Table 1.

Running time and error rates of fastPHASE on chromosome 6

			Error rate
Individuals	Missing	Running time (sec)	Genotype inference	Heterozygous switch	Point-wise
100	0.00	1437	------a	0.4835	0.1569
100	0.05	1563	0.1106	0.4926	0.1618
100	0.10	1380	0.1202	0.4967	0.1639
100	0.15	1671	0.1267	0.4829	0.1614
200	0.00	4679	------	0.4964	0.1609
200	0.05	4620	0.0922	0.4960	0.1620
200	0.10	4673	0.0979	0.4966	0.1635
200	0.15	4382	0.1064	0.4961	0.1631
400	0.00	9417	------	0.5035	0.1634
400	0.05	9411	0.0904	0.5093	0.1666
400	0.10	9360	0.0966	0.4880	0.1609
400	0.15	8524	0.1024	0.4959	0.1652

^a------, Inference error rate is not measured because no missingness exists in this row.