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. 2009 Jun 4;106(25):10224–10229. doi: 10.1073/pnas.0904420106

Table 2.

Data set with each sample code, the country, and the year of collection and all genotypes obtained at each locus by PCR

Sample code Country Year Loci
AC01 AC16 AC52 ARP ITSbraz Ibh3 LRC CAK EMI LBA G09 E11
LC1568 Peru 1993 202–202 149–161 104–104 139–139 102–102 130–130 124–124 162–162 165–165 180–180 150–152 102–102
LC2231 Peru 1994 202–202 149–155 084–098 139–145 106–106 130–130 132–132 162–162 189–189 178–178 150–154 096–096
LC2280 Peru 1994 198–210 151–161 084–084 137–139 104–106 130–130 132–132 158–158 191–191 176–182 150–162 098–102
LC2282 Peru 1994 206–212 149–149 100–100 151–153 102–102 128–128 120–126 162–162 165–165 176–180 156–156 096–096
LC2291 Peru 1994 202–202 151–151 120–120 133–149 102–106 130–130 128–128 162–162 175–185 174–182 148–148 100–100
LC2292 Peru 1994 204–210 149–149 084–120 139–139 104–104 130–130 132–132 160–160 189–189 174–180 148–152 096–096
LC2293 Peru 1994 202–202 149–151 098–098 133–149 102–106 130–130 128–128 164–168 175–185 174–174 150–152 100–102
LC2308 Peru 1994 204–210 151–169 100–100 149–149 100–102 116–130 120–128 160–160 185–185 174–180 154–154 098–100
LC2310 Peru 1994 204–210 159–159 084–094 137–139 102–102 130–130 132–132 160–160 189–189 176–182 148–156 100–100
LC2315 Peru 1994 202–210 151–161 108–108 141–141 102–102 130–130 130–134 162–162 189–189 176–182 154–154 100–104
LC2316 Peru 1994 200–204 147–161 088–088 135–135 100–100 118–130 130–138 160–160 185–185 176–180 148–154 098–098
LC2318 Peru 1994 202–202 149–167 092–108 139–139 102–102 130–130 130–130 162–162 177–195 174–182 152–152 100–100
LC2319 Peru 1994 200–200 149–157 104–110 141–147 104–108 130–130 124–124 164–164 193–193 174–184 152–152 100–100
LC2320 Peru 1994 202–210 149–155 118–118 155–155 104–104 128–128 132–132 162–162 189–189 174–182 150–154 102–102
LC2321 Peru 1994 208–208 149–149 086–106 149–155 100–100 128–128 122–130 162–162 189–189 176–176 148–156 098–106
LC2352 Peru 1994 202–212 149–161 110–110 143–143 102–104 130–130 126–130 162–162 191–191 178–180 150–154 098–098
LC2353 Peru 1994 202–212 149–161 084–094 129–139 102–102 128–128 132–132 158–162 191–191 176–180 150–152 098–098
LC2355 Peru 1994 210–210 149–159 098–122 129–137 102–102 128–128 132–132 158–160 189–189 176–180 150–150 100–100
LC2367 Peru 1994 202–202 149–161 084–098 131–139 102–106 130–130 132–132 158–164 191–191 174–180 148–148 098–098
LC2368 Peru 1994 202–202 149–161 084–098 135–141 102–104 130–130 132–132 158–162 191–191 174–180 148–148 100–100
LC2369 Peru 1994 200–210 149–161 096–096 135–141 102–106 130–130 126–132 158–164 189–189 174–182 150–150 098–098
LC2371 Peru 1994 200–200 151–161 084–098 135–141 100–106 130–130 132–132 158–164 189–189 174–180 148–148 098–098
LC2373 Peru 1994 202–202 151–161 084–098 133–139 102–104 130–130 132–132 162–162 191–191 174–180 150–150 100–100
LC2284 Peru 1994 210–210 151–161 086–116 139–139 102–102 130–130 130–130 158–160 189–189 174–180 150–152 100–102
LC2322 Peru 1994 202–202 149–161 094–110 149–149 104–104 130–130 130–130 160–160 191–193 174–182 154–154 100–102
CH12B Bolivia 1994 204–206 149–159 126–126 155–157 102–102 116–130 124–130 168–168 183–183 174–180 154–154 100–100
CH15 Bolivia 1994 206–206 147–157 124–124 155–157 102–102 116–130 122–134 164–164 189–189 168–174 154–154 100–106
CH17 Bolivia 1994 202–202 147–161 096–096 131–131 102–102 130–130 132–132 164–164 185–191 168–168 154–154 098–102
CH25B Bolivia 1994 202–204 149–149 100–100 121–121 102–102 130–130 124–134 158–164 179–187 168–172 152–168 100–102
