Skip to main content
. 2009 Feb 13;75(8):2304–2311. doi: 10.1128/AEM.02522-08

TABLE 2.

Primers used in this work

Primer Sequence
XI-Agro-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAAATTTTCAAACACCACCC
XI-Agro-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAAACGTAACGATTGACCACG
XI-Arab-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAAGAAAGTTGAGTTTTTTATGC
XI-Arab-2rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTACATTGCAGATTGGAAAATC
XI-BaLi-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGTTTTTTAGAAATATCGGAATG
XI-BaLi-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGCTAGTGTGTCTCCTTTCCTGCCG
XI-Burk-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGTCCTATTTCGAACACATTCCCG
XI-Burk-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAGCGTCCGCTGTAAATAGCC
XI-Clos-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAAAAATTACTTTCCAAATG
XI-Clos-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTATCTAAATAAAATATTATTTACG
XI-Lacto-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGACAAACGAATATTGGCAAGG
XI-Lacto-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTATTTACTTAACGTCTCGATAAT
XI-Leif-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGCTGGCTCGAGCGCAGGCTCC
XI-Leif-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAGCGCGCGCCGAGCAGATGC
XI-Pseudo-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGCCGTACTTCCCCGCCGTCG
XI-Pseudo-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAGAAGTAGATAAAGCGGTTGACC
XI-Robi-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGATTACCACCGGAGACAAAG
XI-Robi-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAGATAAATTGGTTGATAATG
XI-Saccha-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAGCGTAGTACTTGGCGATAAAG
XI-Saccha-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTAACGAATATATTGGTTAATAATG
XI-Salmo-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGCAGGCTTATTTTGACCAACTCG
XI-Salmo-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTATTTATCAAACAGATAACGGTTAAC
XI-Staph-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGTCTTATTTTGATATCAATAAAG
XI-Staph-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAATCCTTATTATTAATATTTAAG
XI-Strep-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAGCTACCAGCCCACCCCCG
XI-Strep-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGCTAGCCCCGCGCGCCCAGCAGG
XI-Xantho-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAGCAACACCGTTTTCATCGGC
XI-Xantho-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTCAACGCGTCAGGTACTGATTGATC
opt.XI-Clos-for CAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGAAGAACTACTTCCCAAACG
opt.XI-Clos-rev GTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTATCTGAACAAAATGTTGTTAAC
opt.XI-Piro-for AACACAAAAACAAAAAGTTTTTTTAATTTTAATCAAAAAATGGCTAAGGAATACTTCCCA
opt.XI-Piro-rev GAATGTAAGCGTGACATAACTAATTACATGACTCGAGTTATTGGTACATAGCAACAAT
FAA2-1-f CAAGCGCGCAATTAACCCTCACTAAAGGGAACAAAAGCTGTACTTATGACGATTTGGAAC
FAA2-1-r ATATCAGGGCTCACTACATG
FAA2-2-f CGGGGCGTAATCACCTAACTC
FAA2-2-r CAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAGCGCGCGTCTAATGGCGATTTAGCATATG
FAA2-kanMX-f GATGGAGGTGCAGTGTTTTCCATGTAGTGAGCCCTGATATGTTTAAACTTCGTACGCTGCAGGTCGAC
FAA2-kanMX-r GAGAAAGGTTTACCTTTGCTGAGTTAGGTGATTACGCCCCGGCATAGGCCACTAGTGGATCTG
FAA2-optXI-Clos-f CAGATGGAGGTGCAGTGTTTTCCATGTAGTGAGCCCTGATATGTTTAAACGAGCTCGTAGGAACAATTTC
FAA2-optXI-Clos-r ATTAAGGGTTGTCGACCTGCAGCGTACGAAGCTTCAGCGGCGAATTGGGTACCGGCCG