Table 2.
Thermal cycling and premelting protocols
| Gene/Amplicon (bp) | Initial denature | Denature | Anneal | Cycles | Premelting protocol | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Time (min:s) | Temp (°C) | Time (min:s) | Temp (°C) | Time (min:s) | Temp (°C) | Time (min:s) | Temp (°C) | Time (min:s) | Temp (°C) | ||
| CPS1 51 bp | 2:00 | 95 | 0:30 | 94 | 0:30 | 66 | 45 | 0:30 | 94 | 0:30 | 28 |
| OTC 68 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 65 | 50 | ” | ” | ” | ” |
| MSH2 49 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 64 | 44 | ” | ” | ” | ” |
| PAH 59 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 67 | 45 | ” | ” | ” | ” |
| CHK2 42 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 64 | 45 | ” | ” | ” | ” |
| CHK2 50 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 66 | 45 | ” | ” | ” | ” |
| CHK2 86 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 66 | 45 | ” | ” | ” | ” |
| BX647987 58 bp | ” | ” | ” | ” | ” | 63 | 45 | ” | ” | ” | ” |