Table 1.
Affinity changes for binding of the Sua5p to mutated TG20 oligos
| Primer | (TG)0–6TGGGTGT(G)0–1 | Relative Kd | ΔΔG (kcal/mol) ensemble |
|---|---|---|---|
| TG20 | TGGTGTGTGTGGGTGTGGTG | 1 | |
| TG201 | TaaTGTGTGTGGGTGTGGTG | 3.7 | 0.79 |
| TG202 | TGGTaaGTGTGGGTGTGGTG | 7.4 | 1.20 |
| TG203 | TGGTGTaTGTGGGTGTGGTG | 1.2 | 0.14 |
| TG204 | TGGTGTGTaTGGGTGTGGTG | 3.6 | 0.78 |
| TG205 | TGGTGTGTGaGGGTGTGGTG | 1.1 | 0.034 |
| TG214 | TGGTGTGTGTaGGTGTGGTG | 38 | 2.19 |
| TG206 | TGGTGTGTGTGaaTGTGGTG | 175 | 3.11 |
| TG215 | TGGTGTGTGTGaGTGTGGTG | 439 | 3.66 |
| TG216 | TGGTGTGTGTGGaTGTGGTG | 36.8 | 2.16 |
| TG207 | TGGTGTGTGTGGGTaTGGTG | 1.1 | 0.065 |
| TG208 | TGGTGTGTGTGGGTGTaaTG | 0.78 | −0.15 |