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. Author manuscript; available in PMC: 2009 Nov 2.
Published in final edited form as: Ann N Y Acad Sci. 2009 Mar;1158:205–214. doi: 10.1111/j.1749-6632.2008.03758.x

Table 1.

Positive training set. List of verified BCL6 targets from the literature with sources. In these studies, BCL6 regulation was supported by a variety of targeted experiments, including direct binding assays and functional perturbations.

NCBI GeneID Gene Name (HGNC) Reference
399 RHOH Polo et al
533 ATP6V0B Polo et al
545 ATR Ranuncolo et al
598 BLC2L1 Transfac
890 CCNA2 Hosokawa et al
894 CCND2 Shaffer et al
941 CD80 Niu et al
952 CD38 Polo et al
963 CD53 Polo et al
969 CD69 Shaffer et al
972 CD74 Polo et al
991 CDC20 Polo et al
1026 CDKN1A Phan et al
1027 CDKN1B Shaffer et al
1111 CHEK1 Polo et al
1161 ERCC8 Polo et al
1642 DDB1 Polo et al
1880 EBI2 Shaffer et al
2208 FCER2 Polo et al
3398 ID2 Shaffer et al
3487 IGFBP4 Hosokawa et al
3576 IL8 Toney et al
3606 IL18 Takeda et.al
3627 CXCL10 Shaffer et al
4152 MBD1 Polo et al
4790 NFKB1 Li et al
5134 PDCD2 Baron et al
6348 CCL3 Polo et al
6772 STAT1 Shaffer et al
6773 STAT2 Shaffer et al
6890 TAP1 Polo et al
6897 TARS Polo et al
7009 TEGT Polo et al
7157 TP53 Transfac
7184 HSP90B1 Polo et al
7316 UBC Polo et al
7852 CXCR4 Hosokawa et al
7862 BRPF1 Polo et al
8446 DUSP11 Polo et al
8519 IFITM1 Shaffer et al
8556 CDC14A Polo et al
10370 CITED2 Polo et al
10923 SUB1 Polo et al
10983 CCNI Polo et al
23522 MYST4 Polo et al
25816 TNFAIP8 Polo et al
25963 TMEM87A Polo et al
27095 TRAPPC3 Polo et al
54499 TMCO1 Polo et al
64116 SLC39A8 Polo et al