Skip to main content
. 2008 Oct 14;3(10):e3401. doi: 10.1371/journal.pone.0003401

Table 4. Descriptive statistics for the ten microsatellite loci at 22 sites of S. hystrix.

Population Locus Sh4-001 Sh2-002 Sh3-003 Sh3-004 Sh2-005 Sh2-006 Sh3-007 Sh3-008 Sh3-009 Sh4-010
Osprey N 36 36 36 36 36 36 36 36 36 36
A 3 12 2 6 2 4 4 2 4 4
HE 0.06 0.78 0.50 0.64 0.22 0.50 0.50 0.03 0.61 0.19
HO 0.05 0.84 0.50 0.66 0.38 0.56 0.60 0.03 0.61 0.41
FIS −0.007 0.084 0.011 0.046 0.419 0.115 0.181 - 0.008 0.536
Yonge N 48 48 48 48 48 45 48 48 48 48
A 4 7 3 5 3 8 4 2 3 7
HE 0.81 0.79 0.10 0.71 0.29 0.91 0.58 0.00 0.38 0.42
HO 0.66 0.80 0.10 0.59 0.25 0.72 0.60 0.04 0.36 0.44
FIS −0.213 0.024 −0.035 −0.181 −0.147 −0.255 0.033 - −0.025 0.060
Ribbon 10 N 49 49 49 49 48 45 48 49 48 48
A 6 9 5 6 3 10 4 3 5 7
HE 0.76 0.69 0.16 0.59 0.25 0.76 0.56 0.02 0.60 0.38
HO 0.68 0.72 0.15 0.59 0.22 0.69 0.53 0.06 0.49 0.36
FIS −0.101 0.051 −0.046 0.000 −0.120 −0.081 −0.056 0.664 −0.220 −0.019
Ribbon 8 N 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50
A 5 8 1 3 5 7 4 1 5 8
HE 0.58 0.74 0.00 0.48 0.24 0.66 0.56 0.00 0.34 0.66
HO 0.57 0.82 0.00 0.51 0.22 0.69 0.50 0.00 0.36 0.63
FIS −0.005 0.106 - 0.061 −0.072 0.051 −0.111 - 0.062 −0.032
Ribbon 5_2005 N 49 48 49 49 49 49 49 49 49 49
A 4 10 5 2 3 4 4 1 4 5
HE 0.55 0.92 0.14 0.55 0.18 0.59 0.41 0.00 0.45 0.41
HO 0.59 0.82 0.14 0.50 0.20 0.66 0.49 0.00 0.45 0.42
FIS 0.075 −0.107 −0.039 −0.092 0.106 0.112 0.185 - 0.017 0.048
Ribbon 5_2003 N 28 28 28 28 29 29 29 29 29 29
A 4 5 2 7 5 10 5 3 4 5
HE 0.61 0.57 0.21 0.71 0.45 0.66 0.10 0.10 0.66 0.69
HO 0.66 0.70 0.44 0.73 0.74 0.75 0.36 0.10 0.66 0.69
FIS 0.092 0.201 0.522 0.041 0.411 0.144 0.718 −0.024 0.019 0.013
Lizard 1 N 36 40 40 25 42 42 42 42 42 42
A 5 7 2 2 4 6 4 1 4 5
HE 0.50 0.57 0.03 0.60 0.21 0.60 0.45 0.00 0.50 0.55
HO 0.54 0.55 0.02 0.47 0.24 0.48 0.61 0.00 0.56 0.56
FIS 0.096 −0.024 - −0.254 0.109 −0.220 0.270 - 0.125 0.027
Lizard 2 N 53 54 54 51 54 54 54 54 54 54
A 6 17 4 6 12 7 6 4 5 9
HE 0.19 0.83 0.07 0.61 0.72 0.85 0.43 0.26 0.59 0.46
HO 0.27 0.86 0.39 0.69 0.69 0.69 0.52 0.26 0.70 0.58
FIS 0.320 0.036 0.814 0.125 −0.037 −0.229 0.188 0.002 0.167 0.216
Lizard 3 N 50 48 50 49 50 50 50 50 50 50
A 4 6 2 3 3 7 4 1 5 8
HE 0.56 0.63 0.02 0.37 0.04 0.60 0.48 0.00 0.54 0.52
HO 0.61 0.63 0.02 0.38 0.04 0.54 0.54 0.00 0.54 0.54
FIS 0.084 0.018 - 0.041 −0.005 −0.109 0.123 - 0.012 0.053
Emily N 50 50 50 50 50 50 50 50 50 49
A 6 19 3 7 9 11 4 3 6 7
HE 0.40 0.78 0.06 0.48 0.38 0.64 0.32 0.04 0.14 0.31
HO 0.62 0.83 0.30 0.71 0.62 0.79 0.60 0.04 0.40 0.54
FIS 0.364 0.067 0.803 0.331 0.400 0.196 0.473 −0.005 0.658 0.440
Agincourt N 49 49 49 49 49 49 49 49 49 49
A 7 16 3 8 6 9 5 3 8 4
HE 0.27 0.73 0.37 0.47 0.45 0.78 0.35 0.04 0.69 0.18
HO 0.46 0.80 0.49 0.58 0.61 0.65 0.49 0.04 0.80 0.45
FIS 0.429 0.090 0.260 0.197 0.269 −0.180 0.296 −0.005 0.147 0.596
Tongue 1 N 49 49 49 49 50 50 50 50 50 50
A 3 5 5 3 4 7 2 1 2 4