CH29B Bolivia 1994 204–206 149–159 126–126 125–157 102–102 128–128 130–134 158–166 183–185 174–180 154–154 100–100
CUM106 Bolivia 1994 204–206 147–159 100–100 129–131 102–102 128–128 124–128 164–164 185–189 174–174 152–154 100–100
CUM107 Bolivia 1994 202–202 149–149 092–092 121–121 106–106 120–120 118–120 156–156 189–189 170–170 144–144 090–090
CUM31 Bolivia 1994 206–206 149–159 126–126 135–137 102–102 116–128 122134 162–172 187189 168–174 154–154 102–108
CUM38 Bolivia 1994 202–204 149–149 098–104 129–135 102–102 130–130 114134 160–160 185–185 168–168 154–154 102–102
CUM41 Bolivia 1994 202–202 149–149 114–120 131–131 102–102 118–128 126–130 160–160 185187 168–172 154–154 100–102
CUM50 Bolivia 1994 206–206 149–159 100–110 129–147 102–102 116–128 122–124 164–164 185–187 174–174 154–154 100–102
CUM52 Bolivia 1994 206–206 149–149 100–110 129–147 102–102 116–128 122–124 164–164 185–187 174–174 154–154 100–102
CUM53 Bolivia 1994 206–206 149–149 112–112 129–147 104–104 116–116 122–132 164–170 185–189 174–174 154–154 098–104
CUM55 Bolivia 1994 206–206 149–149 126–126 137–137 102–102 128–130 114–130 158–170 187–189 162–168 154–154 098–102
CUM59 Bolivia 1994 206–206 149–159 124–124 129–129 102–102 136–136 122–134 162–174 187–189 168–174 154–154 102–108
CUM65 Bolivia 1994 202–202 149–159 114–114 129–137 102–102 116–128 122–130 164–164 179–185 174–174 154–154 102–102
CUM67 Bolivia 1994 208–208 149–149 088–108 149–155 102–106 128–128 122–130 160–166 187–193 176–178 150–156 100–108
CUM68 Bolivia 1994 202–206 151–151 128–128 129–129 102–108 128–128 122–130 164–168 187–189 168–174 152–154 102–102
CUM82 Bolivia 1994 202–206 149–149 098–112 131–131 100–102 136–136 124–132 164–164 179–189 180–180 154–154 098–100
CUM84 Bolivia 1994 206–206 149–149 096–096 131–131 100–100 116–130 130–130 158–166 181–189 174–174 152–152 100–100
CUM97 Bolivia 1994 206–206 149–159 100–110 129–147 102–102 116–128 122–124 164–164 185–187 174–174 154–154 100–102
CUM96 Bolivia 1994 204–204 149–161 084–098 129–137 102–102 128–128 130–130 162–172 191–193 168–182 154–154 100–102
CUM99 Bolivia 1994 204–204 149–159 088–088 121–121 102–102 122–122 132–132 176–176 185–191 162–162 150–156 098–098
CUM32 Bolivia 1994 204–204 147–161 124–124 129–147 102–102 118–130 120–134 164–172 189–189 168–174 152–152 100–106
CUM46 Bolivia 1994 202–202 149–149 118–118 127–127 102–102 136–136 120–128 152–152 185–187 168–182 154–154 100–100
CUM30 Bolivia 1994 200–200 149–149 090–090 129–131 104–104 122–122 114–130 164–164 179–179 170–170 150–150 096–096
CUM24 Bolivia 1994 204–204 149–149 110–110 129–129 102–102 132–132 124–134 158–164 189–189 174–174 166–166 102–102
CUM42 Bolivia 1994 204–204 149–159 098–110 129–147 100–100 116–128 124–124 164–164 183–183 174–174 152–154 100–100
CUM26 Bolivia 1994 202–204 151–151 118–118 129–137 102–102 116–116 120–132 164–164 183–183 174–180 152–152 102–102
CUM39 Bolivia 1994 204–204 151–151 098–110 135–137 100–100 116–128 120–122 164–164 189–189 172–172 152–152 098–102
CH22B Bolivia 1994 204–204 149–159 118–118 129–129 102–102 128–128 120–128 162–162 185–187 168–182 154–154 102–102
CUM49 Bolivia 1994 206–206 151–151 122–122 129–129 102–102 130–130 122–124 164–164 185–187 174–174 154–154 100–102
CUM51 Bolivia 1994 202–204 151–161 098–118 135–137 102–102 116–130 132–134 162–162 187–191 168–174 152–154 100–102
CUM251 Bolivia 1998 200–200 149–149 092–092 143–143 102–102 122–122 128–128 166–166 189–189 172–172 152–152 096–096
CUM252 Bolivia 1998 200–200 153–153 116–116 141–141 106–106 122–122 128–128 166–166 183–183 170–172 152–152 096–096
CUM263 Bolivia 1998 204–204 161–161 100–116 131–147 102–102 116–130 122–122 162–162 185–185 176–182 154–154 100–100
