Table 2.
Subjects, arranged per species | V1a | V2 | V3 | V4 | R1 | R2 | R3 | R4 | V = Rc | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Lactobacillus crispatus | ||||||||||
1 | RVS003 | Bb | A | C | A | 1 | ||||
2 | RVS011 | A | A | A | 2 | |||||
3 | RVS013 | A | B | A | 3 | |||||
4 | RVS020 | A | B | C | ||||||
5 | RVS023 | A | B | C | ||||||
6 | RVS028 | A | B | C | D | |||||
7 | RVS043 | A | A | 4 | ||||||
8 | RVS061 | A | A | A | A | A | 5 | |||
9 | RVS069 | B | A | C | A | A | 6 | |||
10 | RVS099 | B | A | A | 7 | |||||
Lactobacillus jensenii | ||||||||||
11 | RVS015 | B | C | D | A | A | 8 | |||
12 | RVS019 | B | A | C | A | D | E | |||
13 | RVS022 | A | A | B | A | A | 9 | |||
14 | RVS023 | A | B | |||||||
15 | RVS038 | A | B | C | ||||||
16 | RVS040 | A | B | C | ||||||
17 | RVS057 | B | C | A | A | D | ||||
18 | RVS058 | A | A | A | B | |||||
19 | RVS080 | A | B | A | B | 10 | ||||
20 | RVS092 | A | A | 11 | ||||||
21 | RVS093 | A | A | A | A | 12 | ||||
22 | RVS097 | C | A | B | A | A | 13 | |||
23 | RVS111 | A | A | A | 14 | |||||
24 | RVS113 | A | B | |||||||
Lactobacillus gasseri | ||||||||||
25 | RVS024 | A | A | A | A | 15 | ||||
26 | RVS025 | B | A | A | C | |||||
27 | RVS031 | A | A | B | C | |||||
28 | RVS035 | A | A | A | 16 | |||||
29 | RVS044 | A | A | 17 | ||||||
30 | RVS051 | A | A | A | 18 | |||||
31 | RVS054 | A | A | 19 | ||||||
32 | RVS060 | A | A | 20 | ||||||
33 | RVS072 | A | A | 21 | ||||||
34 | RVS084 | B | A | A | 22 | |||||
35 | RVS090 | A | A | A | A | 23 | ||||
36 | RVS091 | A | A | A | B | 24 | ||||
37 | RVS095 | B | A | A | A | 25 | ||||
38 | RVS109 | A | B | A | 26 | |||||
39 | RVS110 | A | A | B | B | B | A | 27 | ||
40 | RVS136 | A | A | A | A | A | 28 | |||
Streptococcus anginosus | ||||||||||
41 | RVS003 | A | B | |||||||
42 | RVS058 | A | A | B | 29 | |||||
43 | RVS068 | A | A | A | 30 | |||||
Streptococcus agalactiae | ||||||||||
44 | RVS027 | B | A | A | A | 31 | ||||
45 | RVS064 | A | A | A | A | A | 32 | |||
46 | RVS076 | A | B | C | D | |||||
Enterococcus faecalis | ||||||||||
47 | RVS086 | A | A | A | A | A | A | A | A | 33 |
48 | RVS122 | B | A | A | ||||||
Streptococcus salivarius | ||||||||||
49 | RVS075 | A | B | |||||||
Bifidobacterium bifidum | ||||||||||
50 | RVS033 | A | A | A | 34 |
a: V: vaginal isolates 1-4, R: rectal isolates 1-4.
b: Different genotypes are designated A, B, C, D or E per subject. Genotypic similarity/difference only relates to the other isolates of the same subject, i.e. genotype A of subject 1 does not indicate similarity to genotype A of subject 2.
c: Women for which the genotype of at least one vaginal isolate was identical to that of at least one rectal isolate.