TABLE 3.
Temporal recovery of non-O157 STEC clones isolated from individual animals on two or more occasions
Flock | Animal | Clone isolated in (mo/yr)a:
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11/03 | 12/03 | 1/04 | 2/04 | 3/04 | 4/04 | 5/04 | 6/04 | 7/04 | 8/04 | 9/04 | 10/04 | ||
1 | 1-1 | AI | AI | AI | AI | AI | NS | ||||||
1-2 | BI | BI | NS | BI | |||||||||
1-4 | BI | BI | BI | BI | BI | NS | |||||||
1-6 | AIV | AIV | NS | AIV | |||||||||
1-7 | BI | BI | BI | NS | |||||||||
1-8 | AI | AI | AI | AI | AI | AI | AI/CII | NS | CII | ||||
1-9 | BII | BII | BII | BII | NS | NS | NS | NS | NS | ||||
1-10 | AI | AI | AI | CII | CII | NS | CII | ||||||
1-12 | BI | BI | AI | AI | AI | NS | AI | AI | |||||
2 | 2-2 | CII | CII | ||||||||||
2-5 | BVI/CII | BVI | BVI | BVI/CII | |||||||||
2-8 | BV | BV | BV | BV | BV | NS | NS | NS | |||||
2-9 | BIII | BIII | BIII | ||||||||||
2-10 | BVII | BVII | |||||||||||
2-11 | BV | BV | BV | BV | |||||||||
2-12 | CI | BVII/CI | CI | BVII/CI | CI | CI | CI | CI | CI | ||||
3 | 3-1 | BVIII | NS | BVIII | BVIII | NS | |||||||
3-3 | NS | BIV | NS | BIV | |||||||||
3-5 | AI | NS | AI | NS | |||||||||
3-6 | AIII | AIII | NS | BVIII | NS | BVIII | |||||||
3-7 | BVIII | NS | BVIII | BVIII | NS | ||||||||
3-8 | AV | AV | NS | NS | NS | NS | NS | NS | NS | NS | NS | ||
3-9 | AI | AI | AI | NS | AI | NS | AI | ||||||
3-10 | BVIII | BVIII | AI | AI | NS | AI | NS | BVIII | |||||
4 | 4-2 | NS | CI | CI | CI | CI | |||||||
4-9 | NS | CIII | CIII | ||||||||||
4-12 | NS | AII | AII |
NS, no sample from the animal was obtained on that occasion. An empty cell indicates that the sample from the animal was negative for STEC or that isolates were genetically unrelated to the persistent clones.