Table 4.
Changes in SP localization prediction due to mutations.
| Mutant compartment | ||||||||||||||||
| Wild type compartmenta | Gtm | Mtm/Gtm | Mma/C | Mma | Mma/PM | Mps/S | C | Mma/P | N | PM | Mtm | S | Mtm/PM | Mma/N | P | Total |
| Mtm/Gtm | 0/3 | 1/1 | 1/4 | |||||||||||||
| Mtm/PM | 0/6 | 0/9 | 1/1 | 1/16 | ||||||||||||
| PM | 17/47 | 0/1 | 4/5 | 21/53 | ||||||||||||
| S | 0/4 | 7/8 | 7/12 | |||||||||||||
| C | 0/1 | 8/8 | 19/20 | 1/1 | 1/1 | 0/2 | 29/33 | |||||||||
| Mtm | 0/3 | 1/1 | 1/4 | |||||||||||||
| Mma/Gtm | 0/2 | 0/2 | ||||||||||||||
| Gtm | 0/5 | 17/21 | 0/1 | 2/4 | 19/31 | |||||||||||
| Mtm/C | 0/1 | 1/4 | 1/5 | |||||||||||||
| Mps/C | 1/1 | 1/1 | ||||||||||||||
| Mma | 6/6 | 1/1 | 2/2 | 1/1 | 10/10 | |||||||||||
| Mma/S | 2/2 | 1/1 | 1/1 | 4/4 | ||||||||||||
| Mma/C | 4/4 | 4/4 | ||||||||||||||
| Mps | 2/2 | 2/2 | ||||||||||||||
| Mma/N | 1/1 | 1/1 | 2/2 | |||||||||||||
| P | 1/1 | 1/1 | ||||||||||||||
| N | 0/18 | 1/1 | 1/19 | |||||||||||||
| Total | 17/61 | 0/19 | 17/18 | 3/6 | 2/2 | 4/4 | 7/8 | 1/1 | 21/22 | 25/48 | 0/1 | 3/5 | 4/5 | 1/1 | 0/2 | 105/203 |
The numbers separated by the slash sign are for how many proteins the wild type localization has been correctly predicted, and the number of analyzed mutations, respectively.
aC, cytosol; Gtm, Golgi, transmembrane; Mma, mitochondrial matrix; Mps, mitochondrial, periplasmic space; Mtm, mitochondrial transmembrane; N, nuclear; P, peroxisomal; PM, plasma membrane; S, secreted. Slash sign indicates alternative predicted localizations.