Table 2. Composite karyotype for each tumour sample and cell line.

Sample	Composite karyotype
SCC-1 ♂	48–57 1 × 2, der(1)t(1;X;6), 2 × 2, der(2)t(10;2;11), 3 × 2, der(3)t(3;10), 4, der(?)t(4;13) × 2 (two different translocations), 5 × 2, del(5?q), der(?)t(5;22), ?i(5p), 6 × 2, der(6)t(1;6), 7 × 2, der(7)t(7;12), der(?)t(7;12), 8, der(8)t(Y;8), 9 × 2, der(10)t(5;10), 11, der(?11)t(11;16;11), 12 × 2, 13 × 2, 14 × 2, der(14)t(5;14), 15 × 2, 16 × 2, 17 × 2, 18 × 2, 19 × 2, 20 × 4, ?i(21q), 22, der(X)t(X;11), der(X)t(X;12;7;1) [cp7]
SCC-2 ♂	37–48 1 × 2, ?del(2p), der(2)t(2;9), ?del(3p) × 2, 4, der(4)t(4;5), 5, ?i(5p), 6, 7 × 2, 8, der(8)t(8;11), 9, der(9)t(5;9), 10, der(10)t(8;10;3), 11, der(?11)t(11;5;12;7), der(?11)t(11;5;14), der(11)t(11;18), 12, der(12), 13, i(13q), 14, der(14)t(14;18), 15 × 2, 16, der(16)t(16;19), ?del(17p) × 2, 18, der(?18)t(18;11;8;6), der(?18)t(6;18) × 2, 19, der(19)t(8;19), 20 × 2, 21 × 2, 22, der(22)t(5;22;1), X, Y [cp8]
AC-1 ♀	70–90 1 × 4, der(1)t(1;9), 2 × 2, der(2)t(20;6;2) × 2, der(2)t(2;5), der(2)t(2;3), der(2)t(2;4), 3 × 3, der(3)t(3;9), der(3)t(3;16), 4 × 2, der(4)t(4;12), der(4)t(4,13), 5 × 2, der(5)t(5;6), der(5)t(5;17), 6 × 3, der(6)t(6;11) × 2, 7 × 3, der(7)t(7;18) × 2, der(7)t(7;22) × 2, 8 × 2, der(8)t(13;8;13) × 2, 9, der(9)t(9;14;11) × 3, der(9)t(9;14) × 2, 11 × 4, 12 × 3, der(12)t(4;12), 14, der(15)t(5;15), der(15)t(15;17) × 2, der(16)t(16;21) × 2, 17, der(17)t(10;17), 18 × 2, 19 × 4, 20 × 4, der(21)t(5;21), 22 × 2, der(22)t(22;18;22;18), X, der(X)t(X;4) [cp6]
AC-2 ♂	24–47 1, der(?1)t(1;12;2), der(?1)t(6;1;14;5), der(2)t(7;2;21), der(2)t(2;15), 3, del(3p), der(3), der(4)t(4;10), der(4)t(5;19;5;19;4;5;11), der(4)t(7;19;5;19;4;6;5;11), der(5)t(5;17), der(6)t(1;6), der(6)t(6;15), i(6p), der(8)t(1;8), der(8)t(5;8), der(8)t(8;12), der(9)t(4;9), der(9)t(7;9), der(9)t(9;17), 10, der(10)t(10;15), der(10)t(10;19;17), der(11)t(5;11), der(12)t(12;8;12;5;19;11;19), der(12)t(3;12), der(15)t(8;15), 16, der(16)t(19;5;12;5;16;4;19;5;19;7), 17, 18, der(19)t(8;19), 20 × 3, der(?21)t(12;21), der(22)t(3;22), der(22)t(14;22), der(X)t(3;X), der(X)t(5;X) [cp6]
COR-L105 (AC) ♂	18–39 der(1)t(1; 11), der(1)t(1;6), 2 × 2, der(3)t(3;21), der(3)t(3;X;4;X), 4, 5, 6, 7, der(7)t(7;10), 8, 9, 10, der(10)t(7;10), der(11)t(5;11), 12, 13, 14, der(14)t(8;14), der(14)t(12;14), 15, der(15)t(15;12;8), 16, der(16)t(3;16), 17, 18, 19, der(19)t(16;19), 20, 21, 22 [cp9]
COR-L23 (LCC) ♂	97–105 l × 4, 2 × 4, 3 × 4, der(3), der(3)t(1;3), 4 × 4, 5 × 4, ?i(5p) × 2, 6 × 4, 7 × 4, 8 × 6, 9 × 4, 10 × 4, 11 × 6, 12 × 5, 13 × 4, 14 × 6, 15 × 4, 16 × 6, 17 × 4, 18 × 4, 19 × 4, 20 × 6, 21 × 4, 22 × 4, X × 2, der(X)t(X;15) × 2 [cp6]

Bold numbers at the beginning of each karyotype are the range of chromosome numbers for the spreads analysed, numbers in square brackets are the number of spreads used to compile the composite karyotype. The number of each chromosome or altered chromosome given is the modal number. Bold text represents translocations that may be reciprocal.