HE 0.51 0.73 0.08 0.47 0.32 0.56 0.40 0.00 0.04 0.18
Ho 0.49 0.63 0.12 0.50 0.29 0.55 0.40 0.00 0.04 0.17
FIS −0.021 −0.149 0.316 0.074 −0.100 −0.016 0.018 - −0.010 −0.059
Tongue 2 N 45 45 45 45 42 44 44 44 43 44
A 5 14 2 6 11 6 3 3 5 7
HE 0.31 0.44 0.04 0.38 0.21 0.66 0.34 0.05 0.14 0.36
HO 0.57 0.54 0.08 0.46 0.43 0.69 0.58 0.04 0.19 0.35
FIS 0.465 0.189 0.485 0.188 0.506 0.062 0.417 −0.006 0.288 −0.027
Sudbury 1 N 42 42 42 42 42 42 42 42 41 42
A 4 4 3 2 3 7 2 1 5 5
HE 0.74 0.40 0.05 0.60 0.24 0.55 0.38 0.00 0.12 0.38
HO 0.65 0.52 0.05 0.50 0.28 0.56 0.34 0.00 0.12 0.38
FIS −0.122 0.237 −0.006 −0.180 0.175 0.031 −0.119 - −0.028 0.009
Sudbury 2 N 47 47 47 47 47 47 47 47 47 47
A 4 2 2 2 4 9 3 2 2 3
HE 0.49 0.49 0.02 0.49 0.17 0.64 0.13 0.02 0.09 0.28
HO 0.53 0.37 0.02 0.44 0.20 0.61 0.12 0.02 0.08 0.31
FIS 0.086 −0.314 - −0.096 0.139 −0.035 −0.047 - −0.034 0.113
Flora N 42 42 42 42 42 42 42 42 42 42
A 7 14 3 7 6 5 6 4 7 6
HE 0.74 0.86 0.45 0.48 0.48 0.24 0.36 0.33 0.33 0.38
HO 0.75 0.86 0.66 0.70 0.54 0.29 0.33 0.51 0.54 0.51
FIS 0.029 0.020 0.321 0.330 0.130 0.204 −0.058 0.351 0.387 0.269
Myrmidon N 49 49 49 49 49 49 49 49 49 49
A 3 9 1 2 6 5 3 2 6 4
HE 0.67 0.84 0.00 0.47 0.14 0.71 0.41 0.02 0.06 0.33
HO 0.54 0.69 0.00 0.47 0.26 0.69 0.52 0.02 0.16 0.35
FIS −0.181 −0.185 - 0.023 0.447 −0.007 0.261 - 0.581 0.160
Cattle Bay N 47 47 47 47 47 47 47 47 47 47
A 3 4 1 2 4 4 3 3 2 6
HE 0.38 0.49 0.00 0.30 0.28 0.51 0.62 0.04 0.17 0.49
HO 0.34 0.55 0.00 0.28 0.28 0.55 0.49 0.04 0.16 0.49
FIS −0.105 +0.122 - −0.044 0.020 0.090 −0.261 −0.005 −0.082 0.011
Davies 1 N 42 42 42 42 42 42 42 42 42 42
A 4 4 2 2 4 6 4 3 2 5
HE 0.48 0.48 0.02 0.57 0.50 0.50 0.55 0.07 0.07 0.67
HO 0.44 0.39 0.02 0.47 0.48 0.63 0.48 0.07 0.07 0.61
FIS −0.080 −0.200 - −0.200 −0.024 0.212 −0.123 −0.017 −0.025 −0.080
Davies 2 N 44 44 44 44 44 44 44 44 44 44
A 7 14 4 7 8 5 5 3 6 7
HE 0.43 0.45 0.18 0.50 0.32 0.55 0.41 0.14 0.20 0.50
HO 0.60 0.68 0.35 0.70 0.49 0.59 0.68 0.13 0.46 0.72
FIS 0.285 0.337 0.487 0.298 0.358 0.081 0.410 −0.045 0.562 0.314
Davies 3 N 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48
A 3 4 2 3 4 3 2 1 3 5
HE 0.42 0.56 0.04 0.56 0.33 0.54 0.48 0.00 0.13 0.63
HO 0.36 0.55 0.04 0.52 0.36 0.62 0.44 0.00 0.12 0.65
FIS −0.154 −0.015 −0.011 −0.073 0.090 0.135 −0.085 - −0.046 0.048
Big Broadhurst N 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51
A 8 12 3 5 7 7 5 4 8 7
HE 0.47 0.63 0.20 0.63 0.45 0.45 0.45 0.16 0.33 0.49
HO 0.70 0.68 0.46 0.73 0.63 0.55 0.71 0.22 0.59 0.70
FIS 0.338 0.090 0.584 0.151 0.293 0.182 0.378 0.285 0.444 0.312
Total sample (1014 individuals) A 11 32 9 12 25 19 13 8 13 15
Allele range 130–190 128–186 82–103 138–189 104–158 105–141 104–142 210–249 148–206 210–278

N = number of samples per locus and population, A = number of alleles, HE = expected heterozygosity, HO = observed heterozygosity, FIS = inbreeding coefficient [55] (values in italics are statistically significant after FDR correction following [50]).