Table 7. Specificities of compounds developed as inhibitors of CDK, Aurora kinases, CaMKK, AMPK, IKK, JNK and MNK.
The concentrations of compounds used in the assays are indicated below each molecule and the results are presented as the percentage activity remaining in the presence of inhibitors as compared with control incubations with inhibitor omitted (averages of duplicate determinations). Each experiment was repeated two or three times with similar results. Further details of the assays are given in the Materials and methods section. Important values are highlighted in boldface type. ND, not determined.
| Percentage activity remaining | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Kinase | Roscovitine (1 μM) | Purvalanol (0.1 μM) | VX 680 (1 μM) | SU 6668 (1 μM) | STO609 (1 μM) | Compound C (1 μM) | PS 1145 (10 μM) | BMS 345541 (10 μM) | SC 514 (10 μM) | SP 600125 (1 μM) | AS 601245 (1 μM) | AS 601245 10μM | CGP 57380 (1 μM) |
| MKK1 | 81±6 | 104±7 | 48±1 | 31±1 | 88±5 | 97±3 | 83±1 | 66±4 | 83±8 | 58±7 | 73±6 | 51±6 | 56±1 |
| ERK1 | 82±2 | 95±4 | 96±5 | 85±3 | 98±9 | 110±6 | 106±8 | 87±6 | 88±6 | 89±4 | 104±5 | 97±3 | 78±4 |
| ERK2 | 83±2 | 79±5 | 96±1 | 92±3 | 92±3 | 87±7 | 84±3 | 92±6 | 96±9 | 86±3 | 91±9 | 68±4 | 82±3 |
| JNK1 | 89±5 | 100±4 | 100±2 | 99±14 | 84±4 | 97±6 | 86±4 | 101±0 | 89±4 | 23±1 | 82±9 | 43±4 | 102±7 |
| JNK2 | 88±6 | 96±3 | 102±8 | 99±3 | 69±3 | 92±0 | 93±1 | 98±1 | 93±7 | 24±3 | 73±5 | 29±3 | 97±4 |
| JNK3 | 87±2 | 100±4 | 96±1 | 90±10 | 84±0 | 82±5 | 92±0 | 95±0 | 94±9 | 47±0 | 72±5 | 40±4 | 96±0 |
| p38α MAPK | 96±4 | 95±5 | 104±1 | 95±6 | 93±6 | 93±10 | 89±4 | 101±3 | 102±9 | 110±2 | 72±8 | 63±1 | 82±6 |
| P38β MAPK | 94±3 | 90±2 | 91±5 | 78±5 | 91±1 | 89±7 | 84±6 | 101±2 | 99±8 | 106±2 | 96±5 | 87±8 | 102±1 |
| p38γ MAPK | 99±2 | 94±8 | 98±5 | 84±2 | 103±2 | 82±8 | 98±4 | 96±6 | 79±8 | 86±1 | 78±8 | 46±4 | 102±5 |
| p38δ MAPK | 92±7 | 98±4 | 90±2 | 88±9 | 86±6 | 88±3 | 78±7 | 91±3 | 87±1 | 82±2 | 68±10 | 28±2 | 101±5 |
| ERK8 | 40±5 | 70±6 | 93±2 | 51±1 | 19±5 | 9±1 | 42±6 | 56±2 | 47±2 | 43±1 | 48±3 | 12±2 | 86±6 |
