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. 2008 Mar 12;2008:860270. doi: 10.1155/2008/860270

Table 3.

The near-cliques matched with experimentally determined protein complexes cataloged in MIPS. The overlap column represents the number of proteins common to the near-cliques and the protein complexes.

Group ID Group size MIPS tag of protein complex Protein complex size Overlap (common proteins) ln(Poverlap) Main functional categories
3 4 295 2 2 −14.28 42.10/43.01.03.09
5 4 510.190.110 13 3 −16.32 01.03.16.01
6 6 320 8 4 −23.40 11.02.03.04/10.01.09.05/16.03.01
9 22 550.1.149 88 21 −84.60 11.04.01/12.01
12 8 550.1.148 35 8 −39.49 11.04.03.05/16.03.03/11.04.03.01
13 11 550.1.7 10 8 −47.55 10.03.01/14.01/16.01
14 17 140.30 32 11 −46.65 10.03.01
16 4 550.1.44 9 3 −17.55 14.07.02.02/01.05.01.03.02.02
17 3 410.40.20 3 3 −23.36 16.03.01 /16.03.01 /10.01.05.01/10.01.03.05
/10.01.03.01
18 4 440.30.30 11 4 −24.56 11.04.02
21 23 470.20 5 5 −26.71 43.01.03.05/34.11.03.07
23 4 510.160 4 4 −30.36 11.02.03.04.01/01.05.04
24 4 360.10 36 4 −19.38 14.13.01.01/14.07.11
25 36 550.1.138 36 11 −34.43 none
26 4 550.2.317 3 3 −21.98 20.09.07.03/20.09.07.05/14.10
27 10 130 8 4 −20.77 42.04/16.01
28 11 60 11 11 −74.71 14.13.01.01/10.03.01.01.11/14.07.05 /14.10
/16.01 /16.19.03
29 6 120.20 4 4 −27.65 43.01.03.05/40.01/34.07.01/34.01/32.01.09
/11.02.02/10.03.01.01.09/10.03.01.01.03
30 8 550.1.142 25 4 −16.68 12.04
31 4 140.30.30.30 3 2 −13.18 10.03.01/42.04/20.09
32 3 510.20 4 3 −21.98 12.04.02/12.01.01
36 31 230.20.20 16 14 −67.99 11.02.03.04/10.01.09.05
37 4 410.30 16 4 −22.85 16.03.01/10.01.03.03/10.01.03.01/16.19.03
38 6 550.1.81 7 5 −32.29 43.01.03.05/20.09.16.09.03/16.01/20.09.07.27
/10.03.03
40 3 410.30 16 3 −17.03 10.01.03.03/10.01.09.05 /11.02.03.04/16.19.03
/34.11.03.07
44 3 350.10.10 2 2 −14.97 14.10/01.04.01/14.13/16.19.03/20.01.10/20.09.04
45 8 500.10.40 7 6 −38.44 12.04.01
47 4 410.40.30 5 3 −19.67 10.01.05.01/10.01.03.05/10.03.01.03/16.03.01
/18.02.01
48 3 410.40.90 3 3 −23.36 10.01.05.01/10.01.03.05
49 6 290.20.10 5 5 −35.34 20.09.04/20.01.10/14.04/42.16
50 4 550.1.29 16 4 −22.85 32.01/2.19/01.05.01.03.01/01.05.01.01.01
52 3 550.3.82 2 2 −14.97 12.04.03/01.03.16.01
53 13 260.30.20 11 6 −30.15 20.09.07.03
54 8 510.40.10 13 7 −40.63 11.02.03.01/11.02.03.04
58 5 550.2.436 2 2 −13.77 20.09.18
59 5 470.10 6 5 −35.34 01.04.01 /01.05.04/14.07.03/30.01.05
/43.01.03.05/11.02.03.04
61 5 440.12.10 7 5 −34.08 11.04.01/01.03.16.01
64 3 400 10 3 −18.57 43.01.03.09/01.06.01.07.11
66 5 550.1.212 35 5 −24.44 16.19.03/10.01.05.01/01.04.01/16.03.01
67 4 510.190.40 5 4 −28.75 11.04/01.03.16.01/11.02.03.04/34.11.03.07
70 3 440.12.30 3 3 −23.36 11.06.01/11.04.01
72 3 550.1.84 7 3 −19.80 20.09.13/16.01/14.10/20.09.18
74 3 510.180.30.10 2 2 −14.97 42.10.03/32.01.09/16.03.03/10.03.01.03
/10.01.09.05/10.01.05.01
76 7 290.10 9 7 −46.58 20.09.04/20.01.10/14.04/20.03
80 3 550.2.527 2 2 −14.97 30.01.05.01/18.02.01/18.01.01/14.07.03
81 3 260.90 6 3 −20.36 42.04.03/20.09.14/16.07/14.10/16.01/43.01.03.05
82 4 260.80 4 4 −30.35 42.25/20.09.13/20.09.07/20.09.07/20.09.16.09.03
86 4 510.180.20 7 4 −26.80 34.11.03.07/10.01.05.03.01/10.01.05.01/10.03.02
87 3 550.1.74 4 3 −21.97 20.09.07/42.04.03
89 3 550.2.321 6 3 −20.36 16.19.03 /14.13.01.01/14.07.11/01.04.01
91 3 550.2.317 3 3 −23.36 16.03.01/11.02.01/11.02.02
95 3 90.30 2 2 −14.97 34.01.01.03/14.10
96 4 110 4 4 −30.35 43.01.03.05/11.02.03.04/16.19.01/30.01.09.07
/14.07.03/01.04.01
97 3 260.30.30.20 2 2 −14.97 14.04 /20.09.07.05
100 12 140.20.30 7 4 −20.60 43.01.03.05/42.04/40.01
101 6 550.3.12 7 4 −24.09 10.03.01.01.03/43.01.03.05/30.01.05.01/14.07.03
102 9 445.20 4 4 −25.52 16.01/16.19.03/10.03.01.01.03/14.13.01.01/14.10
/14.07.05
103 7 140.20.20 25 5 −23.21 43.01.03.05/40.01/16.01/42.04.03/20.09.18.09.01
104 5 140.20.30 7 4 −25.19 43.01.03.05/42.01/32.01.03/20.09.18.09.01
105 11 260.60 10 10 −66.33 20.09.07.03
106 7 270.20.40 4 3 −18.42 10.03.04.03
108 9 133.10 10 7 −41.79 10.03.01.01/18.02.01
110 3 140.30.30 14 3 −17.46 20.09.14/10.03.05.01/10.03.04.09/10.03.01.01.11
/02.45.11
112 5 270.20.20 3 3 −21.05 10.03.04.05/16.01
113 5 270.20.10 3 3 −21.05 10.03.04.05