Skip to main content
. Author manuscript; available in PMC: 2009 Oct 8.
Published in final edited form as: Clin Pharmacol Ther. 2008 Apr 16;84(3):393–402. doi: 10.1038/clpt.2008.63

Table 5.

Associations between the principal components and polymorphisms. The table shows the p values and Bayes factors, respectively, separated by a “/.” P values < 5% and Bayes factors > 3.2 are shown in boldface.

Polymorphism PC1 PC2 PC3 PC4 PC5 PC6 PC7 PC8 PC9
UGT1A1, −53A(TA)6>7TAA, PROMOTER 0.086 / 0.5 0.301 / 0.2 0.007 / 4.9 0.019 / 1.8 0.216 / 0.2 0.009 / 3.4 0.314 / 0.2 0.204 / 0.2 0.123 / 0.4
UGT1A1, −3279G>T (UGT1A1*60), PBREM 0.021 / 1.7 0.056 / 0.7 0.043 / 0.9 0.027 / 1.3 0.588 / 0.1 0.001 / 24.8 0.482 / 0.1 0.527 / 0.1 0.046 / 0.8
UGT1A1, −3156G>A, PBREM 0.008 / 4.2 0.136 / 0.3 0.014 / 2.6 0.017 / 2.0 0.322 / 0.2 0.005 / 6.7 0.031 / 1.1 0.268 / 0.2 0.083 / 0.5
UGT1A7, 387G>T (N129K), EXON 1 0.007 / 4.6 0.139 / 0.3 0.001 / 26.7 0.050 / 0.8 0.050 / 0.8 0.103 / 0.4 0.116 / 0.4 0.186 / 0.3 0.114 / 0.4
UGT1A7, 622T>C (W208R), EXON 1 0.000 / 77.5 0.392 / 0.2 0.002 / 17.3 0.019 / 1.8 0.332 / 0.2 0.003 / 11.2 0.289 / 0.2 0.055 / 0.7 0.270 / 0.2
UGT1A9, −118(T)9>10, UGT1A9*1b, PROMOTER 0.003 / 12.3 0.258 / 0.2 0.001 / 36.4 0.017 / 2.0 0.054 / 0.7 0.025 / 1.4 0.067 / 0.6 0.279 / 0.2 0.066 / 0.6
UGT1A9, −2152C>T, PROMOTER 0.809 / 0.1 0.453 / 0.1 0.293 / 0.2 0.703 / 0.1 0.328 / 0.2 0.473 / 0.1 0.615 / 0.1 0.238 / 0.2 0.784 / 0.1
UGT1A9, −275T>A, PROMOTER 0.632 / 0.1 0.217 / 0.2 0.297 / 0.2 0.764 / 0.1 0.148 / 0.3 0.583 / 0.1 0.527 / 0.1 0.245 / 0.2 0.944 / 0.1
HNF-1α, 79A>C (I27L), EXON 1 0.625 / 0.1 0.001 / 37.3 0.154 / 0.3 0.434 / 0.1 0.527 / 0.1 0.423 / 0.2 0.517 / 0.1 0.366 / 0.2 0.213 / 0.2
CYP3A4, −392A>G, CYP3A4*1B, 5’-UTR 0.414 / 0.2 0.556 / 0.1 0.337 / 1.2 0.967 / 0.4 0.721 / 0.1 0.323 / 0.2 0.772 / 0.2 0.487 / 0.3 0.923 / 0.1
CYP3A5, 6986A>G, CYP3A5*3, INTRON 3 0.861 / 0.4 0.179 / 0.9 0.255 / 0.5 0.489 / 0.1 0.124 / 0.4 0.704 / 0.1 0.536 / 0.1 0.822 / 0.1 0.443 / 0.1
SLCO1B1, 388A>G (N130D), SLCO1B1*1b, EXON 4 0.079 / 0.5 0.106 / 0.4 0.023 / 1.6 0.097 / 0.4 0.580 / 0.1 0.379 / 0.2 0.317 / 0.2 0.038 / 1.0 0.269 / 0.2
SLCO1B1, 521T>C (V174A), SLCO1B1*15, EXON 5 0.878 / 0.1 0.614 / 0.6 0.600 / 0.1 0.433 / 0.2 0.751 / 0.2 0.159 / 0.5 0.942 / 0.1 0.145 / 0.3 0.066 / 0.6
ABCC2, −1549A>G, 5’-Flanking region 0.383 / 0.2 0.001 / 47.4 0.301 / 0.2 0.308 / 0.2 0.171 / 0.3 0.749 / 0.1 0.705 / 0.1 0.253 / 0.2 0.643 / 0.1
ABCC2, −1019A>G, 5’-Flanking region 0.583 / 0.1 0.002 / 15.4 0.254 / 0.2 0.249 / 0.2 0.398 / 0.2 0.732 / 0.1 0.681 / 0.1 0.226 / 0.2 0.809 / 0.1
ABCC2, −24C>T, 5’-UTR 0.985 / 0.1 0.013 / 2.7 0.575 / 0.2 0.950 / 1.1 0.054 / 0.9 0.221 / 0.7 0.402 / 0.2 0.641 / 0.1 0.366 / 0.6
ABCC2, 1249G>A (V417I), EXON 10 0.443 / 0.1 0.045 / 0.9 0.934 / 0.1 0.358 / 0.2 0.521 / 0.1 0.329 / 0.2 0.495 / 0.1 0.002 / 14.9 0.706 / 0.1
