TABLE 4.
PFGE characterization of E. coli O157:H7 isolates from PS and TS animals collected ante- and postmortem
| PFGE subtype | No. of band differences from subtype F | PS
|
TS
|
||
|---|---|---|---|---|---|
| No. of isolates collected antemortem (no. of isolates collected postmortem) | No. of animals | No. of isolates collected antemortem (no. of isolates collected postmortem) | No. of animals | ||
| A | 3 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| B | 4 | 0 (0) | 0 | 0 (1) | 1 |
| C | 4 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| D | 2 | 0 (3) | 1 | 0 (0) | 0 |
| E | 1 | 0 (2) | 1 | 1 (0) | 1 |
| F | 40 (0) | 8 | 24 (6) | 11 | |
| G | 3 | 0 (5) | 2 | 0 (0) | 0 |
| H | 3 | 2 (0) | 2 | 3 (0) | 3 |
| I | 2 | 8 (0) | 3 | 2 (0) | 1 |
| J | 4 | 0 (4) | 2 | 0 (0) | 0 |
| K | 1 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| L | 1 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| M | 1 | 0 (0) | 0 | 2 (0) | 1 |
| N | 6 | 1 (0) | 1 | 1 (0) | 1 |
| O | 4 | 0 (0) | 0 | 0 (1) | 1 |
| P | 1 | 3 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| Q | 2 | 0 (0) | 0 | 1 (0) | 1 |
| R | 3 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| S | 2 | 0 (0) | 0 | 3 (0) | 1 |
| T | 1 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| U | 1 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| V | 2 | 0 (0) | 0 | 1 (0) | 1 |
| W | 1 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| X | 3 | 0 (0) | 0 | 0 (1) | 1 |
| Y | 1 | 0 (0) | 0 | 1 (0) | 1 |
| Z | 4 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| AA | >7 | 2 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| AB | >7 | 1 (0) | 1 | 0 (0) | 0 |
| AC | >7 | 0 (1) | 1 | 0 (0) | 0 |
| AD | >7 | 0 (0) | 0 | 0 (1) | 1 |
| AE | 3 | 0 (1) | 1 | 0 (0) | 0 |
| AF | >7 | 0 (0) | 0 | 0 (1) | 1 |
| Total | 66 (16) | 39 (11) | |||