TABLE 3.

Polymorphic and monomorphic residue positions in three-Angstrom patches on HLA-DQA1 alleles^*

Class II Locus	Sequence position	Molecular location	Surface exposure	3.0 Angstrom patches
DQA	2	Side	++	1	2	3
DQA	18	Side	++	17	18	19	B7
DQA	21	Side	+	20	21	22
DQA	25	Side	±	14	24	25	26	27	37	P5
DQA	40	Side	+	39	40	41
DQA	41	Side	++	38	40	41	42
DQA	44	Side	++	43	44	45
DQA	45	Side	+	36	44	45	46
DQA	47	Side	+	34	46	47	48
DQA	48	Side	+	47	48	49	51
DQA	50	Side	++	49	50	51
DQA	51	Underside	+	48	50	51	52	53
DQA	52	Side	+	49	51	52	53
DQA	53	Top	++	51	52	53	54
DQA	54	Top	++	51	53	54	55
DQA	55	Top	+	54	55	56
DQA	56	Top	++	53	55	56	57
DQA	59	Top	+	58	59	60	61	62
DQA	61	Top	++	58	59	60	61	62	65
DQA	64	Top	++	60	63	64	65
DQA	66	Top	+	62	65	66	67	70
DQA	69	Top	±	65	68	69	70
DQA	75	Top	++	74	75	76	79
DQA	76	Top	±	72	75	76	77	80
DQA	79	Top	++	75	78	79	80	B32
DQA	80	Side	±	75	79	80	81
DQA	107	Side	+	97	106	107	108
DQA	129	Side	++	126	128	129	130
DQA	130	Side	+	129	130	131
DQA	138	Side	+	137	138	139	141
DQA	139	Side	+	33	138	139	140	141
DQA	153	Side	+	136	152	153	154	B150
DQA	156	Bottom	+	106	155	156	157
DQA	160	Bottom	+	159	160	161
DQA	161	Bottom	++	160	161	162
DQA	163	Bottom	+	127	162	163	164
DQA	175	Side	++	174	175	176

^*Polymorphic positions are marked in bold, underlined font.