TABLE 1.
Mutation patterns of QRDRs and CIP MICs in FQREC and FQSEC isolates
Resistance group | Mutated amino acid encoded in:
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Total no. of isolates | No. of isolates for which the ciprofloxacin MIC (μg/ml) was:
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gyrA
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parC
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parE
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Ser83 | Asp87 | Ser80 | Glu84 | Ala108 | Leu445 | Ser458 | Asp475 | 0.008 | 0.016 | 0.03 | 0.06 | 0.13 | 0.25 | 0.5 | 1 | 2 | 4 | 8 | 16 | 32 | 64 | 128 | >128 | ||
FQREC | Leu | Asn | Ile | 26 | 1 | 9 | 7 | 4 | 4 | 1 | |||||||||||||||
Leu | His | Ile | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Val | 37 | 1 | 3 | 19 | 7 | 4 | 3 | |||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Gly | 6 | 1 | 3 | 1 | 1 | |||||||||||||||||
Val | Asn | Ile | Lys | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||
Leu | Tyr | Arg | Val | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Thr | 3 | 2 | 1 | |||||||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | His | 2 | 1 | 1 | |||||||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Ala | 8 | 1 | 3 | 3 | 1 | |||||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Trp | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||
Leu | Tyr | Ile | Ala | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Val | His | 2 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
FQSEC | 73 | 15 | 37 | 17 | 1 | 1 | 2 | ||||||||||||||||||
Leu | 10 | 1 | 2 | 5 | 2 | ||||||||||||||||||||
Gly | 2 | 2 | |||||||||||||||||||||||
Glu | 2 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||
Leu | Glu | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||
Gly | Glu | 1 | 1 |