| RSK1 | 97±2 | 74±2 | 31±5 | 55±7 | 85±4 | 62±3 | 66±1 | 91±8 | 97±5 | 55±0 | 71±6 | 40±1 | 51±2 |
| RSK2 | 71±3 | 71±3 | 57±6 | 50±3 | 105±1 | 66±7 | 82±4 | 92±4 | 90±6 | 70±1 | 89±8 | 52±6 | 83±1 |
| PDK1 | 80±8 | 79±5 | 91±4 | 73±7 | 83±1 | 94±8 | 87±3 | 98±6 | 93±11 | 56±6 | 102±6 | 92±9 | 74±3 |
| PKBα | 100±3 | 95±6 | 103±6 | 93±11 | 92±4 | 72±7 | 90±1 | 88±5 | 81±7 | 97±1 | 78±4 | 32±3 | 96±4 |
| PKBβ | 83±4 | 92±3 | 102±3 | 95±1 | 107±1 | 65±14 | 101±9 | 93±1 | 103±8 | 92±1 | 95±7 | 51±5 | 90±5 |
| SGK1 | 75±2 | 82±1 | 80±7 | 80±3 | 96±6 | 80±5 | 75±0 | 91±4 | 105±6 | 28±0 | 92±3 | 69±5 | 57±2 |
| S6K1 | 90±5 | 87±3 | 84±2 | 47±4 | 74±1 | 59±4 | 86±1 | 83±3 | 84±9 | 85±1 | 96±4 | 65±8 | 98±4 |
| PKA | 73±1 | 79±5 | 60±6 | 102±10 | 93±1 | 85±9 | 86±8 | 79±3 | 85±2 | 80±6 | 112±8 | 77±8 | 71±5 |
| ROCK 2 | 90±4 | 93±6 | 86±1 | 68±5 | 99±1 | 67±6 | 69±6 | 80±5 | 59±3 | 92±2 | 80±3 | 32±7 | 97±5 |
| PRK2 | 89±2 | 81±3 | 61±7 | 73±3 | 73±1 | 37±8 | 71±7 | 84±7 | 35±1 | 70±5 | 88±12 | 58±8 | 90±5 |
| PKCα | 89±2 | 77±1 | 93±3 | 87±2 | 77±4 | 92±11 | 77±2 | 88±3 | 67±6 | 68±5 | 89±6 | 80±7 | 90±6 |
| PKCζ | 82±6 | 83±7 | 76±6 | 97±1 | 84±1 | 94±7 | 78±6 | 84±4 | 75±10 | 106±2 | 86±4 | 85±12 | 88±5 |
| PKD1 | 90±4 | 85±7 | 100±4 | 82±5 | 81±4 | 94±6 | 108±4 | 54±5 | 75±2 | 26±0 | 108±10 | 40±11 | 86±4 |
| MSK1 | 78±1 | 89±0 | 86±1 | 74±13 | 91±1 | 64±4 | 99±1 | 82±2 | 86±8 | 72±9 | 89±12 | 69±5 | 85±4 |
| MNK1 | 90±9 | 92±5 | 88±4 | 83±2 | 10±1 | 19±3 | 44±2 | 91±6 | 72±4 | 67±4 | 68±10 | 50±8 | 35±2 |
| MNK2 | 97±2 | 98±1 | 96±2 | 89±6 | 50±7 | 64±1 | 70±2 | 92±2 | 91±3 | 59±5 | 70±6 | 39±4 | 56±2 |
| MAPKAP-K2 | 97±7 | 106±7 | 83±6 | 104±8 | 95±4 | 80±3 | 83±4 | 100±3 | 97±3 | 102±2 | 85±7 | 54±3 | 118±2 |
| MAPKAP-K3 | 86±5 | 88±1 | 87±1 | 103±7 | 102±1 | 102±5 | 95±9 | 94±3 | 92±3 | 103±1 | 105±8 | 96±5 | 104±4 |
| PRAK | 83±4 | 91±2 | 86±2 | 86±13 | 79±2 | 96±6 | 85±5 | 91±7 | 61±6 | 58±9 | 97±8 | 67±3 | 96±4 |
| CAMKKα | 73±5 | 76±1 | 89±4 | 55±5 | 26±0 | 47±6 | 80±1 | 84±1 | 90±4 | 68±7 | 90±11 | 67±8 | 102±2 |
