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. Author manuscript; available in PMC: 2009 Sep 30.
Published in final edited form as: J Mol Biol. 2007 May 4;370(1):157–169. doi: 10.1016/j.jmb.2007.04.049

Table 3.

Strand specificity of Eco31I variants on different plasmid substrates.

R264D D311A N334D/K337A D345A
pUC19 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN5↑ 5′-GGTCTCN5↑ 5′-GGTCTCN5↑
pUC19S 5′-GGTCTCN↓ not cleaved 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN5↑
pUC-A 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN↓
pUC-B 5′-GGTCTCN↓ no nick 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN↓
pUC-C 5′-GGTCTCN↓ no nick 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN↓
pUC-D 5′-GGTCTCN↓ not cleaved no nick no nick
pUC-E 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN5↑ 5′-GGTCTCN5↑ 5′-GGTCTCN5↑
pUC-F 5′-GGTCTCN1, 12↓ not cleaved 5′-GGTCTCN↓ 5′-GGTCTCN↓