Table 1.

The posterior probabilities of the 10 fixed amino acid models for each of the eight alignments. (A, Drosophila adh; B, vertebrate β-globin; C, Leviviridae coat; D, Japanese encephalitis env; E, flavivirus; F, influenza; G, HIV pol; H, Leviviridae replicase.)

model	A	B	C	D	E	F	G	H
M1	6.20×10−101	3.69×10−119	1.33×10−66	1.52×10−72	1.56×10−151	9.01×10−55	5.35×10−254	2.54×10−95
M2	6.20×10−3	1.04×10−10	1.41×10−8	9.99×10−1	9.99×10−1	9.99×10−1	9.99×10−1	1.69×10−10
M3	2.81×10−11	9.99×10−1	1.39×10−8	2.11×10−15	1.71×10−18	1.27×10−14	4.12×10−45	1.09×10−26
M4	5.55×10−34	2.59×10−53	1.52×10−60	3.40×10−33	2.47×10−87	3.16×10−33	3.04×10−131	3.95×10−91
M5	5.46×10−44	8.65×10−78	7.53×10−89	3.72×10−32	1.92×10−113	5.07×10−37	2.56×10−143	6.65×10−121
M6	9.88×10−1	5.04×10−6	9.99×10−1	4.10×10−8	7.81×10−6	1.54×10−8	7.22×10−31	2.27×10−2
M7	4.53×10−3	1.04×10−13	4.14×10−9	2.68×10−32	3.21×10−20	4.11×10−24	1.99×10−12	6.91×10−10
M8	6.67×10−4	5.65×10−19	1.97×10−9	2.99×10−10	5.26×10−7	1.20×10−8	6.49×10−17	5.68×10−10
M9	2.24×10−7	1.77×10−27	5.14×10−5	1.34×10−15	9.83×10−17	2.96×10−17	1.31×10−44	4.28×10−18
M10	1.51×10−10	8.13×10−24	4.43×10−5	6.40×10−23	2.21×10−20	4.00×10−22	3.12×10−67	9.77×10−1