Skip to main content
. 2009 Apr 15;4(4):e5151. doi: 10.1371/journal.pone.0005151

Table 1. probability of the adequacy for each simulation (P(Co|C)) and associated P′ of four observed measures of genetic diversity.

Models Number of sequences Growth rate Migration rate Hap. number Pairwise difference Hapl. diversity Nucl. diversity P(Co|C)
Model 1 12 0 1 0.143 0.152 0.286 0.141 0.1240
0 0 0.111 0.139 0.286 0.130 0.1205
1 1 0.112 0.118 0.231 0.110 0.0905
1 0 0.093 0.117 0.223 0.113 0.0830
9 0 1 0.144 0.114 0.952 0.110 0.1305
0 0 0.139 0.117 0.943 0.114 0.1235
1 1 0.102 0.083 0.828 0.082 0.0875
1 0 0.084 0.077 0.808 0.074 0.0860
8 0 1 0.717 0.106 0.000 0.104 0.0030
0 0 0.704 0.119 0.000 0.118 0.0025
1 1 0.485 0.077 0.000 0.076 0.0010
1 0 0.499 0.097 0.000 0.095 0.0025
7 0 1 0.363 0.097 0.000 0.098 0.0025
0 0 0.414 0.101 0.000 0.101 0.0010
1 1 0.318 0.085 0.000 0.085 0.0005
1 0 0.294 0.076 0.000 0.076 0.0025
Model 2 12 0 1 0.144 0.154 0.350 0.147 0.1470
0 0 0.130 0.118 0.324 0.111 0.1140
1 1 0.174 0.227 0.400 0.220 0.2025
1 0 0.184 0.171 0.412 0.167 0.1790
9 0 1 0.138 0.104 0.910 0.102 0.1210
0 0 0.108 0.049 0.929 0.046 0.0695
1 1 0.169 0.191 0.967 0.188 0.1895
1 0 0.151 0.122 0.958 0.118 0.1375
8 0 1 0.726 0.100 0.000 0.097 0.0005
0 0 0.688 0.049 0.000 0.048 0.0020
1 1 0.667 0.167 0.000 0.161 0.0005
1 0 0.618 0.104 0.000 0.101 0.0015
7 0 1 0.453 0.099 0.000 0.100 0.0015
0 0 0.432 0.045 0.000 0.047 0.0010
1 1 0.347 0.188 0.000 0.192 0.0050
1 0 0.344 0.105 0.000 0.107 0.0050
Model 3a 12 0 1 0.146 0.141 0.272 0.138 0.1335
0 0 0.058 0.048 0.195 0.045 0.0420
1 1 0.226 0.293 0.445 0.285 0.2745
1 0 0.170 0.143 0.404 0.138 0.1505
9 0 1 0.108 0.075 0.966 0.073 0.0960
0 0 0.075 0.024 0.915 0.022 0.0405
1 1 0.164 0.227 0.959 0.222 0.2170
1 0 0.136 0.098 0.929 0.094 0.1100
8 0 1 0.595 0.057 0.000 0.053 0.0025
0 0 0.601 0.026 0.000 0.026 0.0020
1 1 0.603 0.220 0.000 0.214 0.0005
1 0 0.597 0.078 0.000 0.076 0.0005
7 0 1 0.391 0.063 0.000 0.064 0.0040
0 0 0.361 0.027 0.000 0.027 0.0010
1 1 0.346 0.171 0.000 0.173 0.0015
1 0 0.314 0.058 0.000 0.058 0.0025
Model3b 12 0 1 0.119 0.116 0.251 0.110 0.1030
0 0 0.099 0.074 0.254 0.067 0.0705
1 1 0.210 0.275 0.424 0.268 0.2480
1 0 0.160 0.154 0.399 0.141 0.1525
9 0 1 0.093 0.069 0.920 0.064 0.0825
0 0 0.092 0.041 0.860 0.040 0.0570
1 1 0.173 0.221 0.898 0.217 0.2045
1 0 0.139 0.108 0.865 0.105 0.1240
8 0 1 0.578 0.062 0.000 0.060 0.0010
0 0 0.546 0.021 0.000 0.020 0.0015
1 1 0.528 0.226 0.000 0.224 0.0005
1 0 0.470 0.069 0.000 0.068 0.0035
7 0 1 0.339 0.066 0.000 0.066 0.0005
0 0 0.302 0.021 0.000 0.021 0.0020
1 1 0.271 0.168 0.000 0.169 0.0005
1 0 0.275 0.075 0.000 0.076 0.0020
Model 3c 12 0 1 0.170 0.143 0.404 0.138 0.1505
0 0 0.094 0.079 0.299 0.076 0.0760
1 1 0.239 0.315 0.492 0.303 0.2900
1 0 0.302 0.460 0.627 0.445 0.4190
9 0 1 0.094 0.063 0.920 0.061 0.0840
0 0 0.087 0.029 0.905 0.026 0.0410
1 1 0.177 0.232 0.964 0.226 0.2190
1 0 0.128 0.080 0.907 0.074 0.0935
8 0 1 0.590 0.063 0.000 0.062 0.0015
0 0 0.638 0.033 0.000 0.033 0.0020
1 1 0.587 0.204 0.000 0.199 0.0005
1 0 0.585 0.088 0.000 0.083 0.0015
7 0 1 0.373 0.064 0.000 0.065 0.0040
0 0 0.389 0.037 0.000 0.039 0.0010
1 1 0.335 0.154 0.000 0.157 0.0010
1 0 0.330 0.086 0.000 0.086 0.0025
Model 4 12 0 1 0.075 0.094 0.197 0.089 0.0710
0 0 0.030 0.040 0.094 0.037 0.0165
1 1 0.141 0.192 0.356 0.183 0.1690
1 0 0.049 0.052 0.141 0.049 0.0370
9 0 1 0.054 0.044 0.698 0.042 0.0490
0 0 0.018 0.007 0.440 0.007 0.0115
1 1 0.134 0.185 0.860 0.177 0.1730
1 0 0.049 0.039 0.559 0.038 0.0450
8 0 1 0.398 0.038 0.000 0.037 0.0030
0 0 0.218 0.010 0.000 0.009 0.0025
1 1 0.578 0.181 0.000 0.175 0.0005
1 0 0.299 0.029 0.000 0.027 0.0020
7 0 1 0.195 0.037 0.000 0.037 0.0010
0 0 0.086 0.007 0.000 0.007 0.0015
1 1 0.250 0.153 0.000 0.154 0.0030
1 0 0.092 0.024 0.000 0.024 0.0020

Co = combined P-values for observed values.

C = distribution of combined P-values for simulated values Inline graphic.

growth rate ∶ 1 = 0.00016/0 = 0.

migration rate : 1 = 0.0002/0 = 0.