Table 2.
SEQ32_ID | PRO-MOTER | START | END |
HMM_ SCORE |
SEQ32:bold italics locates optimal HMM instance |
CT046_117 | 0 | 4 | * 32 | -5.9 | TAATTGTGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGT |
CT046_116 | 0 | 3 | 31 | -5.9 | AATTGTGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTT |
CT046_115 | 0 | 2 | 30 | -5.9 | ATTGTGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTA |
CT046_114 | 0 | 1 | 29 | -5.9 | TTGTGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAA |
CT046_113 | 0 | 2 | 29 | -13.7 | TGTGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAA |
CT046_112 | 0 | 1 | * 32 | -11.4 | GTGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAA |
CT046_111 | 1 | 5 | * 32 | -2.1 | TGTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAA |
CT046_110 | 1 | 4 | 31 | -2.1 | GTGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAAC |
CT046_109 | 1 | 3 | 30 | -2.1 | TGTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACT |
CT046_108 | 1 | 2 | 29 | -2.1 | GTGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTA |
CT046_107 | 1 | 1 | 28 | -2.1 | TGGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAA |
CT046_106 | 0 | 3 | 31 | -11.9 | GGTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAAC |
CT046_105 | 0 | 2 | 30 | -11.9 | GTTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAACC |
CT046_104 | 0 | 1 | * 32 | -7.6 | TTAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAACCA |
CT046_103 | 0 | 4 | * 32 | -7.8 | TAGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAACCAT |
CT046_102 | 0 | 3 | 31 | -7.8 | AGTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAACCATT |
CT046_101 | 0 | 2 | 30 | -7.8 | GTTTTTAATAAAAAGTTAAAAACTAACCATTT |