ABCC2, −34T>C, INTRON 26 0.469 / 0.1 0.258 / 0.2 0.963 / 0.1 0.167 / 0.3 0.639 / 0.1 0.829 / 0.1 0.049 / 0.8 0.734 / 0.1 0.345 / 0.2
ABCC2, 3972C>T (I1324I), EXON 28 0.250 / 0.2 0.011 / 3.1 0.224 / 0.2 0.103 / 0.4 0.013 / 2.5 0.144 / 0.3 0.175 / 0.3 0.200 / 0.3 0.149 / 0.3
ABCC1, 1062T>C (N354N), EXON 9 0.136 / 0.3 0.179 / 0.3 0.221 / 0.2 0.120 / 0.4 0.139 / 0.3 0.684 / 0.1 0.013 / 2.3 0.228 / 0.2 0.082 / 0.5
ABCC1, −48C>T, INTRON 11 0.302 / 0.2 0.187 / 0.3 0.840 / 0.2 0.175 / 0.3 0.105 / 0.4 0.748 / 0.5 0.577 / 0.2 0.642 / 0.1 0.084 / 0.6
ABCC1, 1684T>C (L562L), EXON 13 0.405 / 0.2 0.018 / 2.0 0.414 / 0.2 0.098 / 0.4 0.579 / 0.1 0.436 / 0.1 0.805 / 0.1 0.037 / 1.0 0.233 / 0.2
ABCC1, −30C>G, INTRON 18 0.188 / 0.3 0.004 / 8.0 0.362 / 0.2 0.155 / 0.3 0.879 / 0.1 0.620 / 0.1 0.526 / 0.1 0.061 / 0.6 0.177 / 0.3
ABCC1, 4002G>A (S1334S), EXON 28 0.001 / 29.4 0.022 / 1.7 0.300 / 0.2 0.195 / 0.3 0.416 / 0.2 0.096 / 0.4 0.184 / 0.3 0.064 / 0.6 0.072 / 0.6
ABCC1, +18A>G, INTRON 30 0.023 / 1.6 0.198 / 0.3 0.424 / 0.2 0.825 / 0.1 0.365 / 0.2 0.296 / 0.2 0.217 / 0.2 0.403 / 0.2 0.236 / 0.2
ABCB1, −129T>C, 5’-UTR 0.559 / 0.5 0.811 / 0.1 0.610 / 0.3 0.977 / 0.2 0.725 / 0.9 0.807 / 0.4 0.163 / 0.3 0.177 / 0.3 0.009 / 3.5
ABCB1, −25G>T, INTRON 4 0.229 / 0.3 0.774 / 0.1 0.832 / 0.5 0.826 / 1.1 0.635 / 0.1 0.877 / 0.2 0.368 / 0.2 0.661 / 0.1 0.832 / 0.1
ABCB1, −44A>G, INTRON 9 0.147 / 0.3 0.605 / 0.1 0.618 / 0.1 0.570 / 0.1 0.109 / 0.4 0.156 / 0.3 0.096 / 0.4 0.338 / 0.2 0.051 / 0.8
ABCB1, 1236C>T (G412G), EXON 12 0.182 / 0.3 0.437 / 0.1 0.382 / 0.2 0.482 / 0.1 0.090 / 0.5 0.280 / 0.2 0.106 / 0.4 0.376 / 0.2 0.153 / 0.3
ABCB1, +24C>T, INTRON 13 0.725 / 0.1 0.439 / 0.1 0.491 / 0.1 0.540 / 0.1 0.532 / 0.1 0.076 / 0.5 0.100 / 0.4 0.306 / 0.2 0.016 / 2.1
ABCB1, +38A>G, INTRON 14 0.627 / 0.1 0.538 / 0.1 0.669 / 0.1 0.540 / 0.1 0.532 / 0.1 0.054 / 0.7 0.100 / 0.4 0.306 / 0.2 0.033 / 1.1
ABCB1, 2677G>A/T (A893T/S), EXON 21 0.302 / 0.2 0.543 / 0.1 0.491 / 0.1 0.962 / 0.1 0.943 / 0.1 0.309 / 0.2 0.210 / 0.2 0.890 / 0.1 0.004 / 6.9
ABCB1, 3435C>T (I1145I), EXON 26 0.319 / 0.2 0.441 / 0.1 0.531 / 0.1 0.631 / 0.1 0.664 / 0.1 0.644 / 0.1 0.402 / 0.2 0.226 / 0.2 0.013 / 2.5
ABCG2, 34G>A (V12M), EXON 2 0.479 / 0.1 0.828 / 0.1 0.139 / 0.3 0.348 / 0.2 0.588 / 0.2 0.673 / 0.1 0.087 / 0.5 0.219 / 0.2 0.780 / 0.1
ABCG2, 421C>A (Q141K), EXON 5 0.565 / 0.1 0.397 / 0.2 0.421 / 0.2 0.435 / 0.1 0.628 / 0.1 0.256 / 0.2 0.708 / 0.1 0.533 / 0.1 0.787 / 0.1
CES2, −363C>G, 5’-UTR 0.999 / 2.3 0.546 / 0.2 0.028 / 1.9 0.899 / 0.1 0.379 / 0.6 0.922 / 0.1 0.586 / 0.1
CES2, +1361A>G, INTRON 1 0.381 / 1.0 0.549 / 0.2 0.616 / 0.8 0.629 / 0.1 0.275 / 0.3 0.260 / 0.2 0.352 / 0.2
Split to SN-38 & SN-38 to Bile to Gut to SN-38 IRN Compartments SN-38 to SN-38G & SN-38G Elimination Split to APC from IRN Central Compartment APC Elimination EHR SN-38 recirculation w/o EHR SN-38 Elimination IRN Elimination