146	0,159	0,159
	5	YE1	0,085	0,087	0,085	0,005		0,003	0,005	0,031	0,150	0,147	0,146	0,143	0,146	0,159	0,159
	6	YE2	0,087	0,090	0,082	0,002	0,002		0,008	0,034	0,147	0,144	0,143	0,140	0,143	0,156	0,156
	7	YE3	0,090	0,092	0,090	0,010	0,005	0,007		0,036	0,149	0,146	0,152	0,150	0,152	0,166	0,166
	8	NA1	0,092	0,095	0,092	0,030	0,030	0,032	0,035		0,153	0,150	0,138	0,135	0,138	0,173	0,173
R. muscatellum (III)	9	YE4	0,127	0,124	0,124	0,124	0,129	0,127	0,129	0,132		0,002	0,100	0,097	0,095	0,154	0,161
	10	YE5	0,124	0,122	0,122	0,122	0,127	0,124	0,127	0,129	0,002		0,097	0,095	0,092	0,151	0,158
R. muscatellum (IV)	11	IR4	0,132	0,129	0,129	0,127	0,127	0,124	0,132	0,122	0,090	0,087		0,003	0,005	0,168	0,168
	12	IR5	0,129	0,127	0,127	0,124	0,124	0,122	0,129	0,119	0,087	0,085	0,002		0,003	0,165	0,165
	13	IR6	0,127	0,124	0,124	0,127	0,127	0,124	0,132	0,122	0,085	0,082	0,005	0,002		0,162	0,162
R. microphyllum (V)	14	LE2	0,142	0,139	0,139	0,137	0,137	0,134	0,142	0,147	0,132	0,129	0,142	0,139	0,137		0,005
	15	IN1	0,142	0,139	0,139	0,137	0,137	0,134	0,142	0,147	0,137	0,134	0,142	0,139	0,137	0,005