Table 3. Target gene fold induction by aRA in lung and breast cancer cells treated with 10 μM aRA.
Calu6 (SK-MES-1)
|
T47D (MDA-MB-231)
|
||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene description | GeneBank accession | 1 h | 24 h | 3 days | 7 days | 1 h | 24 h | 3 days | 7 days |
RGS16 | AA453774 | 2.1 (—) | 1.4 (—) | 1.6 (—) | 1.4 (—) | 3.2 (—) | 2.7 (—) | 1.7 (—) | 1.4 (—) |
RARβ2 | AA419238 | 1.5 (—) | 7.5 (—) | 8.6 (—) | 9.8 (—) | 1.2 (—) | 12 (—) | 13 (—) | 22 (—) |
CYP26A1 | R51021 | 2.7 (—) | 7.0 (—) | 7.1 (—) | 7.1 (—) | 1.1 (—) | 11 (—) | 11 (—) | 17 (—) |
CRBP1 | AA700832 | 1.1 (1.5) | 1.4 (1.6) | 1.5 (1.7) | 2.0 (2.0) | 1.5 (1.5) | 2.5 (1.6) | 2.7 (1.9) | 5.3 (2.0) |
ATP7A | AA236141 | 1.1 (0.9) | 1.1 (0.8) | 0.9 (1.0) | 1.3 (1.0) | 1.1 (1.0) | 1.1 (1.1) | 0.9 (1.2) | 1.3 (1.1) |
DUSP6 | AA630374 | 1.1 (1.1) | 1.3 (1.1) | 1.4 (1.1) | 1.4 (1.3) | 1.1 (0.9) | 1.4 (1.0) | 1.6 (1.0) | 2.0 (0.9) |
EGR1 | AA486533 | 4.0 (—) | 0.8 (—) | 1.5 (—) | 1.5 (—) | — (—) | — (—) | — (—) | — (—) |
RET | H24956 | 1.0 (0.9) | 0.6 (0.8) | 0.1 (1.0) | 0.1 (0.9) | 1.5 (—) | 1.6 (—) | 1.6 (—) | 1.6 (—) |
PLAT | AA447797 | 1.0 (0.9) | 1.0 (1.0) | 0.5 (1.0) | 0.5 (0.8) | 0.8 (0.9) | 1.5 (1.0) | 1.6 (0.8) | 1.5 (0.9) |
FLNB | AA486239 | 1.0 (1.0) | 1.2 (1.2) | 1.7 (1.1) | 1.7 (1.0) | 1.1 (1.1) | 1.1 (1.3) | 1.3 (1.0) | 1.2 (1.0) |
DLK1 | AA576129 | — (—) | — (—) | — (—) | — (—) | 1.0 (—) | 0.9 (—) | 0.7 (—) | 0.8 (—) |
SMAD3 | W72201 | 1.0 (1.0) | 1.0 (1.0) | 1.0 (1.0) | 1.0 (1.0) | 1.1 (1.0) | 1.1 (1.0) | 1.0 (1.0) | 1.0 (0.9) |
Calu6 and T47D cells are RA sensitive, while SK-MES-1 and MDA-MB-231 are RA resistant. (—) represents undetectable by PCR.