TABLE 2.
Specificity of primer pairs
Target DNA | Specificitya of primer pair:
|
|||
---|---|---|---|---|
HDA1- HDA2GC | Ec338fGC- Ec518r | Ec1055- Ec1406GC | U968GC- L1401 | |
Bacteria | ||||
L. plantarum | + | + | + | + |
O. oeni | + | + | + | + |
Pediococcus sp. strain PC8000 | ND | + | + | + |
G. oxydans | ND | + | + | + |
Plant | ||||
V. vinifera | ND | + | + | + |
Yeasts | ||||
M. pulcherrima | + | + | − | − |
S. cerevisiae | + | + | − | − |
K. apiculata | + | + | − | − |
P. farinosa | + | + | − | − |
P. membranifaciens | + | + | − | − |
P. fermentans | + | + | − | − |
Candida sp. strain EJ1 | + | + | − | − |
C. vini | + | + | − | − |
S. pombe | + | + | − | − |
S. ludwigii | + | + | − | − |
W. saturnus | + | + | − | − |
Brettanomyces sp. | + | + | − | − |
T. delbrueckii | + | FB | − | − |
Z. bailii | + | + | − | − |
K. thermotolerans | FB | FB | − | − |
Fungi | ||||
F. lateritium | + | FB | + | − |
B. cinerea | + | + | + | − |
Trichoderma sp. | − | − | − | − |
Cladosporium sp. | − | + | − | − |
Penicillium sp. | FB | + | − | − |
E. lata | − | − | − | − |
S. botryosum | + | + | + | − |
A. alternata | − | − | − | − |
Humicola sp. | − | − | − | − |
P. ultimum | + | + | − | FB |
ND, not determined; FB, faint band.