Table 5.

Conservation of gene-associated repeats

				Cytochrome Associated Genes
Organism	rbcS	rps10	atpA	petA	B/D	F	G	J	L	M/N	cssA
Heterosigma akashiwo CCMP452	IR	T/IR	T	IR	IR	IR	IR	IR	-	IR#	IR
Heterosigma akashiwo NIES293	IR	-	T	IR	IR	IR	IR	IR	-	IR#	IR
(C) Odontella sinensis	IR	IR	IR	IR/T*	-	IR/T*	IR/IR	0	-	IR#	-
(C) Thalassiosira pseudonana	-	T/IR	IR/T	IR	-	-	-	0	-	IR	-
(P) Phaeodactylum tricornutum	IR	IR	IR	IR*	IR	IR*	-	0	IR#	-	-
Emiliana huxleyi	IR	IR	-	IR	-	0	IR	0	-	-	IR
Guillardia theta	IR	T/IR*	-	IR	T	T*	IR#	0	-	-	IR#
(F) Graciliaria tenuistipitata	-	IR*	-	-	IR	IR*	-	IR	0	-	-
(F) Porphyra purpurea	-	IR	IR	-	IR	-	IR	IR	-	-	-
(F) Porphyra yezoensis	IR	IR	IR	-	-	-	IR/T	IR	-	-	-
(B) Cyanidium caldarium	IR	-	-	-	-	T	-	-	0	-	-
(B) Cyanidioschyzon merolae	IR	-	T/T	T	-	T#	-	-	-	-	T/T
Cyanophora paradoxa	IR	IR	IR	IR	IR	IR	IR	0	IR	IR	IR

IR: inverted repeat; T: tandem repeat; – no repeat; 0 gene absent from cpDNA ; * shared repeat; # located 5' to the gene. All other repeats are 3' to the gene.