TABLE 5.
Subtypea | No. of isolates (n)b | % Similarity in subtype | Epidemic season (n)c |
---|---|---|---|
A2.1 | 8 (7) | 99.62 | 2005-2006 (1) |
2006-2007 (7) | |||
A2.2 | 8 (7) | 99.62 | 2006-2007 (8) |
A2.3 | 3 (0) | 97.4 | 2005-2006 (1) |
2006-2007 (2) | |||
A2.4 | 2 (2) | 100 | 2004-2005 (2) |
A2.5 | 3 (3) | 100 | 2001-2002 (3) |
A2.6 | 2 (2) | 100 | 1999-2000 (2) |
A2.7 | 6 (5) | 99.62 | 2001-2002 (6) |
A2.8 | 4 (2) | 99.25 | 1999-2000 (3) |
2000-2001 (1) | |||
A2.9 | 2 (0) | 98.51 | 2003-2004 (1) |
2004-2005 (1) | |||
A2.10 | 2 (2) | 100 | 2000-2001 (2) |
A2.11 | 4 (2) | 98.51 | 2000-2001 (4) |
A2.12 | 10 (3, 2) | 97.4 | 2005-2006 (2) |
2006-2007 (8) | |||
A2.13 | 3 (0) | 97.77 | 1998-1999 (1) |
2000-2001 (1) | |||
2002-2003 (1) | |||
A2.14 | 3 (2) | 97.77 | 1999-2000 (2) |
2000-2001 (1) | |||
A2.15 | 4 (3) | 99.25 | 2003-2004 (3) |
2004-2005 (1) | |||
A2.16 | 3 (0) | 98.51 | 2000-2001 (1) |
2003-2004 (1) | |||
2006-2007 (1) | |||
A2.17 | 4 (2) | 98.14 | 2005-2006 (1) |
2006-2007 (3) | |||
A2.18 | 1 | 2006-2007 (1) | |
A2.19 | 1 | 2000-2001 (1) | |
A2.20 | 1 | 2000-2001 (1) | |
A5.1 | 10 (9) | 99.25 | 1999-2000 (1) |
2004-2005 (7) | |||
2006-2007 (2) | |||
A5.2 | 3 (3) | 100 | 2004-2005 (3) |
A5.3 | 7 (5) | 98.14 | 2005-2006 (1) |
2006-2007 (6) | |||
A5.4 | 4 (3) | 98.8 | 2005-2006 (1) |
2006-2007 (3) | |||
A5.5 | 4 (2, 2) | 99.25 | 2004-2005 (2) |
2005-2006 (2) | |||
A5.6 | 4 (2) | 98.8 | 2000-2001 (4) |
A5.7 | 15 (2, 9) | 96.6 | 2000-2001 (1) |
2001-2002 (3) | |||
2002-2003 (3) | |||
2003-2004 (2) | |||
2004-2005 (3) | |||
2005-2006 (3) | |||
A5.8 | 20 (17) | 96.6 | 1999-2000 (1) |
2000-2001 (5) | |||
2001-2002 (2) | |||
2002-2003 (3) | |||
2003-2004 (3) | |||
2004-2005 (4) | |||
2005-2006 (1) | |||
2006-2007 (1) | |||
A5.9 | 3 (0) | 97.77 | 1998-1999 (1) |
1999-2000 (1) | |||
2005-2006 (1) | |||
A5.10 | 3 (0) | 98.8 | 2000-2001 (1) |
2001-2002 (1) | |||
2002-2003 (1) | |||
A5.11 | 2 (2) | 100 | 2004-2005 (2) |
A5.12 | 2 (2) | 100 | 2003-2004 (2) |
A5.13 | 11 (7) | 97 | 1999-2000 (6) |
2000-2001 (2) | |||
2001-2002 (2) | |||
2002-2003 (1) | |||
A5.14 | 3 (3) | 100 | 2004-2005 (3) |
A5.15 | 2 (2) | 100 | 2006-2007 (2) |
A5.16 | 4 (2) | 98.51 | 2000-2001 (1) |
2003-2004 (2) | |||
2006-2007 (1) | |||
A5.17 | 7 (4) | 97 | 2004-2005 (6) |
2006-2007 (1) | |||
A5.18 | 3 (3) | 100 | 2004-2005 (3) |
A5.19 | 3 (3) | 100 | 2006-2007 (3) |
A5.20 | 6 (4) | 99.25 | 2003-2004 (1) |
2005-2006 (4) | |||
2006-2007 (1) | |||
A5.21 | 3 (3) | 100 | 2003-2004 (3) |
A5.22 | 3 (0) | 98.14 | 2000-2001 (3) |
A5.23 | 2 (0) | 97.77 | 2002-2003 (2) |
A5.24 | 2 (0) | 98.8 | 2000-2001 (1) |
2005-2006 (1) | |||
A5.25 | 5 (0) | 97.77 | 1999-2000 (1) |
2000-2001 (3) | |||
2001-2002 (1) | |||
A5.26 | 2 (0) | 98.8 | 2006-2007 (2) |
A5.27 | 1 | 1999-2000 (1) | |
A5.28 | 2 (0) | 97.4 | 2002-2003 (1) |
2006-2007 (1) | |||
A7.1 | 11 (9) | 99.25 | 2002-2003 (11) |
A7.2 | 1 | 1999-2000 (1) |
Subtypes were defined as ≥96.6% nucleotide similarity and denoted with a three-character code.
n is the number of identical sequences (subtypes A2.12, A5.5 and A5.7 showed two distinct groups of identical sequences).
n is the number of isolates found in that season.