Skip to main content
. 2009 Jul 20;10:326. doi: 10.1186/1471-2164-10-326

Table 3.

The Pearson's correlations and standard deviations for intra-method and inter-method comparisons for the unfiltered gene set (17,001 genes).

Unamp A Unamp A
Unamp B 0.59 Unamp B
Unamp C 0.56 0.73 Unam p C
Mod T7 D 0.36 0.30 0.30 Mod T7 D*
Mod T7 E 0.25 0.17 0.14 0.46 Mod T7 E
Mod T7 F 0.36 0.30 0.29 0.60 0.41 Mod T7 F
Mod T7 G 0.37 0.30 0.28 0.60 0.40 0.65 Mod T7 G
Mod T7 H 0.30 0.21 0.21 0.50 0.37 0.51 0.54 Mod T7 H
Mod T7 I 0.38 0.32 0.28 0.58 0.38 0.63 0.66 0.50 Mod T7 I
Arcturus J 0.32 0.30 0.26 0.60 0.40 0.57 0.58 0.46 0.60 Arcturus J
Arcturus K 0.30 0.24 0.21 0.52 0.37 0.48 0.47 0.40 0.48 0.56 Arcturus K
Arcturus L 0.24 0.16 0.14 0.39 0.33 0.40 0.39 0.35 0.37 0.40 0.38 Arcturus L
Arcturus M 0.36 0.27 0.26 0.67 0.46 0.60 0.60 0.50 0.57 0.61 0.57 0.49 Arcturus M
Bal PCR N 0.29 0.20 0.19 0.42 0.29 0.35 0.37 0.31 0.38 0.37 0.37 0.41 0.36 Bal PCR N
Bal PCR O 0.27 0.18 0.17 0.37 0.26 0.30 0.30 0.30 0.31 0.30 0.29 0.28 0.38 0.49 Bal PCR O
Bal PCR P 0.33 0.25 0.22 0.48 0.31 0.39 0.38 0.34 0.38 0.36 0.39 0.34 0.50 0.56 0.49 Bal PCR P
Bal PCR Q 0.25 0.11 0.10 0.36 0.27 0.27 0.28 0.28 0.27 0.27 0.29 0.31 0.40 0.49 0.50 0.53
Intramethod Intermethod Mean R2
Mean R2 SD Range Unamp SD Mod T7 SD Arcturus SD Bal PCR SD
Unamp 0.63 0.07 0.56–0.73 0.28 0.07 0. 26 0.06 0.21 0.07
Mod T7 0.52 0.10 0.14–0.66 0.28 0.07 0.48 0.10 0.33 0.05
Arcturus 0.50 0.09 0.14–0.61 0.26 0.06 0.48 0.10 0.35 0.06
Bal PCR 0.51 0.03 0.10–0.56 0.21 0.07 0.33 0.05 0.35 0.06