| CAMKKβ | 71±5 | 60±1 | 86±7 | 61±2 | 8±1 | 65±4 | 69±8 | 80±6 | 87±1 | 41±4 | 91±7 | 41±4 | 90±5 |
| CAMK1 | 104±3 | 99±1 | 86±4 | 76±7 | 92±7 | 85±5 | 73±1 | 77±4 | 87±7 | 73±2 | 101±2 | 106±7 | 95±1 |
| SmMLCK | 84±3 | 86±2 | 102±7 | 61±5 | 81±1 | 52±4 | 88±1 | 87±3 | 80±7 | 34±4 | 90±8 | 57±5 | 99±1 |
| PHK | 93±1 | 85±3 | 58±2 | 48±7 | 84±1 | 6±2 | 85±7 | 88±4 | 103±8 | 31±0 | 85±3 | 62±6 | 61±3 |
| CHK1 | 87±5 | 95±4 | 77±3 | 63±1 | 87±0 | 93±5 | 90±5 | 86±3 | 69±9 | 63±3 | 97±1 | 95±9 | 84±6 |
| CHK2 | 93±4 | 94±7 | 93±4 | 16±0 | 90±1 | 95±3 | 102±8 | 86±7 | 93±12 | 44±5 | 95±4 | 64±5 | 95±2 |
| GSK3β | 76±6 | 79±6 | 78±4 | 83±8 | 43±1 | 81±9 | 46±6 | 82±7 | 76±2 | 81±4 | 2±1 | 1±1 | 87±6 |
| CDK2-Cyclin A | 4±0 | 9±1 | 86±2 | 87±6 | 64±2 | 88±3 | 76±0 | 57±4 | 84±7 | 50±1 | 86±6 | 62±5 | 81±1 |
| PLK1 | 91±1 | 81±3 | 94±6 | 83±1 | 83±2 | 106±2 | 98±6 | 95±7 | 99±7 | 80±3 | 106±7 | 43±6 | 91±2 |
| Aurora B | 94±6 | 89±5 | 7±1 | 3±0 | 60±1 | 40±3 | 70±6 | 70±5 | 50±4 | 15±1 | 84±7 | 57±5 | 64±4 |
| Aurora C | 96±4 | 85±3 | 17±1 | 10±0 | 68±4 | 57±7 | 80±6 | 91±5 | 70±2 | 20±3 | 70±6 | 48±7 | 82±4 |
| AMPK | 91±2 | 89±1 | 80±6 | 52±5 | 18±1 | 27±4 | 88±4 | 86±4 | 77±10 | 44±5 | 82±7 | 70±4 | 101±8 |
| MARK3 | 87±5 | 89±8 | 74±3 | 70±6 | 109±1 | 54±3 | 89±4 | 90±6 | 64±5 | 49±5 | 86±9 | 50±7 | 80±1 |
| BRSK2 | 79±4 | 76±6 | 62±1 | 53±2 | 93±4 | 46±4 | 90±1 | 84±4 | 77±2 | 44±8 | 92±7 | 73±6 | 39±8 |
| MELK | 88±7 | 72±3 | 20±1 | 84±6 | 77±5 | 5±0 | 70±1 | 79±3 | 80±5 | 15±4 | 92±3 | 66±7 | 68±6 |
| CK1δ | 76±1 | 103±5 | 104±5 | 57±6 | 68±0 | 43±4 | 92±1 | 55±5 | 91±12 | 15±0 | 71±7 | 51±6 | 30±3 |
| CK2 | 92±7 | 99±1 | 102±1 | 82±8 | 10±1 | 66±5 | 87±1 | 87±4 | 75±6 | 57±4 | 63±6 | 22±3 | 87±3 |
| DYRK1A | 87±5 | 88±7 | 91±6 | 90±7 | 48±1 | 12±1 | 47±2 | 81±2 | 41±1 | 40±1 | 33±3 | 9±2 | 91±6 |
| DYRK2 | 90±4 | 91±4 | 83±2 | 96±12 | 34±1 | 24±7 | 89±1 | 78±2 | 66±4 | 19±1 | 12±1 | 4±3 | 77±3 |
| DYRK3 | 97±2 | 89±4 | 102±5 | 95±8 | 32±1 | 9±1 | 50±3 | 71±2 | 47±6 | 30±8 | 24±3 | 9±5 | 67±5 |
