TABLE 7.
Results of the Genotype HelicoDR test for strains of Helicobacter species other than H. pylori
Non-pylori Helicobacter species | Hybridization results for the probes present on the DNA stripa |
|||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
HP | gyrA | gyr87 WT1 | gyr87 WT2 | gyr87 WT3 | gyr87 WT4 | gyr87 MUT | gyr91 WT | gyr91 MUT1 | gyr91 MUT2 | gyr91 MUT3 | 23S | 23S WT | 23S MUT1 | 23S MUT2 | 23S MUT3 | |
H. winghamensis | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H. cholecystus | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + |
H. mustelae | − | + | − | − | − | − | − | + | ± | − | − | + | + | − | − | − |
H. cinaedi | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. canadensis | − | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H. fennelliae | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. acinonychis | + | + | + | + | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. hepaticus | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H. canis | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. salomonis | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. pametensis | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. muridarum | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
H. rappini | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ± | + | − | − | − |
H. bizzozeronii | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
H. ganmani | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H. pullorum | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H. felis | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
H. bilis | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H. typhlonius | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
H. cetorum | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
+, positive signal; −, negative signal; ±, weakly positive signal.