CUM266 Bolivia 1998 200–200 149–149 116–116 145–145 106–106 122–122 116–130 164–164 183–189 168–172 152–152 098–098
CUM271 Bolivia 1998 200–200 153–153 098–118 143–143 106–106 122–122 116–128 164–164 181–181 166–170 152–152 096–096
CUM274 Bolivia 1998 200–200 153–157 098–108 139–139 106–106 122–122 116–118 164–164 183–183 170–172 152–152 096–096
CUM275 Bolivia 1998 200–200 151–151 092–092 143–143 106–106 122–122 120–120 164–164 181–181 170–172 152–152 096–096
CUM276 Bolivia 1998 200–200 151–151 092–092 143–143 106–106 122–122 116–130 164–164 183–183 172–172 152–152 096–096
CUM277 Bolivia 1998 204–206 151–151 100–110 131–147 102–102 130–130 116–126 162–162 185–185 168–174 154–154 100–100
CUM279 Bolivia 1998 200–200 151–161 094–094 145–145 100–102 122–122 116–128 164–164 183–183 170–172 152–152 096–096
CUM280 Bolivia 1998 200–200 151–151 092–092 145–145 106–106 122–122 128–128 164–164 183–183 174–174 154–154 096–096
CUM281 Bolivia 1998 200–200 149–149 092–116 145–145 106–106 124–124 132–132 164–164 181–181 187–189 150–150 096–096
CUM282 Bolivia 1998 200–200 149–159 090–090 139–139 106–106 122–122 130–130 164–164 181–181 180–180 152–152 100–100
CUM285 Bolivia 1998 200–200 151–151 092–092 139–149 106–106 122–122 130–130 164–164 183–183 170–170 152–152 096–096
CUM286 Bolivia 1998 200–200 151–151 092–092 141–149 106–106 122–122 130–130 164–164 183–183 170–170 152–152 100–100
CUM288 Bolivia 1998 200–200 149–149 092–092 139–139 106–106 122–122 120–120 164–164 183–183 172–172 152–152 096–096
CUM289 Bolivia 1998 200–200 161–161 092–092 141–149 102–102 122–122 130–130 166–166 183–189 170–170 152–152 098–098
CUM290 Bolivia 1998 200–200 149–159 092–092 145–145 106–106 122–122 118–128 166–166 183–183 172–172 152–152 096–096
CUM291 Bolivia 1998 200–200 149–159 092–092 145–145 106–106 116–130 132–132 164–164 187–187 170–170 152–152 096–096
CUM294 Bolivia 1998 202–202 149–149 088–088 147–147 102–102 122–122 130–130 174–174 189–189 164–164 150–150 094–094
CUM295 Bolivia 1998 202–202 151–151 088–088 131–131 102–102 122–122 132–132 164–164 191–191 164–164 152–152 096–096
CUM310 Bolivia 1998 202–202 151–151 112–112 129–147 102–102 116–130 124–132 162–162 185–189 174–180 154–156 102–102
CUM311 Bolivia 1998 200–200 149–149 100–108 131–131 102–102 116–128 132–132 162–162 189–189 174–174 152–152 098–100
CUM323 Bolivia 1998 206–208 159–159 100–110 131–137 102–102 130–130 124–130 164–164 187–187 174–182 154–154 098–102
CUM324 Bolivia 1998 206–206 161–161 098–098 131–137 100–100 128–128 132–132 166–168 185–185 174–182 154–154 096–096
CUM327 Bolivia 1998 204–204 151–161 104–108 137–137 102–102 128–128 132–132 162–162 181–181 178–180 150–152 102–102
CUM329 Bolivia 1998 204–204 149–149 116–116 145–145 102–102 116–130 124–128 162–162 185–185 174–180 154–154 100–102
CUM331 Bolivia 1998 200–200 149–149 098–112 145–145 106–106 122–122 116–130 164–164 181–189 170–170 152–152 096–096
CUM346 Bolivia 1998 204–204 151–161 104–108 131–137 102–102 130–130 132–132 162–162 185–185 174–180 152–152 098–098
CUM381 Bolivia 1998 200–200 149–153 100–110 145–145 106–106 122–122 116–118 166–166 183–183 168–168 152–152 096–096
CUM384 Bolivia 1998 198–204 149–159 116–116 129–135 102–102 116–130 122–122 162–162 185–185 174–180 154–154 100–102
CUM388 Bolivia 1998 200–200 149–149 098–110 131–137 100–102 116–116 122–132 162–162 183–183 172–180 150–150 098–098
CUM389 Bolivia 1998 204–212 151–151 118–118 131–137 102–102 116–116 122–132 162–162 183–183 172–180 152–152 098–098
CUM393 Bolivia 1998 200–200 153–153 098–098 149–149 106–106 128–128 130–130 164–164 185–185 168–172 148–156 100–100
CUM396 Bolivia 1998 200–200 151–153 116–116 143–143 102–102 122–122 116–118 164–164 183–183 170–170 152–152 096–096