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. Author manuscript; available in PMC: 2008 Dec 17.
Published in final edited form as: J Struct Biol. 2006 Oct 24;158(1):59–70. doi: 10.1016/j.jsb.2006.10.015

Table I.

Assessment of Resolution We estimated resolution before and after the application of local refinement using the even/odd FSC criterion, in maps calculated from conical (a), dual (b) and single (c) axis geometries. In each case we cut the FSC curve using either the 0.3 criterion or 0.5 criterion. For conical and dual axis geometries we report the mean, minimum and maximum value of the 64 cubes as well as the local resolution in the 8×8 cubes of the reconstruction. The locations of the values in the table correspond to the locations of the cubes in the map. Notice the stronger improvement at the periphery of the volume. For single axis series, only the mean, minimum and maximum value of the 64 cubes are included. All values reported are expressed in nm.

(a) Conical geometry.
Global Refinement (0.3 criterion) Local Refinement (0.3 criterion)
Ave. min. Max. Ave. min. Max.
4.7 3.5 8.0 3.6 3.3 5.3
8×8 sub-volumes 8×8 sub-volumes
5,7 5,1 5,2 4,9 4,7 5,2 5,9 6,3 4,0 3,7 3,6 3,6 3,4 3,7 4,1 4,2
5,6 4,9 4,3 4,3 4,5 4,6 4,8 5,4 3,7 3,6 3,6 3,6 3,4 3,5 3,7 4,1
5,1 4,5 3,9 3,8 3,9 3,9 4,2 4,8 3,6 3,6 3,4 3,4 3,4 3,4 3,4 4,0
4,8 3,8 3,6 3,6 3,7 3,6 4,0 4,6 3,5 3,4 3,4 3,4 3,3 3,3 3,3 3,6
4,7 3,9 3,5 3,5 3,6 3,7 3,7 4,3 3,6 3,5 3,4 3,4 3,3 3,3 3,3 3,5
5,2 4,8 4,5 3,7 3,7 3,8 4,4 5,1 3,9 3,7 3,7 3,4 3,4 3,3 3,4 3,7
5,5 5,2 4,9 4,8 4,6 4,6 4,9 5,6 3,7 3,6 3,6 3,7 3,6 3,4 3,3 4,1
5,9 5,1 5,5 5,9 5,6 6,2 6,3 8,0 4,1 3,5 3,6 3,9 3,8 4,1 3,8 5,3
Global Refinement (0.5 criterion) Local Refinement (0.5 criterion)
Ave. min. Max. Ave. min. Max.
6.4 4.6 10.4 5.2 4.2 8.1
8×8 sub-volumes 8×8 sub-volumes
7,4 7,2 6,8 6,8 6,3 7,3 7,9 8,1 5,7 5,2 5,5 5,5 4,7 5,6 6,2 6,2
7,3 6,5 6,2 6,2 5,9 6,2 7,0 7,3 5,5 5,1 4,9 4,9 5,1 5,1 5,5 6,3
6,9 6,1 5,5 5,2 5,2 5,7 5,6 6,8 5,4 4,9 4,6 4,8 4,7 4,6 4,6 5,8
6,9 5,5 4,8 4,9 4,9 5,2 5,5 6,3 4,9 4,6 4,4 4,6 4,4 4,3 4,4 5,1
6,2 5,6 4,9 4,6 4,6 5,2 5,9 6,3 5,0 4,9 4,7 4,6 4,2 4,2 4,6 5,1
6,8 6,2 5,9 5,2 5,2 5,5 6,2 7,3 5,4 5,2 5,2 4,6 4,6 4,6 4,9 5,6
7,3 6,8 6,2 6,3 6,3 6,4 6,9 8,1 5,6 5,2 5,2 5,4 5,1 4,9 4,9 6,0
7,3 6,9 7,3 7,3 7,5 7,4 8,3 10,4 5,9 4,8 5,4 5,9 5,6 6,2 6,4 8,1
(b) Dual axis geometry.
Reference points (0.3 criterion) Reference points (0.3 criterion)
Ave. min. Max. Ave. min. Max.
4.1 3.4 5.1 3.4 3.2 4.2
8×8 sub-volumes 8×8 sub-volumes
5,0 5,0 4,7 3,9 4,7 5,1 4,8 4,0 3,6 4,0 4,2 3,6 4,0 4,1 3,9 3,6
4,6 4,2 3,9 3,4 3,8 4,4 5,0 4,5 3,3 3,3 3,4 3,3 3,6 3,7 3,7 3,5
4,2 4,0 3,6 3,4 3,6 4,0 4,3 4,5 3,3 3,3 3,2 3,3 3,4 3,4 3,3 3,3
4,1 3,8 3,7 3,6 3,6 3,7 4,0 4,0 3,3 3,2 3,3 3,2 3,4 3,4 3,3 3,3
4,5 3,9 3,8 3,8 3,6 3,7 3,7 3,9 3,5 3,2 3,2 3,3 3,3 3,3 3,3 3,3
3,9 3,6 3,8 4,1 3,8 3,9 3,9 3,9 3,5 3,2 3,2 3,2 3,2 3,3 3,3 3,3
3,8 3,6 3,8 3,9 4,0 4,2 4,5 4,2 3,4 3,3 3,3 3,2 3,3 3,3 3,4 3,3
3,9 3,6 3,5 3,7 3,9 4,0 5,0 5,0 3,6 3,3 3,2 3,3 3,3 3,3 3,6 3,7
Reference points (0.5 criterion) Reference points (0.5 criterion)
Ave. min. Max. Ave. min. Max.
5.8 4.5 7.4 4.6 4.0 6.4
8×8 sub-volumes 8×8 sub-volumes
7,1 6,9 6,9 5,1 6,6 6,8 6,9 5,8 5,3 6,4 6,4 5,0 5,9 5,7 5,4 4,6
6,3 5,6 5,3 4,5 5,6 6,0 6,6 6,4 4,4 4,4 4,5 4,3 5,0 5,0 5,3 4,6
5,8 5,4 4,8 4,5 5,2 5,5 5,6 6,0 4,4 4,2 4,2 4,3 4,9 4,8 4,5 4,3
6,0 5,5 5,0 4,6 5,6 5,3 5,3 5,4 4,3 4,2 4,1 4,3 4,9 4,8 4,5 4,2
6,6 5,5 5,2 4,9 4,9 5,0 5,0 5,3 4,9 4,2 4,2 4,3 4,4 4,5 4,3 4,3
6,3 5,6 5,8 5,4 5,2 5,0 5,2 5,6 4,7 4,2 4,1 4,2 4,0 4,1 4,2 4,3
6,4 6,1 6,2 5,7 5,8 6,0 6,1 6,0 4,7 4,2 4,3 4,2 4,2 4,2 4,4 4,4
6,6 5,6 5,8 6,6 6,7 6,2 7,4 6,8 5,0 4,3 4,3 4,3 4,4 4,3 5,4 5,2
(c) Single axis series.
Reference points (0.3 criterion) Reference points (0.3 criterion)
Ave. min. Max. Ave. min. Max.
3.2 3.1 3.6 3.1 3.0 3.4
Reference points (0.5 criterion) Reference points (0.5 criterion)
Ave. min. Max. Ave. min. Max.
3.8 3.6 4.2 3.7 3.5 4.1