Table 4. Genotypes of the six genes of interest in severely and moderately affected dogs.
RPGRIP1 |
RANBP2 |
NPM1 |
PDE6D |
NPHP5 |
ABCA4 |
|
Severely affected |
||||||
H2 |
2,2 |
1,2 |
1,1 |
1,4 |
1,1 |
1,2 |
H64 |
2,5 |
2,1 |
1,2 |
4,4 |
1,2 |
1,2 |
H104 |
1,1 |
3,2 |
2,1 |
5,4 |
2,1 |
4,1 |
H105 |
1,1 |
3,1 |
2,1 |
5,2 |
3,1 |
4,1 |
H78 |
3,1 |
3,1 |
1,1 |
1,1 |
1,1 |
1,1 |
H79 |
3,1 |
3,1 |
1,1 |
1,2 |
2,1 |
1,1 |
H82 |
1,2 |
2,1 |
1,1 |
1,2 |
1,1 |
3,1 |
H143 |
4,1 |
7,1 |
6,1 |
1,1 |
4,1 |
2,3 |
H35 |
3,5 |
5,1 |
4,2 |
2,4 |
2,1 |
5,2 |
H38 |
4,2 |
3,1 |
1,2 |
2,3 |
2,2 |
3,2 |
H71 |
4,2 |
3,2 |
1,1 |
2,2 |
2,1 |
3,1 |
H72 |
2,1 |
2,1 |
2,1 |
3,4 |
2,1 |
3,1 |
H73 |
2,2 |
1,1 |
2,1 |
3,2 |
2,1 |
3,1 |
H118 |
1,4 |
5,2 |
5,1 |
5,2 |
4,2 |
1,3 |
Moderately affected |
||||||
H29 |
3,1 |
2,3 |
1,1 |
1,2 |
2,1 |
3,1 |
H31 |
3,2 |
5,6 |
1,1 |
1,2 |
2,3 |
5,1 |
H130 |
1,2 |
3,4 |
1,1 |
3,3 |
3,1 |
4,2 |
H131 |
4,5 |
3,4 |
1,2 |
5,3 |
3,1 |
1,2 |
H81 |
3,2 |
3,2 |
1,1 |
1,2 |
2,1 |
1,1 |
H208 |
1,1 |
4,2 |
3,1 |
1,2 |
2,1 |
1,2 |
H59 |
3,1 |
2,1 |
1,3 |
1,2 |
1,1 |
3,2 |
H201 |
2,2 |
6,1 |
3,1 |
1,4 |
2,1 |
2,2 |
H202 | 1,2 | 3,4 | 1,2 | 1,3 | 2,1 | 2,2 |
Alleles are numbered from one to seven according to haplotypes shown in Table 3. Genotypes that are present in both severe and moderate phenotypes are in red color.