Table 1.

Values of haplotype diversity and statistics for testing departures from neutrality pertaining to innate immunity genes in three populations

Population	Gene	No. of haplotypes	Haplotype diversity		Tajima's D		Fu and Li's D*		Fu and Li's F*		Fu's Fs
			Estimate	Variance	Value	P	Value	P	Value	P	Value	P
Indian (this study)	CAMP	8	0.108	0.0005	−1.79	< 0.05	−2.91	< 0.05	−3.02	< 0.02	−12.28	< 0.05
	DEFA4	31	0.816	0.0001	−0.07	> 0.10	−1.01	> 0.10	−0.75	> 0.10	−7.40	< 0.05
	DEFA5	21	0.699	0.0004	−1.26	> 0.10	−1.16	> 0.10	−1.45	> 0.10	−10.27	< 0.05
	DEFA6	37	0.902	0.0001	−0.10	> 0.10	−0.92	> 0.10	−0.71	> 0.10	−16.88	< 0.05
	DEFB1	106	0.922	0.0001	0.00	> 0.10	−1.53	> 0.10	−0.90	> 0.10	−22.54	< 0.05
	MBL2	46	0.879	0.0001	0.40	> 0.10	−2.12	0.05 < P < 0.10	−1.13	> 0.10	−2.74	> 0.10
	TLR1	45	0.757	0.0007	−0.37	> 0.10	−1.67	> 0.10	−1.29	> 0.10	−4.87	> 0.10
	TLR2	34	0.659	0.0007	−1.24	> 0.10	−2.46	< 0.05	−2.35	< 0.05	−22.34	< 0.05
	TLR4	58	0.78	0.0005	−1.23	> 0.10	−3.50	< 0.02	−2.98	< 0.02	−34.49	< 0.05
	TLR5	35	0.848	0.0001	0.64	> 0.10	−0.77	> 0.10	−0.16	> 0.10	−1.07	> 0.10
	TLR6	34	0.833	0.0002	0.47	> 0.10	−0.30	> 0.10	0.07	> 0.10	1.10	> 0.10
	TLR9	30	0.719	0.0004	−1.28	> 0.10	−2.66	< 0.05	−2.51	< 0.05	−15.55	< 0.05
European-American	DEFB1	17	0.875	0.0012	1.58	> 0.10	0.98	> 0.10	1.43	> 0.10	9.48	> 0.10
	TLR1	11	0.724	0.0027	−0.50	> 0.10	1.20	> 0.10	0.71	> 0.10	2.60	> 0.10
	TLR2	10	0.774	0.0021	−0.44	> 0.10	−1.37	> 0.10	−1.26	> 0.10	−1.85	> 0.10
	TLR4	16	0.875	0.0009	−0.26	> 0.10	0.53	> 0.10	0.30	> 0.10	−0.17	> 0.10
	TLR5	22	0.949	0.0002	0.60	> 0.10	1.00	> 0.10	1.02	> 0.10	0.90	> 0.10
	TLR6	12	0.756	0.0026	1.58	> 0.10	1.12	> 0.10	1.52	0.05 < P < 0.10	2.66	> 0.10
	TLR9	11	0.762	0.0015	−0.64	> 0.10	−2.23	0.05 < P < 0.10	−2.01	0.05 < P < 0.10	−2.65	> 0.10
African-American	DEFB1	23	0.949	0.0004	−0.28	> 0.10	0.38	> 0.10	0.17	> 0.10	1.45	> 0.10
	TLR1	14	0.878	0.0024	−1.28	> 0.10	−2.14	0.05 < P < 0.10	−2.20	0.05 < P < 0.10	−1.55	> 0.10
	TLR2	18	0.917	0.0003	−0.96	> 0.10	−2.32	0.05 < P < 0.10	−2.20	0.05 < P < 0.10	−8.16	> 0.10
	TLR4	30	0.969	0.0002	−0.68	> 0.10	−0.37	> 0.10	−0.57	> 0.10	−6.31	> 0.10
	TLR5	28	0.946	0.0006	−0.78	> 0.10	−1.35	> 0.10	−1.36	> 0.10	−0.77	> 0.10
	TLR6	18	0.925	0.0003	−0.22	> 0.10	0.21	> 0.10	0.07	> 0.10	−0.12	> 0.10
	TLR9	11	0.755	0.0025	−0.22	> 0.10	−0.13	> 0.10	−0.19	> 0.10	−1.84	> 0.10