| NEK2a | 85±6 | 95±1 | 90±2 | 87±2 | 84±1 | 74±12 | 85±6 | 90±7 | 90±5 | 78±1 | 83±10 | 81±6 | 91±2 |
| NEK6 | 92±4 | 91±5 | 86±1 | 98±5 | 105±1 | 79±8 | 83±1 | 92±6 | 93±9 | 102±4 | 84±9 | 63±10 | 93±1 |
| NEK7 | 87±5 | 105±5 | 102±1 | 99±9 | 109±1 | 58±5 | 103±4 | 98±5 | 114±1 | 112±7 | 85±7 | 70±5 | 103±7 |
| IKKβ | 80±3 | 89±9 | 84±5 | 90±8 | 78±4 | 98±2 | 4±0 | 29±0 | 28±1 | 49±3 | 94±6 | 86±3 | 85±3 |
| PIM1 | 83±5 | 93±3 | 88±2 | 90±7 | 22±1 | 80±9 | 13±1 | 84±3 | 40±6 | 39±3 | 8±1 | 5±3 | 83±5 |
| PIM2 | 106±4 | 96±6 | 99±3 | 111±12 | 9±3 | 109±8 | 47±1 | 95±1 | 55±2 | 58±2 | 40±5 | 7±2 | 90±1 |
| PIM3 | 83±9 | 91±0 | 77±6 | 66±7 | 1±1 | 85±9 | 9±1 | 64±2 | 25±4 | 17±0 | 3±1 | 2±0 | 54±2 |
| SRPK1 | 84±4 | 79±0 | 82±6 | 67±2 | 60±9 | 78±4 | 88±2 | 92±5 | 82±3 | 84±5 | 96±7 | 72±1 | 98±6 |
| MST2 | 95±5 | 60±3 | 54±2 | 53±3 | 75±0 | 96±4 | 88±7 | 92±7 | 69±6 | 31±4 | 80±4 | 86±3 | 72±6 |
| EF2K | 85±8 | 95±1 | 93±3 | 95±9 | 107±1 | 114±2 | 100±2 | 99±3 | 113±6 | 118±1 | 110±10 | 90±5 | 90±2 |
| HIPK2 | 84±5 | 99±4 | 93±4 | 68±1 | 35±5 | 26±1 | 67±3 | 83±5 | 47±2 | 35±8 | 29±3 | 7±1 | 94±1 |
| HIPK3 | 90±1 | 101±2 | 94±5 | 95±0 | 68±8 | 63±5 | 89±2 | 96±9 | 77±7 | 56±5 | 61±4 | 18±2 | 106±0 |
| PAK4 | 90±3 | 43±0 | 38±1 | 79±7 | 84±1 | 83±4 | 93±1 | 81±4 | 88±4 | 60±4 | 84±11 | 38±3 | 76±4 |
| PAK5 | 74±3 | 53±3 | 60±3 | 88±6 | 86±1 | 93±6 | 87±2 | 84±2 | 82±3 | 82±1 | 86±11 | 54±3 | 87±1 |
| PAK6 | 80±2 | 67±5 | 69±6 | 87±4 | 97±1 | 92±5 | 101±0 | 77±8 | 89±11 | 72±5 | 102±3 | 89±11 | 79±5 |
| Src | 89±2 | 14±2 | 23±3 | 85±1 | 102±1 | 25±2 | 98±5 | 90±7 | 90±6 | 89±1 | 79±4 | 38±3 | 67±6 |
| Lck | 76±2 | 74±5 | 10±4 | 82±5 | 93±1 | 20±2 | 57±3 | 79±4 | 70±7 | 68±2 | 83±5 | 68±7 | 70±6 |
| CSK | 88±4 | 82±2 | 71±7 | 93±8 | 96±5 | 69±6 | 83±1 | 80±0 | 81±2 | 65±4 | 98±4 | 77±6 | 67±1 |
| IKKϵ | ND | ND | ND | 51±8 | ND | 51±7 | 81±3 | 93±2 | 89±4 | ND | ND | ND | ND |
| TBK1 | ND | ND | ND | 34±4 | ND | 45±8 | 87±1 | 93±2 | 93±1 | ND | ND | ND | ND |
| IKKα | ND | ND | ND | ND | ND | ND | 94±1 | 97±1 | 95±5 | ND | ND | ND | ND |