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. 2000 Sep 12;97(19):10532–10537. doi: 10.1073/pnas.97.19.10532

Table 2.

Comparison of Trinidad consensus V3 loop sequence to prototypic B

B-subtype CTRPNNNTRK SIHIGPGRAF YTTGEIIGDI RQAHC
RH0011 .......... .......Q.. .−........ .....
QZ2226 .........R ..P.....V. .−........ .....
QZ2269 .......... .V.....K.. .−........ .....
QZ2291 .......... ...L...A.. F−........ .....
QZ2313 .......... G.P....SV. .−........ .....
QZ2432 .......... G......G.. .T..D..... .K...
QZ2551 .I........ ........T. .−........ .....
QZ2704 .......... .......SV. .−........ .....
QZ4734 .......... ..N....... .−........ .....
QZ6698 ....S....R ...F...A.. .−........ .....
QH0016 .......... .....A.K.L .−........ .....
QH0020 .......... ..P....SV. .−........ .....
QH0060 .........R ...M...KV. .−........ .....
QH0065 .......... G.T....SV. .−........ .....
QH0132 .........R G..M...K.Y F−........ .....
QH0136 .........R D.T.....V. .−........ .....
QH0515 .......... ....EA.K.L .−........ .....
QH0550 .........R D.A....KV. .−......N. .....
QH0605 .......... G......KV. C−....V... .....
QH0679 .......... .......... .A......N. .....
QH0692 ....G..... .......... .A..D..... .....
QH0705 .......... ...L.A...L .−........ .....
QH0788 .........E ..N....... .Y........ .....
QH0791 .......... G.T.....VS .−....V... ..V..
QH0850 .......... ...L.A.K.L .−........ .....
QH0864 .........R ...M...K.L F−........ .....
QH0865 .......... ..P....... .A......N. .....
QH0908 .........R GVT.....V. .−...VT... .....
QH0944 .I........ .......... .−..D..... .....
QH1116 .......... ...M.....L .−........ .....
QH1420 .......... ...L.A...L .−........ .....
Trinidad consensus .......... .......... .−........ .....

Trinidad samples are order chronologically from top to bottom. Deletions are represented by −.