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. Author manuscript; available in PMC: 2008 Sep 2.
Published in final edited form as: Hum Immunol. 2006 Oct 30;68(1):12–25. doi: 10.1016/j.humimm.2006.10.003

TABLE 1.

Polymorphic and monomorphic residue positions in three-Angstrom patches on HLA-DRB1, -DRB3, -DRB4 and -DRB5 alleles*

Class II Locus Sequence position Molecular location Surface exposure 3.0 Angstrom patches
DRB 4 Side ++ 3 4 5
DRB 6 Side + 5 6 7 A15 A17
DRB 12 Underside ± 11 12 13 29
DRB 14 Underside + 13 14 15 16 27 29
DRB 16 Underside + 15 16 17 18 25
DRB 18 Side + 17 18 19 23
DRB 25 Side ++ 16 24 25 26 43
DRB 26 Side ± 25 26 27 42
DRB 31 Underside + 10 29 30 31 32
DRB 32 Underside + 31 32 33 35
DRB 33 Underside + 8 32 33 34
DRB 34 Side ++ 33 34 35 A83
DRB 40 Side + 28 39 40 41
DRB 41 Side + 40 41 42 43 44 45
DRB 44 Side + 41 43 44 45
DRB 47 Side + 28 46 47 48 62
DRB 48 Side ++ 47 48 49
DRB 51 Side + 37 50 51 52
DRB 57 Top + 56 57 58 61 A76 P13
DRB 58 Top + 54 57 58 59 62
DRB 59 Top ++ 58 59 60
DRB 60 Top ++ 59 60 61 63
DRB 67 Top + 66 67 68 71
DRB 70 Top + 67 69 70 71 73 P11
DRB 71 Top ± 70 71 72 73
DRB 73 Top + 69 72 73 74 76 77
DRB 74 Top + 70 71 72 73 74 79 P8 P9
DRB 76 Top ++ 73 75 76 77
DRB 77 Top ++ 73 76 77 78 P6
DRB 81 Top + 80 81 82 85 P4
DRB 85 Top + 84 85 86
DRB 86 Side ± 82 85 86 87 90
DRB 96 Side ++ 95 96 97 180
DRB 98 Side ++ 97 98 99 120
DRB 104 Side + 103 104 105 107 114
DRB 105 Side ++ 104 105 106 107
DRB 108 Side ++ 107 108 109
DRB 112 Bottom ++ 108 111 112 113
DRB 120 Side + 98 119 120 121
DRB 133 Bottom ++ 132 133 134
DRB 135 Bottom ++ 134 135 136
DRB 140 Side ++ 139 140 141
DRB 142 Side ++ 138 141 142 143
DRB 149 Side ++ 148 149 150
DRB 180 Side + 96 177 179 180 181
DRB 181 Side ++ 180 181 182
DRB 183 Side + 182 183 184
DRB 187 Side ++ 186 187 188
DRB 189 Bottom ++ 188 189 190
*

Polymorphic positions are marked in bold, underlined font.