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. 2009 Jan 23;75(6):1769–1773. doi: 10.1128/AEM.02043-08

TABLE 3.

Temporal recovery of non-O157 STEC clones isolated from individual animals on two or more occasions

Flock Animal Clone isolated in (mo/yr)a:
11/03 12/03 1/04 2/04 3/04 4/04 5/04 6/04 7/04 8/04 9/04 10/04
1 1-1 AI AI AI AI AI NS
1-2 BI BI NS BI
1-4 BI BI BI BI BI NS
1-6 AIV AIV NS AIV
1-7 BI BI BI NS
1-8 AI AI AI AI AI AI AI/CII NS CII
1-9 BII BII BII BII NS NS NS NS NS
1-10 AI AI AI CII CII NS CII
1-12 BI BI AI AI AI NS AI AI
2 2-2 CII CII
2-5 BVI/CII BVI BVI BVI/CII
2-8 BV BV BV BV BV NS NS NS
2-9 BIII BIII BIII
2-10 BVII BVII
2-11 BV BV BV BV
2-12 CI BVII/CI CI BVII/CI CI CI CI CI CI
3 3-1 BVIII NS BVIII BVIII NS
3-3 NS BIV NS BIV
3-5 AI NS AI NS
3-6 AIII AIII NS BVIII NS BVIII
3-7 BVIII NS BVIII BVIII NS
3-8 AV AV NS NS NS NS NS NS NS NS NS
3-9 AI AI AI NS AI NS AI
3-10 BVIII BVIII AI AI NS AI NS BVIII
4 4-2 NS CI CI CI CI
4-9 NS CIII CIII
4-12 NS AII AII
a

NS, no sample from the animal was obtained on that occasion. An empty cell indicates that the sample from the animal was negative for STEC or that isolates were genetically unrelated to the persistent clones.