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. 2009 Mar 13;84(3):339–350. doi: 10.1016/j.ajhg.2009.01.024

Table 3.

Deletion Breakpoint Sequences from APH-Treated Clones

Clone Location Size Breakpoint 1 Breakpoint 2
p-43a 3p24.3 162,051 bp …CTTAATGGGGCCAaaggagacctctg… …tttcatgtctccaCAGGTGTTGATCT…
851a 3p14.2 35,750 bp …TCTTTAAAAGATGTCttaaagtaata… …tgacatatattTGTCAACATATGCCT…
3-16a 3q26.3 91,035 bp …CAGTGGCACAATCTCggctcactgca… …gtataaccctgTCTCAAAAAAAAAAA…
A1B1 17p13.1 265,205 bp …TCTTGTTAATAACAaggctattggct… …tgccaagatgccCACAAATCGAGAAC…
A3A2 3q13.31 762,148 bp …ACTTAGGATAATAGcctccagctaca… …tcttatagggcaAGGATCATAGCTAC…
A3A2 11p15 88,497 bp …ACTGCCTCCATATcgtgagttgctag… …aggaggcagacagGTTCCTGGCATAA…
A3A2 15q23 30,620 bp …TTGCTATTTTCTGGgttgtttttttt… …ttaatccattcaGCCACTCTATGTCT…
A3A2 18p11.23 233,818 bp …AGTGTCCAGT(GTCCTA)tgaatgaatt… …tcagcttattattCTTTGAATAAAGT…
A4A1 7q32 168,106 bp …CTTCTCAACATTCCTggtcaagacag… …gctgatcactcTCCTCTTTAAGCACT…

Underline indicates microhomology; lowercase indicates deletion; parentheses indicate insertion.

a

Chr. 3 hybrid clones.26