TABLE 2.
Mutations detected in the HA proteins of 10 sister clones of A/HK/1/68 derived by independent mouse adaptations
| Virusa | Clone no. | Mutationb in indicated protein at indicated aa position
|
||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| nt
|
HA1
|
HA2
|
||||||||||||||||||||
| 669 | 124 | 162 | 165 | 192 | 210 | 218 | 220 | 223 | 231 | 238 | 242 | 244 | 262 | 268 | 29 | 117 | 124 | 154 | 160 | 175 | ||
| A/HK/1/68 | G/A | G | P | N | T | Q | G | R | V | S | K | V | V | T | M | S | K | R | N | D | G | |
| HK1MA21 | 1 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | R | − | − | − | − |
| HK1MA21 | 2 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK1MA21 | 3 | G | − | − | − | − | − | − | S | − | − | − | − | − | − | − | Y | − | − | − | − | − |
| HK2MA21 | 1 | A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK2MA21 | 2 | A | − | − | − | − | R | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK2MA21 | 3 | A | − | S | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK4MA21 | 1 | G | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK4MA21 | 2 | G | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK4MA21 | 3 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK5MA21 | 1 | A | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | D |
| HK5MA21 | 2 | A | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | V | − | − | − | − | − | − |
| HK5MA21 | 3 | A | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK6MA21 | 1 | A | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK6MA21 | 2 | A | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK6MA21 | 3 | A | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK8MA21 | 1 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK8MA21 | 2 | G | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | K | − | − |
| HK8MA21 | 3 | G | − | − | − | − | − | E | − | − | − | N | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK9MA21 | 1 | A | − | − | − | − | − | − | − | − | N | − | − | − | N | − | − | − | − | − | − | − |
| HK9MA21 | 2 | A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | N | − | − | − | − | − | − | − |
| HK9MA21 | 3 | A | − | − | − | − | − | − | − | I | N | − | − | − | N | − | − | − | − | − | − | − |
| HK10MA21 | 1 | G | − | − | − | A | R | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK10MA21 | 2 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | K | − | − | − |
| HK10MA21 | 3 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK11MA21 | 1 | G | D | − | D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK11MA21 | 2 | G | D | − | D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK11MA21 | 3 | G | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | E | − | − | − | − | − | − | − | − |
| HK12MA21 | 1 | G | − | − | − | − | R | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | N | − |
| HK12MA21 | 2 | G | − | − | − | − | R | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | N | − |
| HK12MA21 | 3 | G | − | − | − | − | R | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | N | − |
a
Each passage series is designated with “HK,” then the sister clone number, then “MA,” and then the mouse passage number.
b
Bold font indicates convergent mutations. − indicates identity with the parental virus sequence. nt, nucleotide.