Table 1.
Frequency and distribution of different SSR types in the 8,577 cassava unigene set.
| SSR motif | Number of repeat units | Total | |||||||||||
| 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | ≥16 | ||
| AC | - | 3 | 1 | 2 | 1 | 7 | |||||||
| AG | - | 7 | 50 | 20 | 12 | 7 | 8 | 4 | 1 | 3 | 1 | 1 | 114 |
| AT | - | 14 | 83 | 32 | 22 | 13 | 11 | 1 | 4 | 2 | 2 | 11 | 195 |
| CG | - | 9 | 9 | ||||||||||
| CT | - | 23 | 66 | 46 | 15 | 21 | 12 | 14 | 8 | 5 | 7 | 5 | 222 |
| GT | - | 4 | 10 | 6 | 4 | 2 | 1 | 27 | |||||
| AAC | 1 | 1 | |||||||||||
| AAG | 7 | 5 | 21 | 7 | 4 | 2 | 2 | 1 | 49 | ||||
| AAT | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 12 | ||||||
| ACC | 1 | 2 | 4 | 1 | 2 | 1 | 11 | ||||||
| ACG | 0 | ||||||||||||
| ACT | 0 | ||||||||||||
| AGC | 6 | 5 | 6 | 1 | 1 | 19 | |||||||
| AGG | 3 | 1 | 3 | 7 | |||||||||
| AGT | 0 | ||||||||||||
| ATC | 4 | 3 | 3 | 7 | 1 | 18 | |||||||
| ATG | 4 | 2 | 8 | 4 | 1 | 1 | 1 | 21 | |||||
| ATT | 11 | 3 | 11 | 1 | 5 | 1 | 32 | ||||||
| CCG | 1 | 2 | 1 | 4 | |||||||||
| CCT | 1 | 1 | 2 | 5 | 1 | 10 | |||||||
| CGG | 2 | 2 | |||||||||||
| CGT | 0 | ||||||||||||
| CTG | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 9 | |||||||
| CTT | 8 | 6 | 15 | 3 | 10 | 2 | 1 | 45 | |||||
| GGT | 3 | 1 | 6 | 3 | 13 | ||||||||
| GTT | 1 | 1 | |||||||||||
| AAAG | 2 | 2 | |||||||||||
| TTAT | 1 | 1 | |||||||||||
| TTTC | 1 | 1 | |||||||||||
| TCTT | 1 | 1 | |||||||||||
| AAAGA | 1 | 1 | 2 | ||||||||||
| TTTTG | 1 | 1 | |||||||||||
| 836 | |||||||||||||