TABLE 2.
NCBI designation | No. of sequences for RDP designation:
|
Total | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Actinobacteria
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Bacteroidetes
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Firmicutes
|
||||||||||||
Atopobium | Coriobacteriaceae | Eggerthella | Gardnerella | Mobiluncus | Olsenella | Slackia | Porphyromonas | Tannerella | Prevotella | Acetivibrio | Lachnospiraceae | Shuttleworthia | ||
Actinobacteria | ||||||||||||||
Atopobium | 4 | 9 | 12 | 25 | ||||||||||
Bifidobacterium | 110 | 110 | ||||||||||||
Coriobacteriaceae | 4 | 2 | 6 | |||||||||||
Eggerthella | 10 | 4 | 14 | |||||||||||
Gardnerella | 8 | 8 | ||||||||||||
Mobiluncus | 5 | 5 | ||||||||||||
Olsenella | 20 | 17 | 37 | |||||||||||
Slackia | 2 | 4 | 4 | 10 | ||||||||||
Bacteroidetes | ||||||||||||||
Bacteroidales | 3 | 3 | ||||||||||||
Porphyromonas | 24 | 24 | ||||||||||||
Prevotella | 171 | 171 | ||||||||||||
Firmicutes | ||||||||||||||
Acetivibrio | 1 | 1 | ||||||||||||
Butyvibrio | 1 | 1 | ||||||||||||
Clostridium | 34 | 34 | ||||||||||||
Eubacterium | 14 | 14 | ||||||||||||
Lachnospira | 1 | 2 | 3 | |||||||||||
Lachnospiraceae | 7 | 7 | ||||||||||||
Roseburia | 3 | 3 | ||||||||||||
Ruminococcus | 1 | 1 | ||||||||||||
Shuttleworthia | 76 | 76 | ||||||||||||
OTU_171 | 3 | 1 | 18 | 5 | 27 | |||||||||
Total | 6 | 47 | 6 | 118 | 5 | 29 | 4 | 24 | 3 | 175 | 60 | 25 | 78 | 580 |